MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 7448 chromosome

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007332	TAATTT	2	12	7974	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007332	AAGAAA	2	12	32614	32625	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007332	AAAATT	2	12	60386	60397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007332	CAGTGA	2	12	65444	65455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007332	TTTTAA	2	12	114848	114859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007332	CAAGAA	2	12	115308	115319	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007332	TAAATT	2	12	116510	116521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007332	TCATAA	2	12	122152	122163	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007332	ATTTTT	2	12	122662	122673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007332	TAATTT	2	12	125188	125199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007332	TATAAT	2	12	138243	138254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007332	TCTTTA	2	12	139073	139084	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007332	CTTGAT	2	12	139566	139577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007332	TGACTT	2	12	139928	139939	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007332	AGGCAA	2	12	142519	142530	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007332	TTTAAA	2	12	150971	150982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007332	CATATT	2	12	152946	152957	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007332	TTTAAA	2	12	153161	153172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007332	TTTAAT	2	12	154563	154574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007332	TAAAAA	2	12	161211	161222	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007332	TATAAT	2	12	161252	161263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007332	AAAAAC	2	12	163468	163479	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007332	TAAAAA	2	12	163579	163590	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007332	TATAAT	2	12	163619	163630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007332	TAATTT	4	24	166930	166953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007332	ATTTTT	2	12	177623	177634	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007332	ATTATA	2	12	189319	189330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007332	TTATTT	2	12	189332	189343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007332	ATTTAA	2	12	194749	194760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007332	TATTTG	2	12	194922	194933	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007332	AAATTA	2	12	228028	228039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007332	TAAAAA	2	12	242923	242934	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007332	ATTTTT	2	12	242953	242964	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007332	ATTTTT	2	12	243077	243088	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007332	TAAATA	2	12	243241	243252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007332	TGAATA	2	12	257006	257017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007332	AAATAA	2	12	265053	265064	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007332	TTTTAT	2	12	265813	265824	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007332	CATATT	2	12	266922	266933	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007332	AAATAA	2	12	267114	267125	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007332	TTTATA	2	12	267127	267138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007332	TGAATA	2	12	281874	281885	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007332	TTTAAT	2	12	283799	283810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007332	TTTTAA	2	12	287250	287261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007332	TTAAGT	2	12	304255	304266	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007332	TTATAA	2	12	309908	309919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007332	TTATAA	2	12	324333	324344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007332	TATTTT	2	12	328610	328621	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007332	TTTATT	2	12	332044	332055	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007332	ATGAAA	2	12	335112	335123	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007332	AATTTT	2	12	346187	346198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007332	AATTTA	2	12	347685	347696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007332	ATTTAA	2	12	353074	353085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007332	TTGATT	2	12	353232	353243	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007332	CAAAAA	2	12	353679	353690	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007332	ATCAAT	2	12	354428	354439	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007332	ATTTTT	2	12	361822	361833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007332	ATAAAA	2	12	369367	369378	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007332	TGAATA	2	12	396928	396939	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007332	CAAGAA	2	12	401449	401460	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007332	AAAGAT	2	12	401461	401472	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007332	TTATAA	2	12	417388	417399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007332	TCAAGA	2	12	421267	421278	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007332	TATAAA	2	12	426752	426763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007332	AATAAG	2	12	427205	427216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007332	AAATTT	2	12	434576	434587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007332	CAAAAC	2	12	434764	434775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007332	TATAAT	2	12	438553	438564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007332	TAATAT	3	18	474509	474526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007332	ATAAAA	2	12	477667	477678	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007332	AATTTA	2	12	492510	492521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007332	ATTTTT	2	12	492913	492924	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007332	TAAAAA	2	12	492958	492969	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007332	ATTTAA	2	12	501347	501358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007332	TTTTAA	2	12	503673	503684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007332	TTATAT	2	12	514332	514343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007332	TTTTGA	2	12	516750	516761	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007332	TTTTTA	2	12	518332	518343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007332	AAAAAC	2	12	529242	529253	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007332	AAATCT	2	12	531204	531215	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007332	TTTTTG	2	12	532511	532522	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007332	ATTTAT	2	12	534889	534900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007332	AGTTCT	2	12	538850	538861	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007332	GATTTT	2	12	560763	560774	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007332	CAAAAA	2	12	562749	562760	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007332	ATTTGA	2	12	571138	571149	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007332	TTTCAA	2	12	571188	571199	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007332	TTTTTC	2	12	573307	573318	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007332	TGTATT	2	12	583622	583633	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007332	AATCTT	2	12	584243	584254	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007332	AAAGAA	2	12	585037	585048	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007332	ATTTTT	2	12	605114	605125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007332	AAATAA	2	12	640049	640060	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007332	TTTAAA	2	12	641486	641497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007332	CATATT	2	12	647171	647182	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007332	TGAATT	2	12	647387	647398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007332	TAAAAA	2	12	670905	670916	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007332	ATTTTT	2	12	671275	671286	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007332	GTTTTT	2	12	674423	674434	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007332	ATTTTT	2	12	703301	703312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007332	ATATTT	2	12	704150	704161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007332	TTTTGG	2	12	740254	740265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007332	TGAAAA	2	12	741645	741656	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007332	AATTTA	2	12	745510	745521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007332	ATTTAT	4	24	753385	753408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007332	TTTTTA	2	12	760133	760144	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007332	TTAAAA	2	12	765235	765246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007332	AAATAA	2	12	777706	777717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007332	TTTAGG	2	12	807896	807907	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007332	GAAAAA	2	12	809084	809095	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007332	TATAAT	2	12	833790	833801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007332	ATTTAT	2	12	833943	833954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007332	ATTACA	2	12	840684	840695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007332	ATTTTT	2	12	854411	854422	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007332	TTATAA	2	12	854434	854445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007332	CATATT	2	12	856775	856786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007332	TTATAA	2	12	857879	857890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007332	TTATAA	2	12	878469	878480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007332	TTGCTT	2	12	890315	890326	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_007332	TATTAG	2	12	898457	898468	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007332	AGAATA	2	12	901717	901728	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007332	CATATT	2	12	913922	913933	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.