MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 7448 chromosome

Total Repeats: 506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007332	AAAATA	2	12	1592	1603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72080343
2	NC_007332	ATTTTG	2	12	5879	5890	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72080347
3	NC_007332	TAAAAA	2	12	6427	6438	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72080348
4	NC_007332	TCATTT	2	12	6467	6478	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72080348
5	NC_007332	AATTTA	2	12	6591	6602	50 %	50 %	0 %	0 %	72080348
6	NC_007332	GAAAAT	2	12	11551	11562	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	72080352
7	NC_007332	AATCAA	2	12	14545	14556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	72080354
8	NC_007332	ATTAAC	2	12	15031	15042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	72080356
9	NC_007332	TAATTT	2	12	16007	16018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080357
10	NC_007332	CTTTTT	2	12	17450	17461	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	72080359
11	NC_007332	CAAAAA	2	12	19057	19068	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	72080361
12	NC_007332	ATTGAA	2	12	22688	22699	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72080362
13	NC_007332	ATTTCA	2	12	22955	22966	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72080362
14	NC_007332	AATAAG	2	12	24640	24651	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	72080363
15	NC_007332	TTTCAT	2	12	24835	24846	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72080363
16	NC_007332	TTTTCA	2	12	25620	25631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72080363
17	NC_007332	TTAGTT	2	12	30137	30148	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72080366
18	NC_007332	TTTTAA	2	12	30500	30511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080366
19	NC_007332	AATAAA	2	12	30873	30884	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72080366
20	NC_007332	TTGGGT	2	12	33994	34005	0 %	50 %	50 %	0 %	72080370
21	NC_007332	TGGTTT	2	12	34638	34649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080370
22	NC_007332	TTGAAA	2	12	35367	35378	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72080371
23	NC_007332	ATTAAA	2	12	37558	37569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080373
24	NC_007332	TGCAAT	2	12	38290	38301	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080374
25	NC_007332	ATCAAT	2	12	40554	40565	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	72080375
26	NC_007332	TTTTTG	2	12	41406	41417	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	72080375
27	NC_007332	GTTCGA	2	12	42140	42151	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	72080375
28	NC_007332	TTATTT	2	12	42332	42343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	72080375
29	NC_007332	TTAAAA	2	12	43449	43460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080376
30	NC_007332	TGAAGT	2	12	45360	45371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080377
31	NC_007332	ATAAAA	2	12	47260	47271	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72080378
32	NC_007332	TTTTAA	2	12	49227	49238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080379
33	NC_007332	AATAAA	2	12	51817	51828	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72080380
34	NC_007332	TTTTGT	2	12	52952	52963	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	72080381
35	NC_007332	AATTTT	2	12	53713	53724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080382
36	NC_007332	TGAATT	2	12	55558	55569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72080383
37	NC_007332	ATATTG	2	12	57741	57752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72080387
38	NC_007332	ATGATT	2	12	58665	58676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72080387
39	NC_007332	TATAAA	2	12	59273	59284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080388
40	NC_007332	CAAAAA	2	12	59292	59303	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	72080388
41	NC_007332	TAATTT	2	12	59860	59871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080389
42	NC_007332	TAATTT	2	12	60354	60365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080390
43	NC_007332	TAAATC	2	12	60434	60445	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	72080391
44	NC_007332	ATGTTT	2	12	60482	60493	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72080391
45	NC_007332	GGTATT	2	12	65820	65831	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	72080396
46	NC_007332	AGCAAC	2	12	67816	67827	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	72080398
47	NC_007332	GTCGAA	2	12	69612	69623	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	72080399
48	NC_007332	AATTTT	2	12	70604	70615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080400
49	NC_007332	TGTTTT	2	12	70793	70804	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	72080400
50	NC_007332	GAACAA	2	12	78305	78316	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	72080406
51	NC_007332	TTAATT	2	12	79482	79493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080406
52	NC_007332	TAAAAT	2	12	80121	80132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080406
53	NC_007332	AACAAA	2	12	81628	81639	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	72080406
54	NC_007332	AATCAC	2	12	82380	82391	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	72080406
55	NC_007332	CTAATT	2	12	86901	86912	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72080408
56	NC_007332	TTGAAC	2	12	88641	88652	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080409
57	NC_007332	AATTAA	2	12	89502	89513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080409
58	NC_007332	ATCTGA	2	12	89578	89589	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080409
59	NC_007332	TGGTTT	2	12	90169	90180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080410
60	NC_007332	CAAAAT	2	12	91278	91289	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	72080411
61	NC_007332	TTGGTT	2	12	94601	94612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080415
62	NC_007332	GCCCAC	2	12	97316	97327	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	72080417
63	NC_007332	TGCAAG	2	12	98178	98189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	72080417
64	NC_007332	GGAATT	2	12	98224	98235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080417
65	NC_007332	CAAAAA	2	12	100036	100047	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	72080420
66	NC_007332	TTTTGC	2	12	101730	101741	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	72080423
67	NC_007332	CATATG	2	12	101780	101791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080423
68	NC_007332	TTGGTT	2	12	102047	102058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080423
69	NC_007332	TTAGGA	2	12	102292	102303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080423
70	NC_007332	TTCAGG	2	12	104709	104720	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	72080425
71	NC_007332	AATTTT	2	12	105108	105119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080425
72	NC_007332	ATTTTA	2	12	105301	105312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080425
73	NC_007332	ATATTT	2	12	107450	107461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161611231
74	NC_007332	TAGTAA	2	12	111764	111775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72080429
75	NC_007332	AATTTC	2	12	112091	112102	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72080429
76	NC_007332	AATTTA	2	12	112697	112708	50 %	50 %	0 %	0 %	72080430
77	NC_007332	TCCAGA	2	12	117626	117637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	72080433
78	NC_007332	ATTTTT	2	12	119946	119957	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	72080434
79	NC_007332	ACAAAA	2	12	120625	120636	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	72080434
80	NC_007332	AATTTT	2	12	121014	121025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080434
81	NC_007332	AAGGAA	2	12	130413	130424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080441
82	NC_007332	ACCAGA	2	12	130802	130813	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	72080441
83	NC_007332	AGTTCA	2	12	134983	134994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080443
84	NC_007332	ATAATT	2	12	135157	135168	50 %	50 %	0 %	0 %	72080443
85	NC_007332	GCAATT	2	12	142367	142378	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080446
86	NC_007332	ATAATT	2	12	147081	147092	50 %	50 %	0 %	0 %	72080448
87	NC_007332	TTTTAA	2	12	147678	147689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080448
88	NC_007332	TTTTTC	2	12	149213	149224	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	72080449
89	NC_007332	TTTTAT	2	12	151837	151848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	72080450
90	NC_007332	ATTTAA	2	12	155937	155948	50 %	50 %	0 %	0 %	72080452
91	NC_007332	ATTGCA	2	12	156825	156836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080453
92	NC_007332	TATCGT	2	12	157505	157516	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72080453
93	NC_007332	AATGTT	2	12	158749	158760	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72080455
94	NC_007332	TGGAGT	2	12	159665	159676	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	72080456
95	NC_007332	AGATCA	2	12	161537	161548	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	72080457
96	NC_007332	AGATCA	2	12	163904	163915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	72080460
97	NC_007332	GAATCT	2	12	168220	168231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080466
98	NC_007332	TTTTTG	2	12	168375	168386	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	72080466
99	NC_007332	AAATTT	2	12	168875	168886	50 %	50 %	0 %	0 %	72080467
100	NC_007332	TTTTGA	2	12	176661	176672	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72080476
101	NC_007332	AAAGAA	2	12	177400	177411	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	72080476
102	NC_007332	TTGACT	2	12	179151	179162	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72080477
103	NC_007332	TCTTGA	2	12	180055	180066	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72080477
104	NC_007332	AGAAAA	2	12	180697	180708	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	72080477
105	NC_007332	AAAAGT	2	12	181206	181217	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	72080478
106	NC_007332	AAAAAC	2	12	183036	183047	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	72080480
107	NC_007332	AAATTA	2	12	185055	185066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080483
108	NC_007332	ATGTTG	2	12	185197	185208	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	72080483
109	NC_007332	TTATTT	2	12	186434	186445	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	72080484
110	NC_007332	TTGAAA	2	12	187452	187463	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72080486
111	NC_007332	TTTTTA	2	12	188410	188421	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	72080487
112	NC_007332	AATTGA	2	12	188458	188469	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72080487
113	NC_007332	ACTTTA	2	12	189903	189914	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72080488
114	NC_007332	ATTTTT	2	12	193365	193376	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	72080492
115	NC_007332	CAAAAT	2	12	194219	194230	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	72080494
116	NC_007332	AGTTCT	2	12	199106	199117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72080499
117	NC_007332	ATTGGA	2	12	200124	200135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080500
118	NC_007332	TAAAGC	2	12	201133	201144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	72080501
119	NC_007332	ATTTCC	2	12	213694	213705	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	72080521
120	NC_007332	GTTTAT	2	12	214937	214948	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72080524
121	NC_007332	TTCAAC	2	12	214956	214967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72080524
122	NC_007332	TCCACC	2	12	219817	219828	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	72080533
123	NC_007332	GCTTTG	2	12	219999	220010	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	72080533
124	NC_007332	TTAATT	2	12	220524	220535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080534
125	NC_007332	CTGATT	2	12	222153	222164	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72080537
126	NC_007332	TTCCTT	2	12	222232	222243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72080537
127	NC_007332	AGTTGA	2	12	223495	223506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080537
128	NC_007332	ATACTA	3	18	224565	224582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	72080537
129	NC_007332	CAAAGT	2	12	226942	226953	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	72080538
130	NC_007332	ATCAAG	2	12	227306	227317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	72080538
131	NC_007332	GAAAAG	2	12	227555	227566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080538
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135	NC_007332	GCTTTT	2	12	238969	238980	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	72080548
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138	NC_007332	ATTTTG	2	12	243661	243672	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72080551
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142	NC_007332	TTTAAA	2	12	251924	251935	50 %	50 %	0 %	0 %	72080555
143	NC_007332	TTTTAA	2	12	254230	254241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080556
144	NC_007332	TAAAAT	2	12	255515	255526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080556
145	NC_007332	AAATTT	2	12	262733	262744	50 %	50 %	0 %	0 %	72080560
146	NC_007332	ATCTTC	2	12	263421	263432	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	72080562
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148	NC_007332	ATGCTT	2	12	271207	271218	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72080565
149	NC_007332	CTTGCA	2	12	271269	271280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	72080565
150	NC_007332	AATTGC	2	12	272293	272304	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080567
151	NC_007332	AACTGC	2	12	273534	273545	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	72080568
152	NC_007332	TTAATA	2	12	274196	274207	50 %	50 %	0 %	0 %	72080568
153	NC_007332	GCAATT	2	12	278876	278887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080572
154	NC_007332	ATTTTA	2	12	279104	279115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080572
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160	NC_007332	TTGCAA	2	12	288751	288762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080580
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240	NC_007332	ATTAAT	2	12	444100	444111	50 %	50 %	0 %	0 %	72080691
241	NC_007332	TTCTGG	2	12	447367	447378	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	72080693
242	NC_007332	AAGAAA	2	12	447469	447480	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	72080693
243	NC_007332	TCTTGG	2	12	451052	451063	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	72080696
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353	NC_007332	AATATT	2	12	638049	638060	50 %	50 %	0 %	0 %	72080820
354	NC_007332	CGCTTT	2	12	644462	644473	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	72080825
355	NC_007332	TTTTAT	2	12	646062	646073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	72080826
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357	NC_007332	TAAAGG	2	12	647967	647978	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	72080827
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359	NC_007332	ACATTT	2	12	650023	650034	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72080827
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