MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dechloromonas aromatica RCB

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007298	TTTACG	2	12	118610	118621	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007298	AACCCG	2	12	277094	277105	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007298	GCAAAC	2	12	352447	352458	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007298	GGATCA	2	12	547229	547240	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007298	CGCCAG	2	12	549192	549203	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007298	AAAAAG	2	12	585506	585517	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007298	GGTTGA	2	12	585981	585992	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007298	TTGTGA	2	12	592707	592718	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007298	GGTAGC	2	12	604561	604572	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007298	GTTGGG	2	12	783371	783382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007298	CAGCCA	2	12	875895	875906	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007298	TGGCGT	2	12	913954	913965	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007298	CCAACC	2	12	974390	974401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_007298	TTGATT	2	12	1084344	1084355	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007298	CAGAAA	2	12	1167323	1167334	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007298	GCCGTA	2	12	1196815	1196826	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007298	TGGGGT	2	12	1201927	1201938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007298	CTTTTT	2	12	1431703	1431714	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007298	TTTGGC	2	12	1438203	1438214	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007298	GTGAGT	2	12	1451541	1451552	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007298	GTGTTT	2	12	1458928	1458939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007298	CCCCAA	2	12	1474261	1474272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_007298	GTTGGG	2	12	1578940	1578951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007298	AACAAA	2	12	1620847	1620858	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007298	TGGCAT	2	12	1620879	1620890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007298	ACCAAA	2	12	1650939	1650950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007298	AAAAAG	2	12	1690172	1690183	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007298	AATGGC	2	12	1771476	1771487	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007298	TTCCAA	2	12	1771944	1771955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007298	CTCTGC	2	12	1794916	1794927	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007298	GTTTGC	2	12	1904297	1904308	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007298	GGAGCA	2	12	1961483	1961494	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007298	GGGGGC	2	12	1970492	1970503	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007298	ACCCCA	2	12	1984870	1984881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007298	TATCGA	2	12	2012945	2012956	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007298	AGATAG	2	12	2057570	2057581	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007298	GCAATG	2	12	2100149	2100160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007298	ATTGCC	2	12	2191767	2191778	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007298	CAAAGG	2	12	2223994	2224005	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007298	CAGGGC	2	12	2235290	2235301	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007298	ACCCCA	2	12	2249133	2249144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007298	AACGTG	2	12	2291412	2291423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007298	CCTCCC	2	12	2298818	2298829	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
44	NC_007298	TTCGCG	2	12	2300982	2300993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007298	CCAGCA	2	12	2301901	2301912	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007298	TTCCCC	2	12	2302779	2302790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_007298	CTTTCG	2	12	2307426	2307437	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007298	ACGCCA	2	12	2359490	2359501	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007298	GCCGGG	2	12	2472216	2472227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007298	CGGTGA	2	12	2474941	2474952	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007298	ACCCGA	2	12	2493643	2493654	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007298	AGAAAA	2	12	2524910	2524921	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007298	GTTCTG	2	12	2566731	2566742	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007298	CTCGCT	2	12	2610607	2610618	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007298	AGCATC	2	12	2633129	2633140	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007298	TGCGCC	2	12	2696281	2696292	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007298	CCCCGC	2	12	2729551	2729562	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
58	NC_007298	ACGCCC	2	12	2750510	2750521	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007298	ACCCGA	2	12	2840922	2840933	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007298	GCTTGA	2	12	2940331	2940342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007298	GGCCTG	2	12	2986564	2986575	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007298	AGCGCC	2	12	3076591	3076602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007298	AACCCT	2	12	3140100	3140111	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007298	AGAAAA	2	12	3161381	3161392	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007298	CTATTT	2	12	3207881	3207892	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007298	AAAACG	2	12	3277096	3277107	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007298	GCCACC	2	12	3387793	3387804	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_007298	CCGGCG	2	12	3413100	3413111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007298	GTTGGG	2	12	3494121	3494132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007298	GAAAAA	2	12	3553988	3553999	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007298	AGTCCC	2	12	3665375	3665386	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007298	GGAGCG	2	12	3901460	3901471	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007298	ACCGCG	2	12	3949419	3949430	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007298	AGGCGC	2	12	3949461	3949472	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007298	CCTCCC	2	12	3953038	3953049	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
76	NC_007298	TTTCTG	2	12	3975467	3975478	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007298	AACTGG	2	12	4007869	4007880	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007298	TTTAAT	2	12	4180502	4180513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007298	GCTATC	2	12	4194801	4194812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007298	AAAAAG	2	12	4215751	4215762	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007298	GAATAC	2	12	4368521	4368532	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007298	CCCCGG	2	12	4371694	4371705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_007298	ATTTTT	2	12	4411919	4411930	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007298	GGCGAT	2	12	4461159	4461170	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.