MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS5005 chromosome

Total Repeats: 479

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007297	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007297	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007297	AT	3	6	16659	16664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007297	AG	3	6	17040	17045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007297	AG	3	6	17215	17220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007297	AT	3	6	17744	17749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007297	CT	3	6	17775	17780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007297	AC	3	6	18265	18270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007297	AC	3	6	18434	18439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007297	TG	3	6	18789	18794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007297	TA	3	6	18864	18869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007297	AG	3	6	19357	19362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007297	CT	3	6	19471	19476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007297	TC	3	6	19849	19854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007297	TG	3	6	20239	20244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007297	GA	3	6	20390	20395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007297	TA	3	6	20444	20449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007297	GA	3	6	20686	20691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007297	CT	3	6	20801	20806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007297	GA	3	6	21008	21013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007297	GA	3	6	21823	21828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007297	AC	3	6	22116	22121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007297	AG	3	6	23041	23046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007297	AG	3	6	23216	23221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007297	AT	3	6	23745	23750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007297	CT	3	6	23776	23781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007297	AC	3	6	24266	24271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007297	AC	3	6	24435	24440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007297	TG	3	6	24790	24795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007297	TA	3	6	24865	24870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007297	AG	3	6	25358	25363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007297	CT	3	6	25472	25477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007297	TC	3	6	25850	25855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007297	TG	3	6	26240	26245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007297	GA	3	6	26391	26396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007297	TA	3	6	26445	26450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007297	GA	3	6	26687	26692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007297	CT	3	6	26802	26807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007297	GA	3	6	27009	27014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007297	GA	3	6	27824	27829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007297	AC	3	6	28117	28122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007297	AT	4	8	29563	29570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007297	TA	3	6	30501	30506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007297	AT	3	6	30982	30987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007297	AG	3	6	32424	32429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007297	TA	3	6	32467	32472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007297	TA	3	6	42162	42167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007297	GA	3	6	53284	53289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007297	CT	3	6	54401	54406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007297	AT	3	6	58338	58343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007297	AT	3	6	61220	61225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007297	CA	3	6	71786	71791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007297	GA	3	6	79062	79067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007297	AG	3	6	79847	79852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007297	AG	3	6	80022	80027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007297	AT	3	6	80551	80556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007297	CT	3	6	80582	80587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007297	AC	3	6	81072	81077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007297	AC	3	6	81241	81246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007297	TG	3	6	81596	81601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007297	TA	3	6	81671	81676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007297	AG	3	6	82164	82169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007297	CT	3	6	82278	82283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007297	TC	3	6	82656	82661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007297	TG	3	6	83046	83051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007297	GA	3	6	83197	83202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007297	TA	3	6	83251	83256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007297	GA	3	6	83493	83498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007297	CT	3	6	83608	83613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007297	GA	3	6	83815	83820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007297	GA	3	6	84630	84635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007297	AC	3	6	84923	84928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007297	CT	3	6	85650	85655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007297	GA	3	6	86877	86882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007297	TG	3	6	86974	86979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007297	AT	3	6	105703	105708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007297	AG	3	6	106764	106769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007297	AT	3	6	112733	112738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007297	CT	3	6	117098	117103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007297	AT	3	6	117295	117300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007297	GA	3	6	120196	120201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007297	AT	3	6	126667	126672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007297	AT	3	6	129404	129409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007297	TA	3	6	129443	129448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007297	AC	3	6	134529	134534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007297	AT	3	6	146259	146264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007297	GA	3	6	153985	153990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007297	CA	3	6	154538	154543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007297	TA	3	6	154992	154997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007297	TC	3	6	155901	155906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007297	TG	3	6	160450	160455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007297	GT	4	8	162408	162415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007297	AG	3	6	165567	165572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007297	TG	3	6	167400	167405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007297	GA	3	6	168659	168664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007297	AG	3	6	179913	179918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007297	AT	3	6	189309	189314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007297	GT	3	6	191011	191016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007297	AG	3	6	193915	193920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007297	TC	3	6	195514	195519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007297	TA	3	6	195542	195547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007297	GA	3	6	195675	195680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007297	GA	3	6	195949	195954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007297	AG	3	6	200324	200329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007297	AT	3	6	209025	209030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007297	AG	3	6	210662	210667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007297	TA	3	6	210773	210778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007297	AG	3	6	214264	214269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007297	TC	5	10	214418	214427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007297	AC	3	6	218324	218329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007297	TC	3	6	236382	236387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007297	CA	3	6	237600	237605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007297	TA	3	6	240072	240077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007297	AG	3	6	241216	241221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007297	GA	3	6	241407	241412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007297	AT	3	6	244050	244055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007297	TA	3	6	250013	250018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007297	GA	3	6	257292	257297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007297	AG	3	6	264966	264971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007297	AG	3	6	265141	265146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007297	AT	3	6	265670	265675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007297	CT	3	6	265701	265706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007297	AC	3	6	266191	266196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007297	AC	3	6	266360	266365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007297	TG	3	6	266715	266720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007297	TA	3	6	266790	266795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007297	AG	3	6	267283	267288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007297	CT	3	6	267397	267402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007297	TC	3	6	267775	267780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007297	TG	3	6	268165	268170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007297	GA	3	6	268316	268321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007297	TA	3	6	268370	268375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007297	GA	3	6	268612	268617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007297	CT	3	6	268727	268732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007297	GA	3	6	268934	268939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007297	GA	3	6	269749	269754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007297	AG	4	8	270116	270123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007297	GA	3	6	279928	279933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007297	TA	3	6	302132	302137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007297	GA	3	6	319890	319895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007297	TA	3	6	328150	328155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007297	AG	3	6	335236	335241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007297	TC	3	6	335347	335352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007297	TG	3	6	336153	336158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007297	AT	3	6	339112	339117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007297	AG	3	6	353534	353539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007297	CT	3	6	358597	358602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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150	NC_007297	AT	3	6	361230	361235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007297	AT	3	6	361270	361275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007297	AT	4	8	361739	361746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007297	TA	3	6	367740	367745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007297	GA	3	6	372069	372074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_007297	CT	3	6	392644	392649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.