MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS6180 chromosome

Total Repeats: 722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007296	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71902672
2	NC_007296	GATTCA	2	12	6733	6744	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71902673
3	NC_007296	ATTTTC	2	12	6979	6990	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71902673
4	NC_007296	CTTAAC	2	12	7492	7503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902673
5	NC_007296	TGCTTA	2	12	7966	7977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71902673
6	NC_007296	TAGATA	2	12	9995	10006	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71902677
7	NC_007296	GTATTG	2	12	11068	11079	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71902678
8	NC_007296	ATCAGA	2	12	11102	11113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71902678
9	NC_007296	AGATTT	2	12	11690	11701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71902678
10	NC_007296	TAAAAT	2	12	14007	14018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902680
11	NC_007296	GAATCT	2	12	14734	14745	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71902680
12	NC_007296	AGTGTA	2	12	21853	21864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007296	ACTAAT	2	12	21881	21892	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007296	AGTGTA	2	12	27854	27865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007296	ACTAAT	2	12	27882	27893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007296	CTGCAA	2	12	31426	31437	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	71902683
17	NC_007296	ACTGAG	2	12	37149	37160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71902689
18	NC_007296	CAGGCG	2	12	37603	37614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	71902689
19	NC_007296	ACATCG	2	12	44179	44190	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	71902693
20	NC_007296	AAAGCC	2	12	47181	47192	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	71902695
21	NC_007296	AAAAGT	2	12	52774	52785	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71902700
22	NC_007296	CGAACA	2	12	54818	54829	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	71902701
23	NC_007296	ATAACT	2	12	55237	55248	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71902702
24	NC_007296	AAGGAA	2	12	55743	55754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902703
25	NC_007296	GCCTTT	2	12	61745	61756	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	71902706
26	NC_007296	GGCAAC	2	12	63091	63102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902707
27	NC_007296	TATTTT	2	12	64176	64187	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007296	AAAGGT	2	12	64647	64658	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	71902709
29	NC_007296	CTTGTT	2	12	65417	65428	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	71902710
30	NC_007296	AGCTGA	2	12	65865	65876	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71902711
31	NC_007296	CGCAAT	2	12	67269	67280	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	71902714
32	NC_007296	ATTGAA	2	12	67681	67692	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71902715
33	NC_007296	ACATCA	2	12	67817	67828	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	71902715
34	NC_007296	CAAAGG	2	12	71860	71871	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	71902724
35	NC_007296	AAATTA	2	12	72922	72933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902727
36	NC_007296	GCGGTG	2	12	73436	73447	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	71902728
37	NC_007296	TAAAGA	2	12	73797	73808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	162139415
38	NC_007296	ATTGAA	2	12	75997	76008	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71902731
39	NC_007296	AGTGTA	2	12	84143	84154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007296	ACTAAT	2	12	84171	84182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007296	TTCGGG	2	12	85113	85124	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007296	CTGGTA	2	12	100813	100824	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71902748
43	NC_007296	ATATTT	2	12	101596	101607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902750
44	NC_007296	CTTTTT	2	12	102805	102816	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71902751
45	NC_007296	ATAAAA	2	12	112272	112283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007296	CAGCAA	2	12	115181	115192	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	71902770
47	NC_007296	CCAGAT	2	12	117023	117034	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	71902771
48	NC_007296	TTGATA	2	12	118170	118181	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71902771
49	NC_007296	TGGTTT	2	12	123994	124005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902776
50	NC_007296	CCATTA	2	12	125133	125144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902777
51	NC_007296	AGATAA	2	12	126775	126786	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007296	TATTGA	2	12	129982	129993	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71902779
53	NC_007296	TGTTAT	2	12	131228	131239	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71902780
54	NC_007296	ATTTTT	2	12	132088	132099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71902781
55	NC_007296	TTTTTA	2	12	132670	132681	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71902781
56	NC_007296	AATAGC	2	12	135488	135499	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71902784
57	NC_007296	AGATAA	2	12	139604	139615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007296	ATCTTG	2	12	139989	140000	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71902790
59	NC_007296	AAAAGC	2	12	141563	141574	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	71902790
60	NC_007296	ATGTCA	2	12	141900	141911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71902790
61	NC_007296	AAAGCT	2	12	143386	143397	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71902793
62	NC_007296	AAGGTA	2	12	151218	151229	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	71902800
63	NC_007296	AAAACT	2	12	153833	153844	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71902801
64	NC_007296	TATTGA	2	12	155426	155437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71902803
65	NC_007296	CCAATC	2	12	163835	163846	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	71902811
66	NC_007296	CTTTAT	2	12	165326	165337	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007296	TGCTGT	2	12	166588	166599	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	71902812
68	NC_007296	CTCTTT	2	12	167190	167201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007296	GATGTT	2	12	171300	171311	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71902819
70	NC_007296	AGATCA	2	12	171324	171335	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71902819
71	NC_007296	GATGTT	2	12	180647	180658	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71902825
72	NC_007296	TCTTAT	2	12	182131	182142	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71902827
73	NC_007296	GTGGAA	2	12	187001	187012	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	71902834
74	NC_007296	TCTTTG	2	12	189083	189094	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	71902837
75	NC_007296	TGGGAG	2	12	190828	190839	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	71902839
76	NC_007296	TGACTG	2	12	190997	191008	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71902839
77	NC_007296	TTGACC	2	12	191458	191469	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	71902840
78	NC_007296	CCTATC	2	12	192464	192475	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	71902842
79	NC_007296	TGACAC	2	12	194070	194081	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007296	ATCGGT	2	12	197370	197381	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71902849
81	NC_007296	CAGTTC	2	12	198709	198720	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007296	TCAACA	2	12	199724	199735	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	71902850
83	NC_007296	TTTAAA	2	12	200558	200569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007296	TGAAAA	2	12	205429	205440	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71902856
85	NC_007296	ATTAGC	2	12	211932	211943	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71902862
86	NC_007296	TCATGC	2	12	218860	218871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	71902868
87	NC_007296	TCCCAT	2	12	222797	222808	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	71902873
88	NC_007296	CTAGCA	2	12	231199	231210	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	71902882
89	NC_007296	TACCCA	2	12	232446	232457	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	71902883
90	NC_007296	GATACG	2	12	233474	233485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71902885
91	NC_007296	AGGCAA	2	12	237372	237383	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	71902889
92	NC_007296	GCAAGA	2	12	241449	241460	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	71902892
93	NC_007296	TTCGAA	2	12	242848	242859	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71902892
94	NC_007296	TGGCAA	2	12	245489	245500	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71902895
95	NC_007296	CCAGAA	2	12	245821	245832	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	71902895
96	NC_007296	CAGCAA	2	12	246846	246857	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	71902896
97	NC_007296	TGGCGG	2	12	249595	249606	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	71902898
98	NC_007296	GGCTGT	2	12	252208	252219	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	71902901
99	NC_007296	GATAAG	2	12	253071	253082	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	71902903
100	NC_007296	AGTGAC	2	12	254083	254094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71902904
101	NC_007296	AGCCAA	2	12	256609	256620	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	71902907
102	NC_007296	ACTTAT	2	12	261348	261359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71902910
103	NC_007296	GAAACA	2	12	262482	262493	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	71902910
104	NC_007296	AAAATC	2	12	266828	266839	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71902914
105	NC_007296	AGTGTA	2	12	273325	273336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007296	ACTAAT	2	12	273353	273364	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007296	TAAAAA	2	12	276595	276606	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71902919
108	NC_007296	TCAAGA	2	12	282847	282858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71902928
109	NC_007296	GGGTTA	2	12	287853	287864	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	71902933
110	NC_007296	GACAAT	2	12	289889	289900	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71902935
111	NC_007296	CCAGCT	2	12	291714	291725	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	71902936
112	NC_007296	TTAAAA	2	12	293747	293758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007296	CCAATT	2	12	300614	300625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902945
114	NC_007296	TGCTAT	2	12	300764	300775	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71902945
115	NC_007296	CCAACG	2	12	300780	300791	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	71902945
116	NC_007296	ATAACC	2	12	303224	303235	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	71902946
117	NC_007296	GCACCT	2	12	305812	305823	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	71902948
118	NC_007296	AGCAGG	2	12	307662	307673	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	71902950
119	NC_007296	TTTAAT	2	12	310822	310833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007296	ATGATT	2	12	320899	320910	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71902968
121	NC_007296	TATCGC	2	12	321132	321143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	71902968
122	NC_007296	AAGACC	2	12	321775	321786	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	71902969
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124	NC_007296	GATAAA	2	12	324803	324814	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71902972
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127	NC_007296	AAGACC	2	12	337326	337337	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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235	NC_007296	ATGGCA	2	12	644004	644015	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	162139406
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340	NC_007296	GTCAAA	2	12	952049	952060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71903598
341	NC_007296	CTGTCG	2	12	957887	957898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71903603
342	NC_007296	TTGGAC	2	12	959065	959076	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71903603
343	NC_007296	TTTAAA	2	12	964539	964550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
344	NC_007296	AGTCTT	2	12	967399	967410	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71903616
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347	NC_007296	CTACTT	2	12	978300	978311	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	71903625
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352	NC_007296	TTATCA	2	12	984491	984502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71903630
353	NC_007296	ATTGTA	2	12	984649	984660	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71903630
354	NC_007296	TTAATA	2	12	984908	984919	50 %	50 %	0 %	0 %	71903630
355	NC_007296	CTTTCT	2	12	986861	986872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71903633
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431	NC_007296	GCTTTA	2	12	1191778	1191789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71903845
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440	NC_007296	TAGAAT	2	12	1201108	1201119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
441	NC_007296	ACCGAT	2	12	1202903	1202914	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	71903856
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448	NC_007296	ACCACA	2	12	1219671	1219682	50 %	0 %	0 %	50 %	71903875
449	NC_007296	TTATTT	2	12	1220914	1220925	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_007296	AGCTGA	2	12	1225515	1225526	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71903880
451	NC_007296	ATTGCT	2	12	1226411	1226422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71903881
452	NC_007296	AACAAA	2	12	1230066	1230077	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71903886
453	NC_007296	TCACGG	2	12	1232888	1232899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	71903890
454	NC_007296	TTTTAA	2	12	1237112	1237123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71903895
455	NC_007296	TGAGCT	2	12	1244958	1244969	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71903901
456	NC_007296	ACTTGT	2	12	1245731	1245742	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71903903
457	NC_007296	AGCCTT	2	12	1246740	1246751	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
458	NC_007296	TTAGCT	2	12	1249402	1249413	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71903910
459	NC_007296	TAAAAA	2	12	1253642	1253653	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71903913
460	NC_007296	GAACAG	2	12	1255803	1255814	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	71903918
461	NC_007296	AGCTAC	2	12	1260751	1260762	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	71903930
462	NC_007296	TCTAAA	2	12	1261923	1261934	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71903932
463	NC_007296	GATAAA	2	12	1267637	1267648	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71903946
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465	NC_007296	TGTTTC	2	12	1275097	1275108	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	71903955
466	NC_007296	TTTTCT	2	12	1275143	1275154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71903955
467	NC_007296	TATTTT	2	12	1276038	1276049	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71903955
468	NC_007296	CTTTTT	2	12	1280390	1280401	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71903958
469	NC_007296	CAAACT	2	12	1281065	1281076	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	71903958
470	NC_007296	AGGTTG	2	12	1281536	1281547	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	71903958
471	NC_007296	CATCTT	2	12	1281638	1281649	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	71903958
472	NC_007296	ACGGCA	2	12	1282270	1282281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71903958
473	NC_007296	ATTACC	2	12	1290548	1290559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71903970
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477	NC_007296	GTTTAA	2	12	1305609	1305620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71903987
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481	NC_007296	CTGCGA	2	12	1311334	1311345	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	71903988
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484	NC_007296	TTTTAT	2	12	1316011	1316022	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_007296	TCCTTC	2	12	1350443	1350454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
493	NC_007296	ACTTGT	2	12	1351907	1351918	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71904022
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498	NC_007296	GAAAAA	2	12	1361417	1361428	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
499	NC_007296	ACGATG	2	12	1366166	1366177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71904033
500	NC_007296	TTCCTG	2	12	1366797	1366808	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	71904034

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