MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS6180 chromosome

Total Repeats: 1479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007296	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	71902669
2	NC_007296	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	71902670
3	NC_007296	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	71902671
4	NC_007296	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	71902673
5	NC_007296	ATTAA	2	10	11967	11976	60 %	40 %	0 %	0 %	71902678
6	NC_007296	TACAC	2	10	15916	15925	40 %	20 %	0 %	40 %	71902681
7	NC_007296	TAAAT	2	10	15926	15935	60 %	40 %	0 %	0 %	71902681
8	NC_007296	ACATT	2	10	16493	16502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007296	TCGTG	2	10	18114	18123	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007296	GTTAA	2	10	19010	19019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007296	GGGAG	2	10	19529	19538	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007296	AGGGA	2	10	21740	21749	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007296	GCTTA	2	10	22106	22115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007296	TCGTG	2	10	24115	24124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007296	GTTAA	2	10	25011	25020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007296	GGGAG	2	10	25530	25539	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007296	AGGGA	2	10	27741	27750	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007296	GCTTA	2	10	28107	28116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007296	TTTTC	2	10	29939	29948	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007296	CTTTT	2	10	30047	30056	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007296	TATAA	2	10	32160	32169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007296	AGTGA	2	10	32907	32916	40 %	20 %	40 %	0 %	71902684
23	NC_007296	ATTTT	2	10	33606	33615	20 %	80 %	0 %	0 %	71902685
24	NC_007296	TTGAT	2	10	33795	33804	20 %	60 %	20 %	0 %	71902685
25	NC_007296	TGGTG	2	10	35879	35888	0 %	40 %	60 %	0 %	71902688
26	NC_007296	AGCAG	2	10	43127	43136	40 %	0 %	40 %	20 %	71902692
27	NC_007296	GGTCA	2	10	43491	43500	20 %	20 %	40 %	20 %	71902692
28	NC_007296	TTGGG	2	10	43887	43896	0 %	40 %	60 %	0 %	71902693
29	NC_007296	GCAGG	2	10	47967	47976	20 %	0 %	60 %	20 %	71902695
30	NC_007296	CTGCC	2	10	48931	48940	0 %	20 %	20 %	60 %	71902697
31	NC_007296	CTCAG	2	10	49324	49333	20 %	20 %	20 %	40 %	71902697
32	NC_007296	TCGGA	2	10	53936	53945	20 %	20 %	40 %	20 %	71902701
33	NC_007296	GCTTT	2	10	56681	56690	0 %	60 %	20 %	20 %	71902704
34	NC_007296	TTTTC	2	10	56879	56888	0 %	80 %	0 %	20 %	71902704
35	NC_007296	AAACC	2	10	56944	56953	60 %	0 %	0 %	40 %	71902704
36	NC_007296	ATGGT	2	10	58717	58726	20 %	40 %	40 %	0 %	71902705
37	NC_007296	ATTCA	2	10	59401	59410	40 %	40 %	0 %	20 %	71902705
38	NC_007296	ATTTT	2	10	60666	60675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007296	AAATA	2	10	61933	61942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007296	TATAT	2	10	62018	62027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007296	TTTTA	2	10	63172	63181	20 %	80 %	0 %	0 %	71902707
42	NC_007296	AAAGC	2	10	63365	63374	60 %	0 %	20 %	20 %	71902707
43	NC_007296	TTTGG	2	10	67360	67369	0 %	60 %	40 %	0 %	71902714
44	NC_007296	TTCAC	2	10	67716	67725	20 %	40 %	0 %	40 %	71902715
45	NC_007296	GAAAT	2	10	68797	68806	60 %	20 %	20 %	0 %	71902717
46	NC_007296	AAGGA	2	10	69877	69886	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007296	TCCAA	2	10	74497	74506	40 %	20 %	0 %	40 %	162139415
48	NC_007296	GTTTC	2	10	77146	77155	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007296	TCGTG	2	10	80404	80413	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007296	GTTAA	2	10	81300	81309	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007296	GGGAG	2	10	81819	81828	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007296	AGGGA	2	10	84030	84039	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007296	GCTTA	2	10	84396	84405	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007296	ATTAT	2	10	84686	84695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007296	TATAT	2	10	84769	84778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007296	CTTGG	2	10	88705	88714	0 %	40 %	40 %	20 %	71902743
57	NC_007296	TCTTA	2	10	89123	89132	20 %	60 %	0 %	20 %	71902743
58	NC_007296	CACTC	2	10	90668	90677	20 %	20 %	0 %	60 %	71902745
59	NC_007296	GATTG	2	10	92929	92938	20 %	40 %	40 %	0 %	71902746
60	NC_007296	TTGAT	2	10	103088	103097	20 %	60 %	20 %	0 %	71902751
61	NC_007296	AAATC	2	10	103256	103265	60 %	20 %	0 %	20 %	71902751
62	NC_007296	TGAAG	2	10	108572	108581	40 %	20 %	40 %	0 %	71902760
63	NC_007296	AGAAA	2	10	110013	110022	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007296	TAGTT	2	10	110284	110293	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007296	TTTAG	2	10	110431	110440	20 %	60 %	20 %	0 %	71902763
66	NC_007296	GTGTT	2	10	114836	114845	0 %	60 %	40 %	0 %	71902769
67	NC_007296	TTAAG	2	10	115036	115045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007296	TAGGT	2	10	115659	115668	20 %	40 %	40 %	0 %	71902770
69	NC_007296	TAAAT	2	10	115792	115801	60 %	40 %	0 %	0 %	71902770
70	NC_007296	AAATC	2	10	116668	116677	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007296	GAGAG	2	10	116830	116839	40 %	0 %	60 %	0 %	71902771
72	NC_007296	GGGAA	2	10	127205	127214	40 %	0 %	60 %	0 %	71902779
73	NC_007296	GACCT	2	10	128666	128675	20 %	20 %	20 %	40 %	71902779
74	NC_007296	TCAGG	2	10	129971	129980	20 %	20 %	40 %	20 %	71902779
75	NC_007296	TTTTA	2	10	131853	131862	20 %	80 %	0 %	0 %	71902781
76	NC_007296	GCTTT	3	15	132429	132443	0 %	60 %	20 %	20 %	71902781
77	NC_007296	GTCAT	2	10	132748	132757	20 %	40 %	20 %	20 %	71902781
78	NC_007296	CTTAT	2	10	133062	133071	20 %	60 %	0 %	20 %	71902781
79	NC_007296	TAGTG	2	10	133693	133702	20 %	40 %	40 %	0 %	71902782
80	NC_007296	GTTAA	2	10	134096	134105	40 %	40 %	20 %	0 %	71902782
81	NC_007296	AATAA	2	10	134125	134134	80 %	20 %	0 %	0 %	71902782
82	NC_007296	TTGAT	2	10	135212	135221	20 %	60 %	20 %	0 %	71902783
83	NC_007296	TTGAC	2	10	136434	136443	20 %	40 %	20 %	20 %	71902785
84	NC_007296	TACCT	2	10	136615	136624	20 %	40 %	0 %	40 %	71902785
85	NC_007296	AATCA	2	10	137393	137402	60 %	20 %	0 %	20 %	71902786
86	NC_007296	TCATG	2	10	138000	138009	20 %	40 %	20 %	20 %	71902787
87	NC_007296	AACAA	2	10	139146	139155	80 %	0 %	0 %	20 %	71902788
88	NC_007296	TTGGC	2	10	139231	139240	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007296	CTTAA	2	10	139430	139439	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_007296	CAAAA	2	10	140363	140372	80 %	0 %	0 %	20 %	71902790
91	NC_007296	TTTTA	2	10	141436	141445	20 %	80 %	0 %	0 %	71902790
92	NC_007296	AAAGC	2	10	142624	142633	60 %	0 %	20 %	20 %	71902792
93	NC_007296	GCTGA	2	10	142894	142903	20 %	20 %	40 %	20 %	71902792
94	NC_007296	ATCGC	2	10	146268	146277	20 %	20 %	20 %	40 %	71902795
95	NC_007296	TTGGG	2	10	147671	147680	0 %	40 %	60 %	0 %	71902796
96	NC_007296	GAAAA	2	10	152981	152990	80 %	0 %	20 %	0 %	71902801
97	NC_007296	GGATT	2	10	153098	153107	20 %	40 %	40 %	0 %	71902801
98	NC_007296	TTTTG	2	10	153618	153627	0 %	80 %	20 %	0 %	71902801
99	NC_007296	TCATG	2	10	155123	155132	20 %	40 %	20 %	20 %	71902803
100	NC_007296	GTATC	2	10	156384	156393	20 %	40 %	20 %	20 %	71902804
101	NC_007296	GTCGC	2	10	156823	156832	0 %	20 %	40 %	40 %	71902805
102	NC_007296	AAGCT	2	10	158676	158685	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_007296	AAGCA	2	10	158723	158732	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007296	ATTAT	2	10	160281	160290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007296	TAAGC	2	10	160892	160901	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007296	CTTGT	2	10	162276	162285	0 %	60 %	20 %	20 %	71902810
107	NC_007296	GCCTA	2	10	162993	163002	20 %	20 %	20 %	40 %	71902811
108	NC_007296	GCAAC	2	10	163210	163219	40 %	0 %	20 %	40 %	71902811
109	NC_007296	CGCAC	2	10	164761	164770	20 %	0 %	20 %	60 %	71902811
110	NC_007296	AAGGT	2	10	164892	164901	40 %	20 %	40 %	0 %	71902811
111	NC_007296	CGTCA	2	10	165089	165098	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_007296	AACAA	2	10	166828	166837	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007296	ATTTG	2	10	171194	171203	20 %	60 %	20 %	0 %	71902819
114	NC_007296	CAAGA	2	10	173116	173125	60 %	0 %	20 %	20 %	71902820
115	NC_007296	TTTGG	2	10	174283	174292	0 %	60 %	40 %	0 %	71902821
116	NC_007296	TGGAT	2	10	175232	175241	20 %	40 %	40 %	0 %	71902822
117	NC_007296	TGCCT	2	10	175608	175617	0 %	40 %	20 %	40 %	71902822
118	NC_007296	ACCTA	2	10	176304	176313	40 %	20 %	0 %	40 %	71902822
119	NC_007296	ATTTT	2	10	181169	181178	20 %	80 %	0 %	0 %	71902826
120	NC_007296	AAAAG	2	10	181333	181342	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007296	TCTAT	2	10	182157	182166	20 %	60 %	0 %	20 %	71902827
122	NC_007296	GTTTG	2	10	182697	182706	0 %	60 %	40 %	0 %	71902827
123	NC_007296	TGAAA	2	10	182872	182881	60 %	20 %	20 %	0 %	71902828
124	NC_007296	TTGAT	2	10	183120	183129	20 %	60 %	20 %	0 %	71902828
125	NC_007296	CCAAA	2	10	185467	185476	60 %	0 %	0 %	40 %	71902833
126	NC_007296	TCCCA	2	10	185669	185678	20 %	20 %	0 %	60 %	71902833
127	NC_007296	GCCAA	2	10	186516	186525	40 %	0 %	20 %	40 %	71902834
128	NC_007296	GGAAA	2	10	189466	189475	60 %	0 %	40 %	0 %	71902837
129	NC_007296	TAATC	2	10	192291	192300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007296	TCTAA	2	10	195574	195583	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_007296	TTTAC	2	10	196423	196432	20 %	60 %	0 %	20 %	71902846
132	NC_007296	CAAAC	2	10	198942	198951	60 %	0 %	0 %	40 %	71902850
133	NC_007296	AGATA	2	10	199056	199065	60 %	20 %	20 %	0 %	71902850
134	NC_007296	ATATA	2	10	199845	199854	60 %	40 %	0 %	0 %	71902850
135	NC_007296	TTAAA	2	10	200356	200365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007296	AGTAT	2	10	201582	201591	40 %	40 %	20 %	0 %	71902852
137	NC_007296	GTTTT	2	10	201802	201811	0 %	80 %	20 %	0 %	71902853
138	NC_007296	TTTTG	2	10	203732	203741	0 %	80 %	20 %	0 %	71902854
139	NC_007296	ATCGC	2	10	205050	205059	20 %	20 %	20 %	40 %	71902856
140	NC_007296	TTTTA	2	10	206218	206227	20 %	80 %	0 %	0 %	71902857
141	NC_007296	CTAAT	2	10	206456	206465	40 %	40 %	0 %	20 %	71902857
142	NC_007296	GAATG	2	10	206979	206988	40 %	20 %	40 %	0 %	71902857
143	NC_007296	TGTCT	2	10	209473	209482	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_007296	TAAGA	2	10	210991	211000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_007296	GTTAT	2	10	216107	216116	20 %	60 %	20 %	0 %	71902865
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197	NC_007296	ATTAT	2	10	287785	287794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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