MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS6180 chromosome

Total Repeats: 316

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007296	ACATT	2	10	16493	16502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007296	TCGTG	2	10	18114	18123	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007296	GTTAA	2	10	19010	19019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007296	GGGAG	2	10	19529	19538	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007296	AGGGA	2	10	21740	21749	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007296	GCTTA	2	10	22106	22115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007296	TCGTG	2	10	24115	24124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007296	GTTAA	2	10	25011	25020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007296	GGGAG	2	10	25530	25539	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007296	AGGGA	2	10	27741	27750	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007296	GCTTA	2	10	28107	28116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007296	TTTTC	2	10	29939	29948	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007296	CTTTT	2	10	30047	30056	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007296	TATAA	2	10	32160	32169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007296	ATTTT	2	10	60666	60675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007296	AAATA	2	10	61933	61942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007296	TATAT	2	10	62018	62027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007296	AAGGA	2	10	69877	69886	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007296	GTTTC	2	10	77146	77155	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007296	TCGTG	2	10	80404	80413	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007296	GTTAA	2	10	81300	81309	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007296	GGGAG	2	10	81819	81828	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007296	AGGGA	2	10	84030	84039	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007296	GCTTA	2	10	84396	84405	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007296	ATTAT	2	10	84686	84695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007296	TATAT	2	10	84769	84778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007296	AGAAA	2	10	110013	110022	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007296	TAGTT	2	10	110284	110293	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007296	TTAAG	2	10	115036	115045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007296	AAATC	2	10	116668	116677	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007296	TTGGC	2	10	139231	139240	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007296	CTTAA	2	10	139430	139439	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007296	AAGCT	2	10	158676	158685	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007296	AAGCA	2	10	158723	158732	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007296	ATTAT	2	10	160281	160290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007296	TAAGC	2	10	160892	160901	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007296	CGTCA	2	10	165089	165098	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_007296	AACAA	2	10	166828	166837	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007296	AAAAG	2	10	181333	181342	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007296	TAATC	2	10	192291	192300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007296	TCTAA	2	10	195574	195583	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007296	TTAAA	2	10	200356	200365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007296	TGTCT	2	10	209473	209482	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007296	TAAGA	2	10	210991	211000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007296	GTAAA	2	10	214134	214143	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007296	GTTCA	2	10	231350	231359	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007296	TCATT	2	10	260958	260967	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007296	TTGTA	2	10	267581	267590	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007296	TCGTG	2	10	269586	269595	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007296	GTTAA	2	10	270482	270491	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007296	GGGAG	2	10	271001	271010	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007296	AGGGA	2	10	273212	273221	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007296	TTATC	2	10	274688	274697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007296	GTTAT	2	10	283066	283075	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007296	TAGCA	2	10	283208	283217	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007296	ATTAT	2	10	287648	287657	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007296	ATTAT	2	10	287785	287794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007296	TGTGT	2	10	301038	301047	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007296	AAAAG	2	10	309434	309443	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007296	TGCTA	2	10	320667	320676	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007296	CAGGG	2	10	320687	320696	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007296	TAAAA	2	10	326334	326343	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007296	ACAAG	2	10	343899	343908	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007296	TTGAT	2	10	350628	350637	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007296	AGTAG	2	10	354431	354440	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007296	TGAAA	2	10	359608	359617	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007296	TAAAA	2	10	360156	360165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007296	AGAAA	2	10	360324	360333	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007296	TGAAA	2	10	362075	362084	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007296	AGAAA	2	10	365530	365539	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007296	TTTAG	2	10	366775	366784	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007296	TATAG	2	10	366842	366851	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007296	TGAGA	2	10	369315	369324	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007296	TTGAT	2	10	369338	369347	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007296	TTTAT	2	10	378897	378906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007296	AAATC	2	10	382652	382661	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007296	AGAAA	2	10	384438	384447	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007296	AAGGA	2	10	393124	393133	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007296	ACTCT	2	10	395370	395379	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_007296	AAGTA	2	10	396063	396072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007296	AGAGT	2	10	396150	396159	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007296	TAGAG	2	10	398606	398615	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007296	AAAGC	2	10	402416	402425	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007296	AGCTT	2	10	426961	426970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_007296	TTTTC	2	10	427005	427014	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007296	TTATT	2	10	455105	455114	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007296	TCCTT	2	10	474246	474255	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_007296	GTTAT	2	10	477497	477506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007296	TTTCC	2	10	479064	479073	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_007296	AGAAA	2	10	479202	479211	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007296	TTAGT	2	10	483616	483625	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007296	CTTTT	2	10	493933	493942	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007296	TTTAG	2	10	497382	497391	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007296	TAGAA	2	10	499081	499090	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007296	TAAAA	2	10	499687	499696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007296	TGATC	2	10	512972	512981	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007296	AGCTG	2	10	514185	514194	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007296	ATAAA	2	10	515564	515573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007296	TTTTG	2	10	518433	518442	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007296	AAGCC	2	10	519420	519429	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_007296	TGATA	2	10	529062	529071	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007296	ACGTA	2	10	538735	538744	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_007296	TAAAT	2	10	539402	539411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007296	AGGAA	2	10	539604	539613	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007296	AAAAG	2	10	566255	566264	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007296	ATAAA	2	10	570091	570100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007296	GAATA	2	10	573446	573455	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007296	ATAGA	2	10	582894	582903	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007296	AGCAC	2	10	589528	589537	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_007296	TATAA	2	10	590613	590622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007296	AGCAT	2	10	599292	599301	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007296	GAAAG	2	10	602545	602554	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007296	ATTTA	2	10	636227	636236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007296	AAAGA	2	10	639318	639327	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007296	TCTTT	2	10	639372	639381	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007296	AAATA	2	10	639399	639408	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007296	TTCGG	2	10	650503	650512	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_007296	AAAAG	2	10	652400	652409	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007296	CACTT	2	10	653556	653565	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_007296	TTTTA	2	10	671480	671489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007296	ATGTT	2	10	676374	676383	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007296	AAAGG	2	10	700159	700168	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007296	ATTGA	2	10	700186	700195	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007296	ATGTT	2	10	705250	705259	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007296	CTAAT	2	10	717605	717614	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_007296	CATCT	2	10	719973	719982	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_007296	GGAAA	2	10	737699	737708	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007296	TAAGG	2	10	750989	750998	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007296	CACCT	2	10	753212	753221	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_007296	ATGAT	2	10	763404	763413	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007296	TAGAA	2	10	770834	770843	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007296	ATTTA	2	10	771197	771206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007296	AACAA	9	45	781071	781115	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007296	AAACA	2	10	781116	781125	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007296	ATAAA	2	10	784316	784325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007296	TAAAA	2	10	794162	794171	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007296	AATGT	2	10	794832	794841	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007296	AATAA	2	10	816185	816194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007296	TCAAA	2	10	835529	835538	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007296	TTAAA	2	10	850205	850214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007296	CAAAA	2	10	866519	866528	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007296	TAAGA	2	10	872541	872550	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007296	CTTGT	2	10	879693	879702	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_007296	AGTTG	2	10	885193	885202	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007296	ATAAA	2	10	892142	892151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007296	CATAA	2	10	900310	900319	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_007296	TTTAG	2	10	901006	901015	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007296	AATTG	2	10	906679	906688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.