MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS6180 chromosome

Total Repeats: 4868

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007296	ATTT	2	8	91	98	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007296	ACTA	2	8	117	124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007296	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	71902668
4	NC_007296	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	71902668
5	NC_007296	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	71902668
6	NC_007296	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	71902668
7	NC_007296	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007296	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	71902669
9	NC_007296	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	71902669
10	NC_007296	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	71902669
11	NC_007296	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	71902669
12	NC_007296	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	71902669
13	NC_007296	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007296	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007296	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	71902671
16	NC_007296	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	71902671
17	NC_007296	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	71902671
18	NC_007296	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	71902672
19	NC_007296	TTGA	2	8	6359	6366	25 %	50 %	25 %	0 %	71902673
20	NC_007296	CCTT	2	8	6472	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	71902673
21	NC_007296	AGTG	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	71902673
22	NC_007296	GATT	2	8	7410	7417	25 %	50 %	25 %	0 %	71902673
23	NC_007296	TGAT	2	8	7419	7426	25 %	50 %	25 %	0 %	71902673
24	NC_007296	ACCA	2	8	7576	7583	50 %	0 %	0 %	50 %	71902673
25	NC_007296	AAAG	2	8	7708	7715	75 %	0 %	25 %	0 %	71902673
26	NC_007296	TTGA	2	8	7799	7806	25 %	50 %	25 %	0 %	71902673
27	NC_007296	TCGG	2	8	8144	8151	0 %	25 %	50 %	25 %	71902673
28	NC_007296	AGCA	2	8	8192	8199	50 %	0 %	25 %	25 %	71902673
29	NC_007296	AATC	2	8	8236	8243	50 %	25 %	0 %	25 %	71902673
30	NC_007296	TCAA	2	8	8326	8333	50 %	25 %	0 %	25 %	71902673
31	NC_007296	GAAC	2	8	8754	8761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007296	AAAT	2	8	9027	9034	75 %	25 %	0 %	0 %	71902674
33	NC_007296	AAGA	2	8	9173	9180	75 %	0 %	25 %	0 %	71902675
34	NC_007296	GGAT	2	8	9236	9243	25 %	25 %	50 %	0 %	71902675
35	NC_007296	TATT	2	8	9264	9271	25 %	75 %	0 %	0 %	71902675
36	NC_007296	TCAA	2	8	9759	9766	50 %	25 %	0 %	25 %	71902677
37	NC_007296	CAAA	2	8	10123	10130	75 %	0 %	0 %	25 %	71902677
38	NC_007296	ATTT	2	8	10839	10846	25 %	75 %	0 %	0 %	71902677
39	NC_007296	AAAT	2	8	10860	10867	75 %	25 %	0 %	0 %	71902677
40	NC_007296	CAAA	2	8	11093	11100	75 %	0 %	0 %	25 %	71902678
41	NC_007296	TTCA	2	8	11529	11536	25 %	50 %	0 %	25 %	71902678
42	NC_007296	AGTT	2	8	11836	11843	25 %	50 %	25 %	0 %	71902678
43	NC_007296	TTTA	2	8	11948	11955	25 %	75 %	0 %	0 %	71902678
44	NC_007296	TTTA	2	8	12035	12042	25 %	75 %	0 %	0 %	71902678
45	NC_007296	GAAG	2	8	12481	12488	50 %	0 %	50 %	0 %	71902679
46	NC_007296	TGTT	2	8	12639	12646	0 %	75 %	25 %	0 %	71902679
47	NC_007296	ATTA	2	8	12909	12916	50 %	50 %	0 %	0 %	71902680
48	NC_007296	GAAA	2	8	13104	13111	75 %	0 %	25 %	0 %	71902680
49	NC_007296	TCAA	2	8	13302	13309	50 %	25 %	0 %	25 %	71902680
50	NC_007296	GTTC	2	8	13576	13583	0 %	50 %	25 %	25 %	71902680
51	NC_007296	ATGG	2	8	13723	13730	25 %	25 %	50 %	0 %	71902680
52	NC_007296	GTTG	2	8	13986	13993	0 %	50 %	50 %	0 %	71902680
53	NC_007296	AAAG	2	8	14070	14077	75 %	0 %	25 %	0 %	71902680
54	NC_007296	TGAT	2	8	14498	14505	25 %	50 %	25 %	0 %	71902680
55	NC_007296	ATTG	2	8	14583	14590	25 %	50 %	25 %	0 %	71902680
56	NC_007296	ACTA	2	8	15030	15037	50 %	25 %	0 %	25 %	71902681
57	NC_007296	TTTA	2	8	15647	15654	25 %	75 %	0 %	0 %	71902681
58	NC_007296	GTAT	2	8	16029	16036	25 %	50 %	25 %	0 %	71902681
59	NC_007296	ATAA	2	8	16465	16472	75 %	25 %	0 %	0 %	71902681
60	NC_007296	TACT	2	8	16548	16555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007296	GATA	2	8	16665	16672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007296	AAAT	2	8	16992	16999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007296	ACCT	2	8	17166	17173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007296	GTGA	2	8	17447	17454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007296	TAAC	2	8	17530	17537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007296	AGCG	2	8	17618	17625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007296	TGGT	2	8	18283	18290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007296	AGCC	2	8	18500	18507	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007296	AGCG	2	8	18846	18853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007296	GTAA	2	8	19096	19103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007296	ACTA	2	8	19138	19145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007296	GAAG	2	8	19178	19185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007296	GCGA	2	8	19252	19259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007296	ATTC	2	8	20118	20125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007296	CTAA	2	8	20474	20481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007296	TAGG	2	8	21129	21136	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007296	TTGG	2	8	21312	21319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007296	AATC	2	8	21321	21328	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007296	AAAT	2	8	22993	23000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007296	ACCT	2	8	23167	23174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007296	GTGA	2	8	23448	23455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007296	TAAC	2	8	23531	23538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007296	AGCG	2	8	23619	23626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007296	TGGT	2	8	24284	24291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007296	AGCC	2	8	24501	24508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007296	AGCG	2	8	24847	24854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007296	GTAA	2	8	25097	25104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007296	ACTA	2	8	25139	25146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007296	GAAG	2	8	25179	25186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007296	GCGA	2	8	25253	25260	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007296	ATTC	2	8	26119	26126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007296	CTAA	2	8	26475	26482	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007296	TAGG	2	8	27130	27137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007296	TTGG	2	8	27313	27320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007296	AATC	2	8	27322	27329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007296	GCGT	2	8	29169	29176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007296	GTTA	2	8	30063	30070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007296	ATTC	2	8	30538	30545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007296	AAGT	2	8	31015	31022	50 %	25 %	25 %	0 %	71902683
100	NC_007296	AAGC	2	8	31323	31330	50 %	0 %	25 %	25 %	71902683
101	NC_007296	ATTT	2	8	32021	32028	25 %	75 %	0 %	0 %	71902683
102	NC_007296	TTGA	2	8	32955	32962	25 %	50 %	25 %	0 %	71902684
103	NC_007296	TGAT	2	8	32968	32975	25 %	50 %	25 %	0 %	71902684
104	NC_007296	TTCT	2	8	33058	33065	0 %	75 %	0 %	25 %	71902684
105	NC_007296	ATTA	2	8	33323	33330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007296	CATT	2	8	34152	34159	25 %	50 %	0 %	25 %	71902685
107	NC_007296	GTTT	2	8	34620	34627	0 %	75 %	25 %	0 %	162139418
108	NC_007296	TAAT	2	8	35043	35050	50 %	50 %	0 %	0 %	162139418
109	NC_007296	GTAC	2	8	35228	35235	25 %	25 %	25 %	25 %	162139418
110	NC_007296	AACA	2	8	35377	35384	75 %	0 %	0 %	25 %	71902687
111	NC_007296	TTAG	2	8	35537	35544	25 %	50 %	25 %	0 %	71902687
112	NC_007296	AGAA	2	8	35669	35676	75 %	0 %	25 %	0 %	71902688
113	NC_007296	TTAT	2	8	35704	35711	25 %	75 %	0 %	0 %	71902688
114	NC_007296	GGTT	2	8	36177	36184	0 %	50 %	50 %	0 %	71902688
115	NC_007296	TTGA	2	8	36204	36211	25 %	50 %	25 %	0 %	71902688
116	NC_007296	GGAA	2	8	36404	36411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007296	AATC	2	8	37129	37136	50 %	25 %	0 %	25 %	71902689
118	NC_007296	TGGT	2	8	37789	37796	0 %	50 %	50 %	0 %	71902689
119	NC_007296	CTTG	2	8	37853	37860	0 %	50 %	25 %	25 %	71902689
120	NC_007296	TCAG	2	8	39046	39053	25 %	25 %	25 %	25 %	71902689
121	NC_007296	ACAG	2	8	39371	39378	50 %	0 %	25 %	25 %	71902689
122	NC_007296	TTGG	2	8	39908	39915	0 %	50 %	50 %	0 %	71902689
123	NC_007296	AGAA	2	8	40299	40306	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007296	ACTT	2	8	40483	40490	25 %	50 %	0 %	25 %	71902690
125	NC_007296	AATC	2	8	40603	40610	50 %	25 %	0 %	25 %	71902690
126	NC_007296	TGAT	2	8	41468	41475	25 %	50 %	25 %	0 %	71902690
127	NC_007296	AATT	2	8	41618	41625	50 %	50 %	0 %	0 %	71902690
128	NC_007296	TTGA	2	8	41701	41708	25 %	50 %	25 %	0 %	71902690
129	NC_007296	TGCT	2	8	42098	42105	0 %	50 %	25 %	25 %	71902691
130	NC_007296	AAGG	2	8	42409	42416	50 %	0 %	50 %	0 %	71902691
131	NC_007296	TAGT	2	8	42939	42946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007296	AGTT	2	8	43142	43149	25 %	50 %	25 %	0 %	71902692
133	NC_007296	GATT	2	8	43292	43299	25 %	50 %	25 %	0 %	71902692
134	NC_007296	GTCT	2	8	43302	43309	0 %	50 %	25 %	25 %	71902692
135	NC_007296	CCTG	2	8	43388	43395	0 %	25 %	25 %	50 %	71902692
136	NC_007296	AAAG	2	8	43693	43700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007296	GCTA	2	8	44828	44835	25 %	25 %	25 %	25 %	71902693
138	NC_007296	CCAA	2	8	45002	45009	50 %	0 %	0 %	50 %	71902693
139	NC_007296	AACC	2	8	45122	45129	50 %	0 %	0 %	50 %	71902693
140	NC_007296	AAAC	2	8	45308	45315	75 %	0 %	0 %	25 %	71902693
141	NC_007296	ATTA	2	8	46543	46550	50 %	50 %	0 %	0 %	71902694
142	NC_007296	AGAA	2	8	48118	48125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007296	CCTG	2	8	48582	48589	0 %	25 %	25 %	50 %	71902696
144	NC_007296	CTAT	2	8	48885	48892	25 %	50 %	0 %	25 %	71902697
145	NC_007296	CAAT	2	8	49969	49976	50 %	25 %	0 %	25 %	71902698
146	NC_007296	ATTA	2	8	50360	50367	50 %	50 %	0 %	0 %	71902698
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