MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS6180 chromosome

Total Repeats: 26050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007296	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007296	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902668
3	NC_007296	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902668
4	NC_007296	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902668
5	NC_007296	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902668
6	NC_007296	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902668
7	NC_007296	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902668
8	NC_007296	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902668
9	NC_007296	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902668
10	NC_007296	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902668
11	NC_007296	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902668
12	NC_007296	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902668
13	NC_007296	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902668
14	NC_007296	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71902668
15	NC_007296	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902668
16	NC_007296	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902668
17	NC_007296	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902668
18	NC_007296	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71902668
19	NC_007296	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902668
20	NC_007296	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007296	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007296	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007296	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007296	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
25	NC_007296	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902669
26	NC_007296	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
27	NC_007296	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
28	NC_007296	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902669
29	NC_007296	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902669
30	NC_007296	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902669
31	NC_007296	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
32	NC_007296	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
33	NC_007296	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902669
34	NC_007296	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902669
35	NC_007296	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902669
36	NC_007296	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902669
37	NC_007296	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902669
38	NC_007296	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902669
39	NC_007296	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71902669
40	NC_007296	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902669
41	NC_007296	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007296	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007296	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902670
44	NC_007296	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007296	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007296	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007296	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007296	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007296	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902671
50	NC_007296	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902671
51	NC_007296	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902671
52	NC_007296	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
53	NC_007296	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902671
54	NC_007296	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902671
55	NC_007296	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902671
56	NC_007296	AGA	3	9	4193	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
57	NC_007296	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
58	NC_007296	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902671
59	NC_007296	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902671
60	NC_007296	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902671
61	NC_007296	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902671
62	NC_007296	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902671
63	NC_007296	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902671
64	NC_007296	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
65	NC_007296	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902671
66	NC_007296	TGT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902671
67	NC_007296	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902671
68	NC_007296	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902672
69	NC_007296	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71902672
70	NC_007296	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902672
71	NC_007296	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902672
72	NC_007296	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902672
73	NC_007296	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902672
74	NC_007296	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902672
75	NC_007296	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902672
76	NC_007296	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902672
77	NC_007296	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902672
78	NC_007296	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902672
79	NC_007296	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902672
80	NC_007296	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
81	NC_007296	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71902673
82	NC_007296	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
83	NC_007296	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
84	NC_007296	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
85	NC_007296	GAT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
86	NC_007296	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902673
87	NC_007296	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
88	NC_007296	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
89	NC_007296	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902673
90	NC_007296	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
91	NC_007296	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
92	NC_007296	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
93	NC_007296	AGA	2	6	6169	6174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902673
94	NC_007296	ACT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902673
95	NC_007296	CTT	2	6	6256	6261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71902673
96	NC_007296	AAC	2	6	6394	6399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902673
97	NC_007296	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
98	NC_007296	ACG	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902673
99	NC_007296	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902673
100	NC_007296	TAA	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902673
101	NC_007296	ATG	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
102	NC_007296	TGA	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
103	NC_007296	AAG	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902673
104	NC_007296	GAT	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
105	NC_007296	TGA	3	9	7018	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
106	NC_007296	AGA	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902673
107	NC_007296	TAG	2	6	7116	7121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
108	NC_007296	CAG	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71902673
109	NC_007296	GTA	2	6	7299	7304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
110	NC_007296	ATT	2	6	7355	7360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
111	NC_007296	AAC	2	6	7431	7436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902673
112	NC_007296	AAT	2	6	7616	7621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902673
113	NC_007296	GGA	2	6	7664	7669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71902673
114	NC_007296	ATG	2	6	7824	7829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
115	NC_007296	ACA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71902673
116	NC_007296	ATC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71902673
117	NC_007296	GAA	2	6	7950	7955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902673
118	NC_007296	GAG	2	6	8097	8102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71902673
119	NC_007296	GAT	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902673
120	NC_007296	AAT	2	6	8471	8476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902673
121	NC_007296	CTT	2	6	8502	8507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71902673
122	NC_007296	ATT	2	6	8529	8534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902673
123	NC_007296	AGA	2	6	8638	8643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902673
124	NC_007296	ATA	2	6	8707	8712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902673
125	NC_007296	AAC	2	6	8719	8724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007296	TGC	2	6	8798	8803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007296	TTA	2	6	8906	8911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71902674
128	NC_007296	CGT	2	6	8914	8919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71902674
129	NC_007296	AAG	2	6	8930	8935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902674
130	NC_007296	GAA	2	6	9133	9138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902674
131	NC_007296	AAT	2	6	9158	9163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71902675
132	NC_007296	GAA	4	12	9200	9211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71902675
133	NC_007296	ATG	2	6	9254	9259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71902675
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