MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome

Total Repeats: 370

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007295	TAAA	2	8	106	113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007295	TAAA	2	8	1697	1704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007295	TAAA	2	8	9132	9139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007295	ATTT	2	8	9157	9164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007295	ATTT	2	8	17030	17037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007295	TAAT	2	8	17102	17109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007295	ACCA	2	8	17674	17681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007295	ATTA	2	8	25929	25936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007295	AAAT	2	8	26015	26022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007295	TAAG	2	8	29719	29726	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007295	ATTT	2	8	29792	29799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007295	AGTA	2	8	39489	39496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007295	AATA	2	8	59608	59615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007295	GGTG	2	8	66252	66259	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007295	ACTA	2	8	66769	66776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007295	CATA	2	8	71189	71196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007295	TAAT	2	8	71307	71314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007295	ATTT	2	8	71319	71326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007295	AAAT	2	8	71511	71518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007295	AAAT	2	8	80581	80588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007295	TTTA	2	8	80729	80736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007295	AGTT	2	8	80793	80800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007295	TTAT	2	8	80849	80856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007295	CTTT	2	8	81031	81038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007295	TATT	2	8	89694	89701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007295	AATT	2	8	89932	89939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007295	ATAA	2	8	94598	94605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007295	AATT	2	8	94695	94702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007295	ATTT	2	8	96325	96332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007295	ATAA	2	8	103686	103693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007295	ATTT	2	8	103809	103816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007295	CTAC	2	8	103965	103972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007295	GAAT	2	8	109761	109768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007295	ATTT	2	8	111416	111423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007295	TTTA	2	8	111431	111438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007295	TAAA	2	8	116789	116796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007295	AAAG	2	8	116911	116918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007295	AAAT	2	8	119915	119922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007295	TTAA	2	8	119925	119932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007295	GTTT	2	8	120595	120602	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007295	ATTA	2	8	120649	120656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007295	CATC	2	8	120824	120831	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007295	TTAA	2	8	120937	120944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007295	GAAA	2	8	126512	126519	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007295	TTAA	2	8	132525	132532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007295	TTTA	2	8	133120	133127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007295	AAAC	2	8	133243	133250	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007295	TGAT	2	8	133300	133307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007295	AAAT	2	8	133860	133867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007295	TTCC	2	8	133919	133926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007295	AATT	2	8	134262	134269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007295	TATT	2	8	135031	135038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007295	TTTA	2	8	135552	135559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007295	GCAA	2	8	135730	135737	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007295	CTTG	2	8	135789	135796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007295	ATAA	2	8	135903	135910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007295	AATT	2	8	136202	136209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007295	TTTA	2	8	136327	136334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007295	TAAA	2	8	137302	137309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007295	ACAA	2	8	143512	143519	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007295	ATTA	2	8	145574	145581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007295	ATTT	2	8	147275	147282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007295	TATG	2	8	147295	147302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007295	TAAT	2	8	148710	148717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007295	TTAA	2	8	150871	150878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007295	ATAA	2	8	150930	150937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007295	TTAT	2	8	153393	153400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007295	ATGT	2	8	153723	153730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007295	TTAA	2	8	153777	153784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007295	TAAT	2	8	153904	153911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007295	ACAA	2	8	156226	156233	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007295	TAAA	2	8	157993	158000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007295	CTTT	2	8	158706	158713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007295	TTTG	2	8	159684	159691	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007295	ATTA	2	8	161303	161310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007295	CTTT	2	8	163593	163600	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007295	TTAG	2	8	165099	165106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007295	AAAT	2	8	165133	165140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007295	TAAT	2	8	165146	165153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007295	TAAT	2	8	166211	166218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007295	TTAA	2	8	169138	169145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007295	TTAT	2	8	170376	170383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007295	ATTA	2	8	178468	178475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007295	TAAT	2	8	187434	187441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007295	TAAT	2	8	187580	187587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007295	TTTA	2	8	187655	187662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007295	TTAA	2	8	187786	187793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007295	TGAA	2	8	193291	193298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007295	TGAA	2	8	194528	194535	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007295	ATTT	2	8	200245	200252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007295	ATTT	2	8	209710	209717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007295	ATTT	2	8	213452	213459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007295	AAAT	2	8	214278	214285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007295	TAAA	2	8	214422	214429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007295	ATTT	2	8	214514	214521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007295	ATTT	2	8	234263	234270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007295	GCAA	2	8	235597	235604	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007295	TAAA	2	8	237996	238003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007295	TATT	2	8	250356	250363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007295	AAAT	2	8	250472	250479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007295	ATTT	2	8	250486	250493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007295	ATAA	2	8	250611	250618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007295	AATT	2	8	250705	250712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007295	TAAA	2	8	250736	250743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007295	TTAA	2	8	250939	250946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007295	AAAT	3	12	251063	251074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007295	TTTA	2	8	251221	251228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007295	ATTT	2	8	253429	253436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007295	AACT	2	8	253456	253463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007295	ATAA	2	8	255159	255166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007295	TAAT	2	8	255181	255188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007295	CAAG	2	8	266430	266437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007295	ATTT	2	8	271894	271901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007295	TTTC	2	8	271920	271927	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_007295	GGAA	2	8	274003	274010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007295	CTAA	2	8	274061	274068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007295	CCTT	2	8	290648	290655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007295	TGAA	2	8	290906	290913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007295	ATAA	2	8	293585	293592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007295	AATT	2	8	296420	296427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007295	TTAT	2	8	296428	296435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007295	ATTT	2	8	296442	296449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007295	ATTT	2	8	298646	298653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007295	TTAA	2	8	318238	318245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007295	TTAT	2	8	321591	321598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007295	AATT	3	12	321813	321824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007295	AAAT	2	8	325951	325958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007295	TATT	2	8	326161	326168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007295	ATTA	2	8	326208	326215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007295	TAAT	2	8	338539	338546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007295	ATTT	2	8	338634	338641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007295	AGGC	2	8	342292	342299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007295	ATTA	2	8	345609	345616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007295	AATT	2	8	345831	345838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007295	AGGC	2	8	345878	345885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007295	TGAA	2	8	346244	346251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007295	GTTT	2	8	346266	346273	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007295	CAAA	2	8	347642	347649	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007295	ATTT	2	8	347662	347669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007295	ATTT	2	8	356693	356700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007295	AGAA	2	8	356759	356766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007295	AGAT	2	8	357291	357298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007295	TATT	2	8	363118	363125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007295	AATT	2	8	363179	363186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007295	ACAA	2	8	372545	372552	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007295	ATTT	2	8	372970	372977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007295	TGGC	2	8	373000	373007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_007295	TGAC	2	8	373356	373363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_007295	AATT	2	8	373749	373756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007295	TAAT	2	8	373764	373771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.