MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma synoviae 53

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007294	TAAAAA	2	12	11693	11704	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007294	ATTTAT	2	12	35435	35446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007294	AAATCA	2	12	37995	38006	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007294	TTTTTA	2	12	50985	50996	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007294	TTAAGC	2	12	57838	57849	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007294	ACTTTT	2	12	113849	113860	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007294	TAAAAA	2	12	126151	126162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007294	TATAAA	2	12	139681	139692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007294	AAAGTT	2	12	140386	140397	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007294	TCTAAT	2	12	154331	154342	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007294	TAAAAA	2	12	176078	176089	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007294	TAAAAA	2	12	178163	178174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007294	TAAAAT	2	12	194058	194069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007294	TAAAAA	2	12	198473	198484	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007294	GCTTGA	2	12	236689	236700	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007294	GCTTGA	2	12	240258	240269	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_007294	TGTTTT	2	12	252493	252504	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007294	AGCTGA	2	12	277904	277915	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007294	TGTTGG	2	12	277934	277945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007294	TCTGCT	2	12	286142	286153	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007294	TTTGAG	2	12	289209	289220	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007294	TTAAAT	2	12	291489	291500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007294	TGTTAA	2	12	291502	291513	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007294	GTTTTT	3	18	291657	291674	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007294	TAAAAA	2	12	291833	291844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007294	ACTTAT	2	12	291932	291943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007294	TTTACA	2	12	295748	295759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007294	TATAAA	2	12	302966	302977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007294	TCAAAA	2	12	304310	304321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007294	AATAAA	2	12	304630	304641	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007294	TATAAA	2	12	307162	307173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007294	AAAGTT	2	12	307810	307821	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007294	TGTATT	2	12	315929	315940	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007294	GAAAAA	2	12	317893	317904	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007294	AATAAA	2	12	317905	317916	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007294	TTTTAA	2	12	318510	318521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007294	TTAAAA	2	12	318546	318557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007294	TATTTA	2	12	318565	318576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007294	ACAAAA	2	12	318624	318635	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007294	AAATCA	2	12	318941	318952	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007294	AAACAA	2	12	318955	318966	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007294	TATAAA	2	12	319928	319939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007294	ACAAAA	2	12	326279	326290	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007294	TAAATA	2	12	350255	350266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007294	TTGAAA	2	12	350628	350639	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007294	AATCAA	2	12	360667	360678	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007294	ATTTAT	2	12	366770	366781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007294	AAAATA	2	12	391927	391938	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007294	TTTTAA	2	12	426549	426560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007294	TTAATT	2	12	433877	433888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007294	AAATTT	2	12	450151	450162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007294	AACTTT	2	12	498186	498197	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007294	ATTTAT	2	12	498890	498901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007294	AACTTT	2	12	505122	505133	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007294	ATTTAT	2	12	505811	505822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007294	GCTCCA	2	12	515800	515811	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007294	CAAAAG	2	12	516038	516049	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007294	ATAAAT	2	12	519206	519217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007294	TTTATT	2	12	532096	532107	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007294	TATAAT	2	12	537774	537785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007294	TAAAAA	2	12	560791	560802	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007294	ATTTTT	2	12	572747	572758	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007294	AAATAA	2	12	579069	579080	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007294	AAATAA	2	12	587233	587244	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007294	AACTTT	2	12	602477	602488	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007294	ATTTAT	2	12	603165	603176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007294	CTCCAG	2	12	662272	662283	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007294	AATTTT	2	12	684138	684149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007294	TTACTA	2	12	690476	690487	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007294	ATCTTC	2	12	691035	691046	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007294	TTATAT	2	12	695384	695395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007294	ATTTTA	2	12	699881	699892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007294	TAACTT	2	12	711880	711891	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007294	GGTTTT	2	12	719651	719662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007294	TCTTTA	2	12	719774	719785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007294	AAAAAG	2	12	754392	754403	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007294	CTCCAG	2	12	775385	775396	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007294	TATAAA	2	12	780537	780548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007294	TAGATA	2	12	797000	797011	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.