MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma synoviae 53

Total Repeats: 552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007294	AAAAAC	2	12	408	419	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71894026
2	NC_007294	CTAATT	2	12	1718	1729	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71894027
3	NC_007294	AAAAGT	2	12	2535	2546	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71894027
4	NC_007294	CCTTTT	2	12	3614	3625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71894029
5	NC_007294	TGCAAA	2	12	8134	8145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71894030
6	NC_007294	AACTAA	2	12	8262	8273	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71894030
7	NC_007294	TATAAA	2	12	8305	8316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894030
8	NC_007294	AAATCA	2	12	9651	9662	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71894032
9	NC_007294	TTCCAA	2	12	9826	9837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71894032
10	NC_007294	TTTTTA	2	12	10713	10724	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71894033
11	NC_007294	CCGTGT	2	12	12762	12773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71894034
12	NC_007294	TTTATC	2	12	16974	16985	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71894041
13	NC_007294	TTTTCT	2	12	18794	18805	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71894043
14	NC_007294	TGTTTT	2	12	19479	19490	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71894044
15	NC_007294	ACTCCT	2	12	19725	19736	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	71894044
16	NC_007294	ATGGGC	2	12	21984	21995	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	71894046
17	NC_007294	ATTTAA	2	12	23424	23435	50 %	50 %	0 %	0 %	71894047
18	NC_007294	ATTTTA	2	12	24505	24516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894047
19	NC_007294	TACCGC	2	12	24776	24787	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	71894047
20	NC_007294	GTAATG	2	12	28870	28881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71894051
21	NC_007294	TTTTAA	2	12	29288	29299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894051
22	NC_007294	TTAGGT	2	12	30260	30271	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71894052
23	NC_007294	AGTTAC	2	12	31422	31433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71894054
24	NC_007294	TTTAAA	2	12	33337	33348	50 %	50 %	0 %	0 %	71894057
25	NC_007294	ATTTAT	2	12	34319	34330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894057
26	NC_007294	AAATTA	2	12	36096	36107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894058
27	NC_007294	TGAAAC	2	12	37027	37038	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71894059
28	NC_007294	CTTTAG	2	12	40955	40966	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71894063
29	NC_007294	AAATTT	2	12	41475	41486	50 %	50 %	0 %	0 %	71894064
30	NC_007294	TTTAGA	2	12	42143	42154	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71894065
31	NC_007294	AAAATA	2	12	42219	42230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71894065
32	NC_007294	ACTAAT	2	12	44327	44338	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71894066
33	NC_007294	ATTTTT	2	12	45107	45118	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71894067
34	NC_007294	TTAAAT	2	12	47681	47692	50 %	50 %	0 %	0 %	71894070
35	NC_007294	CTTTAG	2	12	48723	48734	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71894071
36	NC_007294	TTCAAC	2	12	50215	50226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71894071
37	NC_007294	AAATGT	2	12	51833	51844	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71894074
38	NC_007294	ATCTTT	2	12	55131	55142	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71894079
39	NC_007294	TTTCTA	2	12	59464	59475	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71894081
40	NC_007294	AAAAGA	2	12	59543	59554	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71894081
41	NC_007294	TTTTGA	2	12	62584	62595	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71894083
42	NC_007294	TTTTAT	2	12	62988	62999	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71894084
43	NC_007294	AAATCT	2	12	68603	68614	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71894093
44	NC_007294	CTTCTA	2	12	70520	70531	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	71894093
45	NC_007294	TGATCC	2	12	71217	71228	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	71894094
46	NC_007294	TTTGTG	2	12	72205	72216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71894094
47	NC_007294	AAAAGC	2	12	72705	72716	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	71894094
48	NC_007294	AAATTT	2	12	74432	74443	50 %	50 %	0 %	0 %	71894097
49	NC_007294	TGATTT	2	12	75586	75597	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71894098
50	NC_007294	ACAAAA	2	12	80643	80654	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71894103
51	NC_007294	AAATCA	2	12	82506	82517	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71894104
52	NC_007294	AAAAAT	2	12	87214	87225	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71894108
53	NC_007294	TTTAAA	2	12	87309	87320	50 %	50 %	0 %	0 %	71894108
54	NC_007294	ATAAAA	2	12	89222	89233	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71894109
55	NC_007294	AAGTCA	2	12	89364	89375	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71894109
56	NC_007294	TAAAAT	2	12	89769	89780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894109
57	NC_007294	TTTTTG	2	12	90149	90160	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71894110
58	NC_007294	TAAAAA	2	12	91820	91831	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71894111
59	NC_007294	AGTATT	2	12	92044	92055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71894112
60	NC_007294	AAATTA	2	12	93945	93956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894114
61	NC_007294	AAAAGA	2	12	94159	94170	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71894114
62	NC_007294	TTTATC	2	12	94664	94675	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71894115
63	NC_007294	AAATTA	2	12	96946	96957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894116
64	NC_007294	TCTTTT	2	12	97017	97028	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71894117
65	NC_007294	AATTTT	2	12	97193	97204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894117
66	NC_007294	TAAATT	2	12	97919	97930	50 %	50 %	0 %	0 %	71894118
67	NC_007294	TGAAAT	2	12	100229	100240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71894122
68	NC_007294	ATTTAT	2	12	100572	100583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894123
69	NC_007294	TAAATT	2	12	103457	103468	50 %	50 %	0 %	0 %	71894125
70	NC_007294	TTCAAC	2	12	104981	104992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71894126
71	NC_007294	TAATAT	2	12	105959	105970	50 %	50 %	0 %	0 %	71894127
72	NC_007294	TGAAAT	2	12	106624	106635	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71894128
73	NC_007294	TCTTTT	2	12	111471	111482	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71894131
74	NC_007294	ATCAAT	2	12	111518	111529	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71894131
75	NC_007294	ATTTTT	2	12	111765	111776	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71894131
76	NC_007294	TTTTAT	2	12	114586	114597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71894133
77	NC_007294	TTTTTC	2	12	115307	115318	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71894134
78	NC_007294	AAATTA	2	12	116015	116026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894135
79	NC_007294	TAAAAA	2	12	116328	116339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71894135
80	NC_007294	TTAAAT	2	12	118961	118972	50 %	50 %	0 %	0 %	71894138
81	NC_007294	ATTCAA	2	12	119379	119390	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71894139
82	NC_007294	TTTAGA	2	12	120165	120176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71894140
83	NC_007294	TAAAGA	2	12	120198	120209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71894140
84	NC_007294	AAATAG	2	12	122091	122102	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71894142
85	NC_007294	ACTAAA	2	12	122518	122529	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71894143
86	NC_007294	AATTTA	2	12	123003	123014	50 %	50 %	0 %	0 %	161611235
87	NC_007294	CTAAAT	2	12	123426	123437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	161611235
88	NC_007294	TATTTT	2	12	124601	124612	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71894145
89	NC_007294	TTTTTA	2	12	125886	125897	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71894147
90	NC_007294	AAGATA	2	12	125986	125997	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71894147
91	NC_007294	TAAATT	2	12	128559	128570	50 %	50 %	0 %	0 %	71894151
92	NC_007294	CAAAGT	2	12	132128	132139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161611234
93	NC_007294	AAAAGA	2	12	132265	132276	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	161611234
94	NC_007294	TAAAAC	2	12	132697	132708	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	161611234
95	NC_007294	ATTTTT	2	12	133090	133101	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71894153
96	NC_007294	TTCAAC	2	12	133489	133500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71894153
97	NC_007294	TACAAT	2	12	133853	133864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71894153
98	NC_007294	ACTTTT	2	12	136002	136013	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71894155
99	NC_007294	GAAAAT	2	12	137388	137399	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71894156
100	NC_007294	TTCAAA	2	12	137460	137471	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71894157
101	NC_007294	CCATAT	2	12	137755	137766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71894157
102	NC_007294	TTGCCT	2	12	144301	144312	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	71894161
103	NC_007294	CTATTG	2	12	144949	144960	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71894161
104	NC_007294	TAAAAG	2	12	145453	145464	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71894161
105	NC_007294	TATAAA	2	12	146189	146200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894162
106	NC_007294	TTCATT	2	12	146392	146403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71894162
107	NC_007294	CACAAA	2	12	147528	147539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71894164
108	NC_007294	GCTAAA	2	12	148830	148841	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71894165
109	NC_007294	TTGAAT	2	12	148958	148969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71894165
110	NC_007294	TTGAAA	2	12	149556	149567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71894166
111	NC_007294	TATTTT	2	12	156699	156710	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71894173
112	NC_007294	ACTTGA	2	12	158782	158793	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71894175
113	NC_007294	AACTTC	2	12	159162	159173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71894175
114	NC_007294	ATTTTT	2	12	159216	159227	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71894175
115	NC_007294	TAATTC	2	12	160663	160674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71894176
116	NC_007294	TCATTT	2	12	163299	163310	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71894178
117	NC_007294	TTTAAA	2	12	164367	164378	50 %	50 %	0 %	0 %	71894179
118	NC_007294	GAAAAC	2	12	166916	166927	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	71894181
119	NC_007294	TTAAAG	2	12	167451	167462	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71894181
120	NC_007294	AATTGC	2	12	168436	168447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71894181
121	NC_007294	CTTCAA	2	12	171198	171209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71894183
122	NC_007294	GTTTTC	2	12	173978	173989	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	71894185
123	NC_007294	ACAATA	2	12	174567	174578	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71894187
124	NC_007294	CTCAAG	2	12	179100	179111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	71894189
125	NC_007294	GGAATT	2	12	179390	179401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71894189
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