MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma synoviae 53

Total Repeats: 329

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007294	GCAC	2	8	11113	11120	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007294	GTGG	2	8	11310	11317	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007294	AATT	2	8	11618	11625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007294	AATT	2	8	11980	11987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007294	TATT	2	8	13397	13404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007294	CTTT	2	8	25744	25751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007294	GAAA	2	8	34640	34647	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007294	AGCT	2	8	34844	34851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007294	AATT	2	8	35046	35053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007294	AAAT	2	8	35066	35073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007294	AAGA	2	8	35273	35280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007294	ATTT	2	8	35879	35886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007294	ATTA	3	12	39398	39409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007294	AATT	2	8	39449	39456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007294	ATTA	2	8	44058	44065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007294	TTTA	2	8	44066	44073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007294	CATT	2	8	54656	54663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007294	TAAT	2	8	57682	57689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007294	ATTT	2	8	57850	57857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007294	TTTA	2	8	67050	67057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007294	TAAA	2	8	70709	70716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007294	TTAC	2	8	72853	72860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007294	TTAC	2	8	72866	72873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007294	ATCA	2	8	77672	77679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007294	TGCA	2	8	78543	78550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007294	TGCA	2	8	78553	78560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007294	TTCG	2	8	78632	78639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007294	TTAT	2	8	81917	81924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007294	AAAG	2	8	84691	84698	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007294	TTTG	2	8	88139	88146	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007294	TAAT	2	8	88150	88157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007294	AAAT	2	8	91953	91960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007294	TAAT	2	8	102381	102388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007294	TTAT	2	8	103967	103974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007294	GCAT	2	8	109117	109124	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007294	ATAA	2	8	119038	119045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007294	ATTT	2	8	119176	119183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007294	AGCC	2	8	119242	119249	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007294	AAAT	2	8	126111	126118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007294	TATT	2	8	126350	126357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007294	ATTA	2	8	129378	129385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007294	AGGC	2	8	132831	132838	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007294	TGCT	2	8	132844	132851	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007294	ATTA	2	8	139155	139162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007294	CATT	2	8	139280	139287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007294	AATT	2	8	139456	139463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007294	ATTT	2	8	139581	139588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007294	CAAG	2	8	139992	139999	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007294	ATTT	2	8	140066	140073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007294	AATT	2	8	140086	140093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007294	TCTT	2	8	140492	140499	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007294	TAAA	2	8	142149	142156	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007294	TTTA	2	8	142177	142184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007294	TTTC	2	8	154310	154317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007294	TAAA	2	8	154433	154440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007294	TTCT	2	8	161093	161100	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007294	TTTA	2	8	161140	161147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007294	ATTT	2	8	162854	162861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007294	AAAG	2	8	172969	172976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007294	ATTT	2	8	173184	173191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007294	AATT	2	8	174209	174216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007294	TTTA	2	8	176258	176265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007294	AGTA	2	8	176471	176478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007294	ATTG	2	8	176600	176607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007294	AATG	2	8	176837	176844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007294	CAAA	2	8	177241	177248	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007294	AGCA	2	8	177471	177478	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007294	ATTT	2	8	177664	177671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007294	AAAT	2	8	177749	177756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007294	AAAT	2	8	177780	177787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007294	AATA	2	8	177792	177799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007294	TTTA	2	8	178048	178055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007294	GCTA	2	8	178135	178142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007294	TAAT	2	8	180831	180838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007294	TTAT	2	8	191571	191578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007294	ATTT	2	8	198820	198827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007294	AGAT	2	8	198876	198883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007294	AATT	2	8	210202	210209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007294	GTTA	2	8	213268	213275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007294	TTTA	2	8	213559	213566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007294	AATA	2	8	213577	213584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007294	ATTT	2	8	213745	213752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007294	AAAT	2	8	213758	213765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007294	ATTA	2	8	216195	216202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007294	AAAG	2	8	217141	217148	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007294	TTTA	2	8	225316	225323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007294	GTTT	2	8	227318	227325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007294	TTAA	2	8	227333	227340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007294	TAAA	2	8	227355	227362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007294	TAGT	2	8	227660	227667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007294	TTTC	2	8	227718	227725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007294	TTTC	2	8	228790	228797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007294	TTTC	2	8	229862	229869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007294	TTTC	2	8	235419	235426	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007294	GTTT	2	8	251958	251965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007294	ATTT	2	8	254478	254485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007294	ATTT	2	8	255975	255982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007294	TTAA	2	8	257614	257621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007294	ATTA	2	8	259006	259013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007294	AATT	2	8	259022	259029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007294	ATTT	2	8	261082	261089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007294	ATTT	2	8	262751	262758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007294	ATTT	2	8	265589	265596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007294	TTGC	2	8	266751	266758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007294	TAGT	2	8	272952	272959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007294	ATTT	2	8	283385	283392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007294	ATTA	2	8	289152	289159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007294	GCTA	2	8	289468	289475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007294	GTTT	2	8	289486	289493	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007294	CTTC	2	8	291351	291358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007294	ATTT	2	8	291583	291590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007294	TAAA	2	8	291720	291727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007294	ATTT	2	8	291757	291764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007294	ATTT	2	8	291889	291896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007294	TTAA	2	8	291961	291968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007294	ATTT	2	8	292127	292134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007294	TAAA	2	8	294552	294559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007294	AGGA	2	8	299776	299783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007294	AATT	2	8	302740	302747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007294	ATTT	2	8	302865	302872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007294	TATT	2	8	302911	302918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007294	TCTT	2	8	303143	303150	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007294	CAAG	2	8	303260	303267	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007294	ATTT	2	8	303334	303341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007294	AATT	2	8	303354	303361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007294	TCTT	3	12	303753	303764	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007294	ACAA	2	8	304171	304178	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007294	TTAA	2	8	304361	304368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007294	TTAT	2	8	304423	304430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007294	ATAA	2	8	304535	304542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007294	AATT	9	36	304769	304804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007294	ACTA	2	8	304808	304815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007294	TAAT	2	8	304922	304929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007294	TATT	2	8	305450	305457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007294	GGGC	2	8	305538	305545	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007294	GAAA	2	8	306733	306740	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007294	ATTT	2	8	307061	307068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007294	TATT	2	8	307107	307114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007294	CAAG	2	8	307457	307464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007294	ATTT	2	8	307531	307538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007294	AATT	2	8	307551	307558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007294	TCTT	2	8	307914	307921	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007294	ATTC	2	8	308254	308261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007294	TAAT	2	8	308408	308415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007294	ATAA	2	8	308494	308501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007294	AAAT	2	8	309848	309855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007294	AAAT	2	8	315727	315734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007294	AAAT	2	8	316131	316138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007294	AATT	2	8	316201	316208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007294	AAAT	2	8	317013	317020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_007294	AATT	2	8	318001	318008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_007294	ATAA	2	8	713483	713490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_007294	TTAT	2	8	729868	729875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_007294	AATA	2	8	736297	736304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_007294	AATT	2	8	754358	754365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_007294	GTTT	2	8	793146	793153	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.