MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN chromosome

Total Repeats: 304

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007292	CAAATG	2	12	967	978	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71891794
2	NC_007292	TTTATT	2	12	2775	2786	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71891795
3	NC_007292	TTTTAT	2	12	3369	3380	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71891795
4	NC_007292	TAGAAA	2	12	4579	4590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71891798
5	NC_007292	ATATTG	2	12	6308	6319	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71891799
6	NC_007292	GGAATA	2	12	6394	6405	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	71891800
7	NC_007292	AAAGAA	2	12	7614	7625	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71891801
8	NC_007292	TGTTGG	2	12	7838	7849	0 %	50 %	50 %	0 %	71891801
9	NC_007292	TCCATG	2	12	12068	12079	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	71891804
10	NC_007292	AACCAT	2	12	13034	13045	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	71891805
11	NC_007292	ATGTGA	2	12	14071	14082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891805
12	NC_007292	TTAAAG	2	12	14109	14120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71891805
13	NC_007292	ACTGAC	2	12	14245	14256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	71891805
14	NC_007292	ATTTAA	2	12	14595	14606	50 %	50 %	0 %	0 %	71891806
15	NC_007292	TGTTAT	2	12	18432	18443	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71891809
16	NC_007292	TATAGA	2	12	23304	23315	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71891813
17	NC_007292	TAACAA	2	12	24095	24106	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71891813
18	NC_007292	AAAAAC	2	12	27179	27190	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71891815
19	NC_007292	GTTATT	2	12	28727	28738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71891816
20	NC_007292	AATATT	2	12	33581	33592	50 %	50 %	0 %	0 %	71891819
21	NC_007292	CAAAAT	2	12	34312	34323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71891820
22	NC_007292	GATTCT	2	12	35084	35095	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71891821
23	NC_007292	ATTGAT	2	12	41647	41658	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71891825
24	NC_007292	GTATCT	2	12	43716	43727	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71891826
25	NC_007292	TTCATT	2	12	45234	45245	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71891827
26	NC_007292	AGATAA	2	12	46519	46530	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71891828
27	NC_007292	GTTATC	2	12	47079	47090	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71891828
28	NC_007292	TGTTAT	2	12	51569	51580	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71891833
29	NC_007292	ATTTTA	2	12	59838	59849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891839
30	NC_007292	CATATC	2	12	60811	60822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891840
31	NC_007292	TATAGA	2	12	61770	61781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71891841
32	NC_007292	CATAAA	2	12	65312	65323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71891844
33	NC_007292	ATTAGC	2	12	66886	66897	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71891845
34	NC_007292	ATATTT	2	12	71117	71128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891847
35	NC_007292	GTATGA	2	12	74743	74754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891852
36	NC_007292	ATCTAA	2	12	89087	89098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71891862
37	NC_007292	TATCAA	2	12	91141	91152	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71891862
38	NC_007292	AATTAA	2	12	97013	97024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891867
39	NC_007292	TAAAAA	2	12	99460	99471	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71891870
40	NC_007292	TAATGT	2	12	99480	99491	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71891870
41	NC_007292	GTAATA	2	12	100589	100600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71891871
42	NC_007292	TTTCAT	2	12	101081	101092	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71891871
43	NC_007292	ACAAGG	2	12	110673	110684	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	71891878
44	NC_007292	TTAAAT	2	12	111385	111396	50 %	50 %	0 %	0 %	71891878
45	NC_007292	AAGGAG	2	12	113449	113460	50 %	0 %	50 %	0 %	71891880
46	NC_007292	TAAGCA	2	12	114861	114872	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71891881
47	NC_007292	TAAGCA	2	12	114874	114885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71891881
48	NC_007292	TAGAAA	2	12	115174	115185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71891882
49	NC_007292	GGGTTT	2	12	118782	118793	0 %	50 %	50 %	0 %	71891886
50	NC_007292	TGTCGG	2	12	119113	119124	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	71891886
51	NC_007292	TGGTTT	2	12	121058	121069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891887
52	NC_007292	TTAATA	2	12	121994	122005	50 %	50 %	0 %	0 %	71891888
53	NC_007292	AGTATA	2	12	124491	124502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71891890
54	NC_007292	TGATAT	2	12	126725	126736	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71891891
55	NC_007292	TGGTAT	2	12	128186	128197	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71891891
56	NC_007292	CTAATG	2	12	131568	131579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71891895
57	NC_007292	ATTCAA	2	12	133134	133145	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71891896
58	NC_007292	TAATAT	2	12	137574	137585	50 %	50 %	0 %	0 %	71891898
59	NC_007292	ATTATC	2	12	138255	138266	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71891898
60	NC_007292	ACCATT	2	12	138660	138671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891898
61	NC_007292	AGGTGA	2	12	144103	144114	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	71891902
62	NC_007292	TTCAAA	2	12	144153	144164	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71891902
63	NC_007292	ATGGTT	2	12	148967	148978	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71891906
64	NC_007292	ATTGGC	2	12	149326	149337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71891906
65	NC_007292	TTTAGA	2	12	153279	153290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71891910
66	NC_007292	GTGAAT	2	12	154628	154639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891910
67	NC_007292	GTAGAT	2	12	155266	155277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891910
68	NC_007292	ATTTAA	2	12	155433	155444	50 %	50 %	0 %	0 %	71891910
69	NC_007292	TATTTC	2	12	157085	157096	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71891912
70	NC_007292	TATTAA	2	12	158791	158802	50 %	50 %	0 %	0 %	71891913
71	NC_007292	CTGTTC	2	12	159052	159063	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	71891914
72	NC_007292	TAATAT	2	12	162538	162549	50 %	50 %	0 %	0 %	71891916
73	NC_007292	AGTATC	2	12	164799	164810	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71891917
74	NC_007292	ATATTT	2	12	167015	167026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891919
75	NC_007292	GGGATA	2	12	168127	168138	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	71891920
76	NC_007292	AAAGCA	2	12	168868	168879	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	71891920
77	NC_007292	ATTAGC	2	12	171851	171862	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71891923
78	NC_007292	GGAAAA	2	12	175216	175227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891925
79	NC_007292	AAATAA	2	12	175236	175247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71891925
80	NC_007292	AATTGG	2	12	177893	177904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891928
81	NC_007292	TGCTCA	2	12	188700	188711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	71891935
82	NC_007292	TCTTTA	2	12	190193	190204	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71891936
83	NC_007292	TTTAGA	2	12	192028	192039	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71891938
84	NC_007292	CATTTA	2	12	194535	194546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71891939
85	NC_007292	TTTTTA	2	12	195387	195398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71891939
86	NC_007292	CATATG	2	12	197568	197579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71891941
87	NC_007292	CTGATT	2	12	209555	209566	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71891946
88	NC_007292	GCAGAA	2	12	211911	211922	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	71891947
89	NC_007292	TGAATT	2	12	217049	217060	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71891951
90	NC_007292	AAATGT	2	12	220670	220681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71891956
91	NC_007292	TTCTGA	2	12	220961	220972	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71891956
92	NC_007292	ATTTAA	2	12	225973	225984	50 %	50 %	0 %	0 %	71891959
93	NC_007292	AGGATT	2	12	227300	227311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891960
94	NC_007292	AAACAA	2	12	228616	228627	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71891962
95	NC_007292	ATTAAA	2	12	229016	229027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891963
96	NC_007292	AATGAA	2	12	230956	230967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71891965
97	NC_007292	ATTTGA	2	12	232632	232643	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71891966
98	NC_007292	AGAATT	2	12	232757	232768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71891966
99	NC_007292	ATGGAC	2	12	237426	237437	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71891969
100	NC_007292	ATTAAA	2	12	239778	239789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891971
101	NC_007292	GGTATT	2	12	239883	239894	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71891971
102	NC_007292	TAAAGG	2	12	243706	243717	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	71891975
103	NC_007292	ATTACT	2	12	249428	249439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71891987
104	NC_007292	GATCTA	2	12	252407	252418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71891994
105	NC_007292	ATTCCA	2	12	252511	252522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891994
106	NC_007292	TTAATT	2	12	253045	253056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891994
107	NC_007292	TTGTAG	2	12	253610	253621	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71891994
108	NC_007292	CCAGGA	2	12	254587	254598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71891997
109	NC_007292	ACTTTA	2	12	255702	255713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71891999
110	NC_007292	CAATAA	2	12	258196	258207	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71892002
111	NC_007292	TAAAAA	2	12	258921	258932	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71892003
112	NC_007292	AAATAG	2	12	261151	261162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71892005
113	NC_007292	CCTAAT	2	12	271491	271502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71892014
114	NC_007292	TTGGAT	2	12	272985	272996	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71892015
115	NC_007292	TGGTTT	2	12	273736	273747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71892017
116	NC_007292	ATAAAA	2	12	279472	279483	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71892021
117	NC_007292	CCAAAT	2	12	282414	282425	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	71892025
118	NC_007292	CCAAAA	2	12	282851	282862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71892025
119	NC_007292	GCACCC	2	12	283206	283217	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	71892025
120	NC_007292	ACACCA	2	12	283671	283682	50 %	0 %	0 %	50 %	71892025
121	NC_007292	TAAATT	2	12	288042	288053	50 %	50 %	0 %	0 %	71892027
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.