MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A large plasmid

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007274	AGGT	2	8	1982	1989	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007274	CCTA	2	8	5054	5061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007274	ATTG	2	8	5300	5307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007274	TTGG	2	8	5659	5666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007274	CAGC	2	8	6836	6843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007274	GCGA	2	8	6899	6906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007274	GTCT	2	8	7070	7077	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007274	GCAA	2	8	10775	10782	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007274	GCTC	2	8	10817	10824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007274	CAAT	2	8	10953	10960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007274	GGTG	2	8	11331	11338	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007274	CGGC	2	8	11359	11366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007274	CATC	2	8	11450	11457	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007274	TCAG	2	8	11502	11509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007274	ACCT	2	8	11732	11739	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007274	CAGG	2	8	12218	12225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007274	AGGT	2	8	13368	13375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007274	ACTG	2	8	13606	13613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007274	GATG	2	8	13659	13666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007274	CCCA	2	8	13703	13710	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_007274	GCCG	2	8	13750	13757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007274	ATTG	2	8	14385	14392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007274	CGAC	2	8	14686	14693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007274	CGAC	2	8	16798	16805	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007274	GATT	2	8	17180	17187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007274	CAAA	2	8	18155	18162	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007274	AGCA	2	8	18356	18363	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007274	GATT	2	8	19686	19693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007274	TCGC	2	8	19797	19804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007274	TAAT	2	8	24964	24971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007274	ACCG	2	8	26021	26028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007274	AGGT	2	8	31571	31578	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007274	ATCG	2	8	33633	33640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007274	TTGA	2	8	33833	33840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007274	GACA	2	8	34342	34349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007274	AGGT	2	8	38146	38153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007274	CTTG	2	8	40045	40052	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007274	GTCT	2	8	41223	41230	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007274	CATG	2	8	41565	41572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007274	CAAT	2	8	41582	41589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007274	GATG	2	8	41674	41681	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007274	AGGT	2	8	44160	44167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007274	CAAT	2	8	48268	48275	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007274	CCTT	2	8	50526	50533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007274	ACTT	2	8	51856	51863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007274	CAAT	2	8	56640	56647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007274	AAAT	2	8	57329	57336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007274	AATT	2	8	58700	58707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007274	CTGT	2	8	59421	59428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007274	GATG	2	8	59472	59479	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007274	CCTA	2	8	61824	61831	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007274	ATTG	2	8	62070	62077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007274	TTGG	2	8	62429	62436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007274	CAGC	2	8	63606	63613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007274	GAAA	2	8	64220	64227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007274	CAGT	2	8	64867	64874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007274	CTGG	2	8	64951	64958	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007274	AGGT	2	8	65639	65646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007274	CAGC	2	8	68820	68827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007274	ATTT	2	8	70112	70119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007274	AAGG	2	8	70134	70141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007274	TCTG	2	8	70640	70647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007274	CATC	2	8	70713	70720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007274	TCAG	2	8	70765	70772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007274	ACCT	2	8	70995	71002	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007274	TGAT	2	8	73451	73458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007274	CCAG	2	8	73534	73541	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007274	CTGA	2	8	75329	75336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007274	AGGA	2	8	76728	76735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007274	TTTG	2	8	77164	77171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007274	ATCC	2	8	78802	78809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007274	GTTG	2	8	83262	83269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007274	GTAA	2	8	83313	83320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007274	ATGC	2	8	83560	83567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007274	ACAA	2	8	83864	83871	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007274	CAAG	2	8	83962	83969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007274	AATT	2	8	85967	85974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007274	AAAT	2	8	88069	88076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007274	GGTC	2	8	94795	94802	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007274	GCCT	2	8	100003	100010	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007274	GCTG	2	8	101248	101255	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_007274	ACCT	2	8	101727	101734	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007274	AGCA	2	8	103883	103890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007274	CTAC	2	8	104550	104557	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007274	CCGA	2	8	104748	104755	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007274	GGTT	2	8	105930	105937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007274	ACCG	2	8	106280	106287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007274	CGCC	2	8	106920	106927	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_007274	TGCA	2	8	112252	112259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_007274	CTGA	2	8	112424	112431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007274	GAGC	2	8	120740	120747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007274	CGTG	2	8	121018	121025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007274	AGAA	2	8	122552	122559	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007274	GATA	2	8	122756	122763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007274	GATA	2	8	122837	122844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007274	CAAC	2	8	126683	126690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007274	CGCA	2	8	126771	126778	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.