MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 chromosome

Total Repeats: 840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007205	GTGCAT	2	12	1439	1450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	304570536
2	NC_007205	CATTTT	2	12	1527	1538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	304570536
3	NC_007205	CTTTTC	2	12	2116	2127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71082712
4	NC_007205	CTGGTC	2	12	3400	3411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71082712
5	NC_007205	AAAAAG	2	12	6396	6407	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71082715
6	NC_007205	AACGCT	2	12	7255	7266	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	71082716
7	NC_007205	TGGTAA	2	12	7340	7351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71082717
8	NC_007205	TTTCAA	2	12	7768	7779	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71082717
9	NC_007205	GCTTTA	2	12	8615	8626	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71082718
10	NC_007205	AGATTT	2	12	8866	8877	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71082718
11	NC_007205	TTTAGA	2	12	12892	12903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71082722
12	NC_007205	TTTAAG	2	12	13092	13103	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71082722
13	NC_007205	ATTTTT	2	12	13306	13317	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71082722
14	NC_007205	GCTGGC	2	12	16900	16911	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	71082724
15	NC_007205	GATAAA	2	12	17274	17285	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71082724
16	NC_007205	ATTCCA	2	12	17891	17902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71082725
17	NC_007205	AAATCA	2	12	18698	18709	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71082725
18	NC_007205	TCTTTT	2	12	19609	19620	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71082726
19	NC_007205	CTTTAT	2	12	20083	20094	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71082726
20	NC_007205	TTAAAT	2	12	21980	21991	50 %	50 %	0 %	0 %	71082728
21	NC_007205	TTTAAT	2	12	22922	22933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71082729
22	NC_007205	TCATAA	2	12	23503	23514	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71082730
23	NC_007205	ATAAAA	2	12	27272	27283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71082733
24	NC_007205	AAAAAT	2	12	27728	27739	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71082734
25	NC_007205	TAAAAA	2	12	28318	28329	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71082734
26	NC_007205	TTTAAA	2	12	28771	28782	50 %	50 %	0 %	0 %	71082735
27	NC_007205	CTTTAA	2	12	29082	29093	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71082735
28	NC_007205	AATTTA	2	12	29305	29316	50 %	50 %	0 %	0 %	71082735
29	NC_007205	CTAATG	2	12	30169	30180	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71082736
30	NC_007205	TTAAAT	2	12	30591	30602	50 %	50 %	0 %	0 %	71082736
31	NC_007205	TCAAAA	2	12	35873	35884	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71082740
32	NC_007205	TTTCTT	2	12	36233	36244	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71082740
33	NC_007205	GCTTTA	2	12	38147	38158	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71082741
34	NC_007205	ATTTAA	2	12	40401	40412	50 %	50 %	0 %	0 %	71082744
35	NC_007205	ATCAAT	2	12	43265	43276	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71082746
36	NC_007205	TGCAAT	2	12	43400	43411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71082746
37	NC_007205	CTAAAT	2	12	44821	44832	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71082747
38	NC_007205	ATTTAG	2	12	46666	46677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71082749
39	NC_007205	AGATAG	2	12	49356	49367	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	71082750
40	NC_007205	ATTAAA	2	12	49389	49400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71082750
41	NC_007205	AAAAAC	2	12	49981	49992	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71082750
42	NC_007205	CAACAT	2	12	51468	51479	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	304570537
43	NC_007205	TGATGT	2	12	54532	54543	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71082753
44	NC_007205	TTTAGC	2	12	55374	55385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71082754
45	NC_007205	TATCTG	2	12	56138	56149	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	304570538
46	NC_007205	AGTAGA	2	12	57105	57116	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	304570538
47	NC_007205	AATATT	2	12	58288	58299	50 %	50 %	0 %	0 %	71082756
48	NC_007205	AATTTT	2	12	63517	63528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71082759
49	NC_007205	TTTGAG	2	12	64831	64842	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71082760
50	NC_007205	ATTTTT	2	12	65811	65822	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71082762
51	NC_007205	ATTTAA	2	12	66617	66628	50 %	50 %	0 %	0 %	71082764
52	NC_007205	ACCTTT	2	12	68972	68983	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	71082768
53	NC_007205	TTCTTG	2	12	69782	69793	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	71082768
54	NC_007205	GTTTTT	2	12	69996	70007	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71082768
55	NC_007205	TCAAGT	2	12	70952	70963	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71082769
56	NC_007205	ATTCCA	2	12	70994	71005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71082769
57	NC_007205	CTTTTA	2	12	72588	72599	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71082771
58	NC_007205	TTTAAA	2	12	77343	77354	50 %	50 %	0 %	0 %	71082773
59	NC_007205	TAAAAA	2	12	79217	79228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71082774
60	NC_007205	TAAATT	2	12	79699	79710	50 %	50 %	0 %	0 %	71082775
61	NC_007205	TGATTT	2	12	79862	79873	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71082775
62	NC_007205	TCACCA	2	12	83370	83381	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	71082776
63	NC_007205	ACCAAA	2	12	83711	83722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71082776
64	NC_007205	ATTTCC	2	12	84851	84862	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	71082776
65	NC_007205	TCATTA	2	12	85579	85590	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71082777
66	NC_007205	TTCTTT	2	12	85892	85903	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71082778
67	NC_007205	TGGAGT	2	12	86998	87009	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	71082779
68	NC_007205	TCCAAT	2	12	87939	87950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71082780
69	NC_007205	TGTTTT	2	12	88000	88011	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71082780
70	NC_007205	TGAATA	2	12	91206	91217	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71082784
71	NC_007205	AAATCT	2	12	91401	91412	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71082784
72	NC_007205	TTAAAA	2	12	97576	97587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71082790
73	NC_007205	ATAAAA	2	12	98131	98142	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71082791
74	NC_007205	GAAAAA	2	12	98217	98228	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71082791
75	NC_007205	CTAAAG	2	12	99560	99571	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71082792
76	NC_007205	TTTAAT	2	12	99912	99923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71082792
77	NC_007205	AAAGAT	2	12	103760	103771	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71082797
78	NC_007205	ATTTTG	2	12	104504	104515	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71082798
79	NC_007205	TAAATT	2	12	106348	106359	50 %	50 %	0 %	0 %	71082800
80	NC_007205	GTTTAT	2	12	107859	107870	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71082802
81	NC_007205	ATCAAA	2	12	108222	108233	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71082803
82	NC_007205	AGCTGA	2	12	108697	108708	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71082803
83	NC_007205	ACCTTG	2	12	109125	109136	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	71082804
84	NC_007205	ATCAAA	2	12	109584	109595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71082805
85	NC_007205	TAAAAT	2	12	111554	111565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71082807
86	NC_007205	ATCCTT	2	12	115416	115427	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	71082812
87	NC_007205	TATTAA	2	12	118753	118764	50 %	50 %	0 %	0 %	71082814
88	NC_007205	GAATAA	2	12	120566	120577	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71082817
89	NC_007205	ATTCAT	2	12	122563	122574	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71082819
90	NC_007205	GAAATT	2	12	123735	123746	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71082820
91	NC_007205	GAAAGT	2	12	124293	124304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	71082821
92	NC_007205	AATAGA	2	12	125554	125565	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71082822
93	NC_007205	AAATAT	2	12	125680	125691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71082822
94	NC_007205	TGAAGA	2	12	125827	125838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	71082822
95	NC_007205	TGAAAA	2	12	126160	126171	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71082822
96	NC_007205	TTAATA	2	12	127276	127287	50 %	50 %	0 %	0 %	71082823
97	NC_007205	TGAGAT	2	12	128769	128780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71082826
98	NC_007205	TTAAGA	2	12	129521	129532	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71082828
99	NC_007205	TAGGTT	2	12	131529	131540	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71082829
100	NC_007205	AATTTT	2	12	133454	133465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71082831
101	NC_007205	AAAATT	2	12	135105	135116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71082833
102	NC_007205	AATAAA	2	12	135310	135321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71082833
103	NC_007205	ATTTTT	2	12	135338	135349	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71082833
104	NC_007205	AAATAT	2	12	137973	137984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71082837
105	NC_007205	GAAAAA	2	12	138883	138894	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71082838
106	NC_007205	ATGAAA	2	12	139334	139345	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71082838
107	NC_007205	TAAAAT	2	12	141839	141850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71082842
108	NC_007205	AAAACA	2	12	143285	143296	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71082843
109	NC_007205	TAAAAT	2	12	143950	143961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71082844
110	NC_007205	TGAGAT	2	12	144150	144161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71082844
111	NC_007205	AGTGCT	2	12	147095	147106	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71082849
112	NC_007205	TTAGTT	2	12	148792	148803	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71082851
113	NC_007205	AAAGAA	2	12	148999	149010	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71082851
114	NC_007205	TGAAAT	2	12	151589	151600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71082854
115	NC_007205	AATATT	2	12	151845	151856	50 %	50 %	0 %	0 %	71082854
116	NC_007205	CTGAAA	2	12	152299	152310	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71082854
117	NC_007205	ATATTA	2	12	154336	154347	50 %	50 %	0 %	0 %	71082856
118	NC_007205	ATATTA	2	12	154976	154987	50 %	50 %	0 %	0 %	71082857
119	NC_007205	ATTTTT	2	12	158143	158154	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71082861
120	NC_007205	TTAAAT	2	12	158412	158423	50 %	50 %	0 %	0 %	71082861
121	NC_007205	ACCATC	2	12	161306	161317	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	71082864
122	NC_007205	ATCATA	2	12	161447	161458	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71082864
123	NC_007205	ATTTTT	2	12	162050	162061	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71082864
124	NC_007205	GTGGTT	2	12	162854	162865	0 %	50 %	50 %	0 %	71082865
125	NC_007205	TTAAAG	2	12	165858	165869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71082868
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127	NC_007205	CTTTTT	2	12	167765	167776	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71082870
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233	NC_007205	ATTAAT	2	12	338029	338040	50 %	50 %	0 %	0 %	71083053
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238	NC_007205	GATTTT	2	12	345512	345523	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71083058
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356	NC_007205	TTCCTC	2	12	525269	525280	0 %	50 %	0 %	50 %	71083237
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