MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 chromosome

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007205	ATTAT	2	10	41767	41776	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007205	ATTTA	2	10	53047	53056	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007205	ATTTT	2	10	64562	64571	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007205	TTTTA	2	10	76253	76262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007205	AAATT	2	10	78544	78553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007205	GTTAA	2	10	144231	144240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007205	ATTTA	2	10	146069	146078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007205	TTAAT	2	10	218147	218156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007205	TAATT	2	10	283640	283649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007205	TAATT	2	10	289521	289530	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007205	TTTAA	2	10	314985	314994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007205	ATTTA	2	10	339580	339589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007205	TAAAA	2	10	341562	341571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007205	TTAAA	2	10	385281	385290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007205	ATTTA	2	10	398707	398716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007205	CACAA	2	10	398851	398860	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_007205	TTTTA	2	10	457542	457551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007205	TTATT	2	10	462446	462455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007205	AAATA	2	10	466675	466684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007205	TATAA	2	10	467120	467129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007205	TTTTA	2	10	511132	511141	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007205	TTCGG	2	10	512325	512334	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007205	TCGTG	2	10	512372	512381	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007205	ATATT	2	10	516263	516272	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007205	TAATA	2	10	610529	610538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007205	TTGTT	2	10	622392	622401	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007205	TCAAT	2	10	641828	641837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007205	AAATA	2	10	675154	675163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007205	ATCTT	2	10	688737	688746	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007205	TAGTA	2	10	703381	703390	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007205	TGTAT	2	10	722497	722506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007205	ATATT	2	10	741070	741079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007205	TTTAA	2	10	745589	745598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007205	AAATA	2	10	762132	762141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007205	TAATT	2	10	783235	783244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007205	AAATA	2	10	813986	813995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007205	TAGTT	2	10	829842	829851	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007205	CAATT	2	10	833212	833221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007205	ATTTA	2	10	839857	839866	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007205	TTATA	2	10	840668	840677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007205	TTAAA	2	10	873195	873204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007205	ATCAA	2	10	921919	921928	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_007205	ATTTT	2	10	936239	936248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007205	ATTAA	2	10	941163	941172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007205	CTCTC	2	10	942611	942620	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_007205	TAAAT	2	10	942625	942634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007205	TGTTA	2	10	948656	948665	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007205	TAACA	2	10	948666	948675	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007205	TAATA	2	10	951556	951565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007205	TAAAA	2	10	990246	990255	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007205	TTTAG	2	10	998945	998954	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007205	TTTTA	3	15	1000251	1000265	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007205	ATATA	2	10	1000371	1000380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007205	TTTTA	2	10	1119270	1119279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007205	TTAAT	2	10	1139028	1139037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007205	TTTCT	2	10	1153875	1153884	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007205	TTTAA	2	10	1178179	1178188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007205	AATTA	2	10	1210012	1210021	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007205	TTTAT	2	10	1274058	1274067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007205	GGAAT	2	10	1277470	1277479	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.