MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 chromosome

Total Repeats: 242

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007205	CTTT	2	8	31	38	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007205	TTTA	2	8	66	73	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007205	TTCG	2	8	10389	10396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007205	TTAA	2	8	39025	39032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007205	TGGT	2	8	41826	41833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007205	ATTT	2	8	62250	62257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007205	ATTA	2	8	62285	62292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007205	TAAA	2	8	66480	66487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007205	TAAA	2	8	75779	75786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007205	ATTT	2	8	76132	76139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007205	TATT	2	8	76494	76501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007205	ATTT	2	8	76969	76976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007205	TAAA	2	8	77089	77096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007205	TACA	2	8	89745	89752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007205	CTTT	2	8	106417	106424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007205	AGAA	2	8	106720	106727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007205	GCTG	2	8	106749	106756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007205	AACA	2	8	120136	120143	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007205	AAAT	2	8	145332	145339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007205	TAAG	2	8	168308	168315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007205	AATT	2	8	177901	177908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007205	TTAA	2	8	184335	184342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007205	TTAT	2	8	194350	194357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007205	TTTA	2	8	194358	194365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007205	TATT	2	8	194369	194376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007205	TAAT	2	8	198515	198522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007205	ATTA	2	8	205777	205784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007205	ATTT	2	8	212572	212579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007205	TAAA	2	8	218165	218172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007205	TAAA	2	8	225400	225407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007205	TTAA	2	8	232198	232205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007205	ATAA	2	8	239849	239856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007205	AATA	2	8	260325	260332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007205	TTAA	2	8	268330	268337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007205	TGGT	2	8	275097	275104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007205	ATAG	2	8	289620	289627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007205	AATT	2	8	289651	289658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007205	TTTA	2	8	291697	291704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007205	CAAA	2	8	299284	299291	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007205	TAAA	2	8	300846	300853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007205	ATAA	2	8	309635	309642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007205	GTAA	2	8	312772	312779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007205	TCAA	2	8	319682	319689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007205	ATTA	2	8	321525	321532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007205	ATTT	2	8	321538	321545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007205	ATTA	2	8	328079	328086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007205	ATTA	2	8	331160	331167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007205	TAAA	2	8	335591	335598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007205	AATT	2	8	335674	335681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007205	CTAA	2	8	339778	339785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007205	TATT	2	8	339839	339846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007205	TTAA	2	8	343007	343014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007205	ATTA	2	8	351234	351241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007205	ATTA	2	8	369663	369670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007205	AAAG	2	8	372286	372293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007205	AAAT	2	8	382925	382932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007205	TTTA	2	8	385325	385332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007205	TCAA	2	8	398591	398598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007205	TATT	2	8	398757	398764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007205	TAAT	2	8	404785	404792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007205	TATT	2	8	406238	406245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007205	TAAA	2	8	410376	410383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007205	AATT	2	8	410417	410424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007205	TTAA	2	8	415511	415518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007205	ATTT	2	8	416780	416787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007205	ATTT	2	8	422969	422976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007205	TTGT	2	8	423003	423010	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007205	CTTA	2	8	430549	430556	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007205	AATT	2	8	430622	430629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007205	TTAA	2	8	441156	441163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007205	TTTA	2	8	441187	441194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007205	CTTT	2	8	449755	449762	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007205	CAAC	2	8	450031	450038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007205	ATTT	2	8	461554	461561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007205	ATAA	2	8	466695	466702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007205	TACA	2	8	467055	467062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007205	TATT	2	8	467112	467119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007205	TTAA	2	8	473810	473817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007205	TAAT	2	8	487642	487649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007205	ATTA	2	8	487755	487762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007205	TTAA	2	8	488293	488300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007205	TGTT	2	8	498528	498535	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007205	TTAA	3	12	498680	498691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007205	ATTA	2	8	502391	502398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007205	TAAA	2	8	502418	502425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007205	TATT	2	8	511081	511088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007205	ATTT	2	8	511102	511109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007205	CGAA	2	8	511420	511427	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007205	GTGA	2	8	511730	511737	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007205	AGAA	2	8	512010	512017	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007205	ATTT	2	8	512140	512147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007205	TAAA	2	8	513117	513124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007205	TGTA	2	8	513328	513335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007205	GCGA	2	8	513485	513492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007205	AAGC	2	8	513822	513829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007205	CCAA	2	8	514012	514019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007205	AATA	2	8	514068	514075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007205	CAGA	2	8	514166	514173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007205	TCGT	2	8	515420	515427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007205	GCCT	2	8	515445	515452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007205	TTTG	2	8	516166	516173	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007205	TAAA	2	8	516177	516184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007205	TCTA	2	8	516283	516290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007205	TTTA	2	8	516327	516334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007205	TTAA	2	8	520872	520879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007205	ATAA	3	12	520907	520918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007205	TAAT	2	8	528151	528158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007205	AATT	2	8	531399	531406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007205	ATTT	2	8	555053	555060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007205	TTTA	2	8	559094	559101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007205	TAAT	2	8	586046	586053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007205	TATT	2	8	593360	593367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007205	CAAA	2	8	594481	594488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007205	TATT	2	8	601255	601262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007205	ATTG	2	8	610515	610522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007205	AGTA	2	8	614152	614159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007205	CAAG	2	8	618518	618525	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007205	ATAA	2	8	618571	618578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007205	ACAA	2	8	649808	649815	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007205	TTAA	2	8	668611	668618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007205	ATTT	2	8	676222	676229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007205	TAAT	2	8	707748	707755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007205	TAAT	2	8	707777	707784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007205	TTTG	2	8	713690	713697	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007205	TCAA	2	8	716122	716129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007205	ATCA	2	8	730490	730497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007205	TATT	2	8	741062	741069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007205	ATAA	2	8	741955	741962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007205	ATTT	2	8	742345	742352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007205	TAAA	2	8	743841	743848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007205	AATC	2	8	745608	745615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007205	ATTA	2	8	745679	745686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007205	ATTA	2	8	745691	745698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007205	ATTT	2	8	762905	762912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007205	CTAA	2	8	762986	762993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007205	TTTA	2	8	762995	763002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007205	ATAA	2	8	770688	770695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007205	TTTA	2	8	776305	776312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007205	ACAA	2	8	777228	777235	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007205	ATTT	2	8	782257	782264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007205	AAAT	2	8	783353	783360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007205	AAAT	2	8	783394	783401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007205	ACTG	2	8	786521	786528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007205	ATTA	2	8	790203	790210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007205	ATTT	2	8	791470	791477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007205	ATTT	2	8	794882	794889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007205	TAAA	2	8	804683	804690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007205	ATTT	2	8	808243	808250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007205	TTTG	3	12	812087	812098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007205	AATT	2	8	828580	828587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007205	ATTT	2	8	828622	828629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007205	TTAA	2	8	829914	829921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.