MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007181	ACCGGA	2	12	287	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70605854
2	NC_007181	CTTCCT	2	12	2708	2719	0 %	50 %	0 %	50 %	70605857
3	NC_007181	CTCTTG	2	12	2831	2842	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	70605857
4	NC_007181	ACTTCA	2	12	3374	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605858
5	NC_007181	GGCTAA	2	12	6987	6998	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	70605863
6	NC_007181	TTTTAA	2	12	8080	8091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605864
7	NC_007181	AGGCAA	2	12	8953	8964	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	70605865
8	NC_007181	AACTCA	2	12	13223	13234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70605872
9	NC_007181	AGCTGC	2	12	13536	13547	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	70605874
10	NC_007181	CTAAAG	2	12	18645	18656	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	70605879
11	NC_007181	CGTCCT	2	12	23747	23758	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	70605888
12	NC_007181	TTTCAA	2	12	27357	27368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	70605893
13	NC_007181	CATAAA	2	12	28053	28064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007181	TAATAG	2	12	29723	29734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70605897
15	NC_007181	TTTCTT	2	12	31520	31531	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	70605899
16	NC_007181	TTTTCC	2	12	31627	31638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605899
17	NC_007181	TTGTTC	2	12	36726	36737	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	70605904
18	NC_007181	CTCTTT	2	12	36798	36809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605904
19	NC_007181	CTCTTT	2	12	37764	37775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605904
20	NC_007181	TCCAAA	2	12	44521	44532	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70605911
21	NC_007181	TGTGTT	2	12	51129	51140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70605918
22	NC_007181	GGAAAG	2	12	52490	52501	50 %	0 %	50 %	0 %	70605919
23	NC_007181	ACAAGA	2	12	53650	53661	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	70605921
24	NC_007181	TAATTC	2	12	56410	56421	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	70605924
25	NC_007181	GAGAGG	2	12	62861	62872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70605930
26	NC_007181	AGAACT	2	12	62930	62941	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	70605930
27	NC_007181	CCTGGA	2	12	63845	63856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	70605932
28	NC_007181	TTTCTC	2	12	68512	68523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007181	GCAATT	2	12	68840	68851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	70605941
30	NC_007181	TAATGA	2	12	70074	70085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70605942
31	NC_007181	GTTCAT	2	12	72503	72514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007181	TGGTTA	2	12	74624	74635	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	70605945
33	NC_007181	CTTTAC	2	12	78314	78325	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	70605952
34	NC_007181	CTTCTC	2	12	82000	82011	0 %	50 %	0 %	50 %	70605957
35	NC_007181	TGTAAA	2	12	84371	84382	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70605961
36	NC_007181	TAAAAC	2	12	85083	85094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007181	TAATTA	2	12	85454	85465	50 %	50 %	0 %	0 %	70605962
38	NC_007181	GAAAAA	2	12	88502	88513	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	70605966
39	NC_007181	TCTTTA	2	12	90594	90605	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	70605967
40	NC_007181	AATTCA	2	12	91736	91747	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	70605969
41	NC_007181	TCTCCT	2	12	96147	96158	0 %	50 %	0 %	50 %	70605972
42	NC_007181	AAGGGG	2	12	98095	98106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70605973
43	NC_007181	CTTTCT	2	12	100947	100958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605975
44	NC_007181	AGGGAA	2	12	101189	101200	50 %	0 %	50 %	0 %	70605975
45	NC_007181	ATAAAA	2	12	105221	105232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	70605980
46	NC_007181	ATAAAT	2	12	109633	109644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007181	TATATT	2	12	109888	109899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007181	GCTTCC	2	12	115522	115533	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	70605989
49	NC_007181	ATTTTA	2	12	116183	116194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605991
50	NC_007181	CTTTTC	2	12	116829	116840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605991
51	NC_007181	GCGGAA	2	12	121304	121315	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	70605995
52	NC_007181	TACTGC	2	12	123215	123226	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	70605996
53	NC_007181	GTTTAC	2	12	125008	125019	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	70605998
54	NC_007181	TGATAT	2	12	125820	125831	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70605999
55	NC_007181	ATGGCA	2	12	126601	126612	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	70605999
56	NC_007181	ATATTT	2	12	130110	130121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007181	TAATGA	2	12	132254	132265	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70606007
58	NC_007181	AAATAT	2	12	135314	135325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007181	AAAGTA	2	12	138227	138238	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007181	TCATAA	2	12	141693	141704	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	70606018
61	NC_007181	AACGAA	2	12	143603	143614	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	70606020
62	NC_007181	TTAGTG	2	12	151578	151589	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	70606028
63	NC_007181	AGGAAA	2	12	156372	156383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606034
64	NC_007181	ACAAGA	2	12	158381	158392	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	70606037
65	NC_007181	TTTAGT	2	12	164802	164813	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	70606044
66	NC_007181	TATTTT	2	12	166147	166158	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	70606046
67	NC_007181	TTTGGG	2	12	168025	168036	0 %	50 %	50 %	0 %	70606048
68	NC_007181	AGGCTA	2	12	170194	170205	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	70606050
69	NC_007181	GATTAT	2	12	175414	175425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70606055
70	NC_007181	CGTGAC	2	12	177132	177143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	70606056
71	NC_007181	TCGCTT	2	12	179098	179109	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	70606059
72	NC_007181	GGATGA	2	12	185409	185420	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007181	TCTTAA	2	12	186521	186532	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	70606067
74	NC_007181	CAGGTT	2	12	187909	187920	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	70606068
75	NC_007181	GAGTTC	2	12	189197	189208	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	70606069
76	NC_007181	AATGAG	2	12	206834	206845	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	70606086
77	NC_007181	TCAGTT	2	12	207568	207579	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	70606087
78	NC_007181	ACCTGT	2	12	208668	208679	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	70606088
79	NC_007181	TTTACC	2	12	225902	225913	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	70606106
80	NC_007181	TCTTAT	2	12	227872	227883	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	70606109
81	NC_007181	CAAATC	2	12	232458	232469	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70606114
82	NC_007181	AATAAA	2	12	238943	238954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	70606120
83	NC_007181	CTAAAG	2	12	239835	239846	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	70606121
84	NC_007181	CCATTA	2	12	241502	241513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606124
85	NC_007181	CTTTTC	2	12	244274	244285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606128
86	NC_007181	TCTTTT	2	12	247077	247088	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	70606131
87	NC_007181	CTTTAG	2	12	248845	248856	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	70606133
88	NC_007181	CTAAAA	2	12	256968	256979	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	70606140
89	NC_007181	TTTTAA	2	12	263527	263538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007181	TTATTG	2	12	265699	265710	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	70606150
91	NC_007181	TGTAGG	2	12	269260	269271	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	70606154
92	NC_007181	GTTATA	2	12	269630	269641	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70606155
93	NC_007181	TTCCCT	2	12	270727	270738	0 %	50 %	0 %	50 %	70606155
94	NC_007181	TATGAA	2	12	284312	284323	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70606170
95	NC_007181	GTATTC	2	12	285168	285179	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	70606171
96	NC_007181	TTTGTT	2	12	288176	288187	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007181	AGAAAA	2	12	288329	288340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	70606176
98	NC_007181	TTAAAT	2	12	292319	292330	50 %	50 %	0 %	0 %	70606182
99	NC_007181	CTCTTT	2	12	295691	295702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606186
100	NC_007181	AAACAA	2	12	298612	298623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007181	TTAGAG	2	12	298689	298700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606191
102	NC_007181	CCAAAT	2	12	301075	301086	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70606195
103	NC_007181	CTGTTA	2	12	303389	303400	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	70606199
104	NC_007181	TACCCA	2	12	304192	304203	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	70606199
105	NC_007181	TGCCTT	2	12	311210	311221	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	70606206
106	NC_007181	AGGTAG	2	12	318960	318971	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	70606211
107	NC_007181	CCTTTT	2	12	322324	322335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606212
108	NC_007181	ATGAAT	2	12	326768	326779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70606217
109	NC_007181	GATCAA	2	12	327927	327938	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	70606219
110	NC_007181	TTCTAT	2	12	329714	329725	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	70606221
111	NC_007181	AAAAGG	2	12	330504	330515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606222
112	NC_007181	GACTTA	2	12	331990	332001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	70606223
113	NC_007181	ATCCGT	2	12	333036	333047	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	70606225
114	NC_007181	TAAACC	2	12	334266	334277	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70606227
115	NC_007181	CATTAA	2	12	335520	335531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	70606229
116	NC_007181	TAATTT	2	12	340154	340165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606236
117	NC_007181	AAAGTC	2	12	340323	340334	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	70606236
118	NC_007181	TTAAAA	2	12	342853	342864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606238
119	NC_007181	TAAAAT	2	12	342939	342950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007181	AAAGCC	2	12	343404	343415	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	70606239
121	NC_007181	TAACTT	2	12	348530	348541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007181	GTAGAT	2	12	354467	354478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606251
123	NC_007181	TGGATG	2	12	355675	355686	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	70606253
124	NC_007181	CCTCCA	2	12	356054	356065	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	70606253
125	NC_007181	AAATGC	2	12	356263	356274	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	70606253
126	NC_007181	AGGTAA	2	12	356863	356874	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	70606254
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129	NC_007181	CAGTGA	2	12	362263	362274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	70606259
130	NC_007181	GAAGGA	2	12	366808	366819	50 %	0 %	50 %	0 %	70606264
131	NC_007181	GTAATA	2	12	367702	367713	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70606264
132	NC_007181	ATCCAT	2	12	368446	368457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606265
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140	NC_007181	AAATTA	2	12	384867	384878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007181	TTCTAG	2	12	387602	387613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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145	NC_007181	GAAACA	2	12	404826	404837	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_007181	AAGAGG	2	12	406661	406672	50 %	0 %	50 %	0 %	70606316
147	NC_007181	AACTAC	2	12	406811	406822	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70606316
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150	NC_007181	CCAACT	2	12	410634	410645	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007181	CAGCTG	2	12	411262	411273	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_007181	ATGACT	2	12	412746	412757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	70606324
153	NC_007181	CTTTTC	2	12	413060	413071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_007181	TTCGCT	2	12	413425	413436	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	70606325
155	NC_007181	AAGACC	2	12	413813	413824	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_007181	GAGAAA	3	18	425813	425830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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200	NC_007181	CCTCAT	2	12	519277	519288	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	70606461
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228	NC_007181	ACGCTT	2	12	579882	579893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
229	NC_007181	GAACGC	2	12	581137	581148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606525
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232	NC_007181	ATAACG	2	12	582013	582024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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241	NC_007181	AACTCA	2	12	593957	593968	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_007181	ATAAGG	2	12	594322	594333	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
243	NC_007181	TCCTCT	2	12	596786	596797	0 %	50 %	0 %	50 %	70606545
244	NC_007181	ATATCT	2	12	596972	596983	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	70606545
245	NC_007181	ACTCTG	2	12	597857	597868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_007181	TATAAA	2	12	598875	598886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606547
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248	NC_007181	TACAGT	2	12	605866	605877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	70606556
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261	NC_007181	AGAAGG	2	12	636267	636278	50 %	0 %	50 %	0 %	70606588
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340	NC_007181	TTAATT	2	12	858150	858161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NC_007181	TGCAGT	2	12	869328	869339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	70606845
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351	NC_007181	AAATTC	2	12	895194	895205	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	70606873
352	NC_007181	GGCTAA	2	12	903949	903960	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	70606878
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355	NC_007181	TTTAGT	2	12	906218	906229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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357	NC_007181	TACTTT	2	12	908223	908234	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	70606882
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472	NC_007181	AGGGTA	2	12	1192084	1192095	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	70607149
473	NC_007181	CTGCTC	2	12	1193702	1193713	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	70607154
474	NC_007181	ATTTCG	2	12	1195725	1195736	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	70607155
475	NC_007181	AATTAT	2	12	1195737	1195748	50 %	50 %	0 %	0 %	70607155
476	NC_007181	ATATCT	2	12	1195860	1195871	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	70607155
477	NC_007181	CTTCTC	2	12	1196185	1196196	0 %	50 %	0 %	50 %	70607155
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499	NC_007181	ATTTTT	2	12	1263817	1263828	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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