MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 chromosome

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007168	TTTAAA	2	12	3358	3369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007168	TTAAAA	2	12	3452	3463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007168	TAAATT	2	12	66009	66020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007168	AAAAAT	2	12	96734	96745	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007168	AGTATA	2	12	108227	108238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007168	TTAATT	2	12	108730	108741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007168	TTTATT	2	12	122971	122982	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007168	AGTGAT	2	12	122996	123007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007168	TGATTT	2	12	125134	125145	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007168	TAAATA	2	12	134445	134456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007168	TTTGTT	2	12	168188	168199	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007168	ATTCTA	2	12	195448	195459	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007168	GAATAA	2	12	226669	226680	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007168	ATTTAT	2	12	236378	236389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007168	TCTTTT	2	12	240800	240811	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007168	TGTTTT	2	12	276268	276279	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007168	AAATAG	2	12	277752	277763	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007168	TAAAGA	2	12	313257	313268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007168	TTATAA	2	12	318048	318059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007168	ATTTTT	2	12	326316	326327	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007168	GTAAAA	2	12	350285	350296	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007168	AATGAA	2	12	385794	385805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007168	TGATTT	2	12	456263	456274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007168	ACTAAA	2	12	467586	467597	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007168	GGTACA	2	12	489722	489733	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007168	TAAATT	2	12	497862	497873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007168	AAATAT	2	12	500952	500963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007168	GTCATA	2	12	507743	507754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007168	TTATTT	2	12	517000	517011	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007168	TTGAAT	2	12	527959	527970	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007168	TAAATT	2	12	544030	544041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007168	TCGAAA	2	12	566444	566455	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007168	AATACA	2	12	592461	592472	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007168	TTAAAA	2	12	606070	606081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007168	TTAATA	2	12	611246	611257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007168	ATTGAA	2	12	623996	624007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007168	TATAAT	2	12	631803	631814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007168	TTAAAA	2	12	631838	631849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007168	TTGAAT	2	12	639124	639135	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007168	ATCTCA	2	12	646155	646166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007168	TAAAAA	2	12	691073	691084	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007168	AGAATA	2	12	691615	691626	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007168	TAATAG	2	12	715641	715652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007168	GTCTTC	2	12	732515	732526	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007168	ACACAT	2	12	733501	733512	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007168	ATTTTT	2	12	757786	757797	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007168	TTATTT	2	12	771764	771775	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007168	TGCAAC	2	12	772622	772633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007168	ATTTAT	2	12	777472	777483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007168	TTTAAA	2	12	801876	801887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007168	TATAAT	2	12	805594	805605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007168	TTAAAT	2	12	806904	806915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007168	AAAAGA	2	12	807003	807014	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007168	TAAAAA	2	12	819102	819113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007168	ATTGTT	2	12	831923	831934	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007168	ATTCAT	2	12	835224	835235	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007168	ATAAAA	2	12	843670	843681	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007168	TTATAT	2	12	868171	868182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007168	ATTGAA	2	12	891186	891197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007168	TTAAGA	2	12	904429	904440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007168	ATTTAA	2	12	904536	904547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007168	TTTATA	2	12	920032	920043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007168	AATAAA	2	12	941770	941781	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007168	AAAAAG	2	12	955572	955583	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007168	TTTAAA	2	12	994931	994942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007168	TATATT	2	12	995654	995665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007168	GTAAAA	2	12	1013862	1013873	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007168	TTTTAC	2	12	1018642	1018653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007168	TAAAAA	2	12	1023752	1023763	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007168	TAATTT	2	12	1025807	1025818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007168	AATTTT	2	12	1056743	1056754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007168	ATTATA	2	12	1063704	1063715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007168	GAATCA	2	12	1091492	1091503	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007168	TGGTTC	2	12	1091516	1091527	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007168	TTTTAC	2	12	1101557	1101568	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007168	AGTGGG	2	12	1102391	1102402	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007168	ACAAAA	2	12	1122480	1122491	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007168	TTATAA	2	12	1142059	1142070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007168	CATATA	2	12	1152751	1152762	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007168	TGATAT	2	12	1158442	1158453	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007168	TTTTAA	2	12	1166158	1166169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007168	ATTTAT	2	12	1187579	1187590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007168	GTTTTT	2	12	1225569	1225580	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007168	ATTTAA	2	12	1225641	1225652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007168	CTTTTT	2	12	1235500	1235511	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007168	TTTTAT	2	12	1238256	1238267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007168	TATAAT	2	12	1247658	1247669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007168	AATGAA	2	12	1266861	1266872	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007168	TTTATG	2	12	1332005	1332016	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007168	TATAAG	2	12	1341956	1341967	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007168	AGTCAA	2	12	1372031	1372042	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_007168	ATTATA	2	12	1413252	1413263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007168	TAATTT	2	12	1422195	1422206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007168	ATTTTA	2	12	1424609	1424620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007168	TAATTT	2	12	1457967	1457978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007168	ATTTTC	2	12	1462479	1462490	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007168	ATCATT	2	12	1465109	1465120	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_007168	TATATT	2	12	1487343	1487354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007168	AACATC	2	12	1499401	1499412	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007168	ATTTTA	2	12	1520196	1520207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007168	CTATTT	2	12	1531081	1531092	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007168	GTAAAA	2	12	1536037	1536048	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007168	ATTAAA	2	12	1537469	1537480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007168	AATATG	2	12	1601271	1601282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007168	TAAAAT	2	12	1630171	1630182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007168	AAATTA	2	12	1631703	1631714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007168	TAAATT	2	12	1640170	1640181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007168	TTTTTC	2	12	1641480	1641491	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007168	ATGATA	2	12	1642476	1642487	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007168	CAATTT	2	12	1642549	1642560	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007168	GTAAAA	2	12	1653759	1653770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007168	TTTTAC	2	12	1658273	1658284	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007168	AGTTTA	2	12	1672769	1672780	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007168	TATCAT	2	12	1677431	1677442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007168	CAAATA	2	12	1685959	1685970	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_007168	TTTTGT	2	12	1719859	1719870	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007168	TATTTA	2	12	1750958	1750969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007168	ACTTAT	2	12	1777436	1777447	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007168	TTAAAA	2	12	1778123	1778134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007168	TTGCAC	2	12	1806603	1806614	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007168	AATATT	2	12	1856084	1856095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007168	TATGCA	2	12	1874151	1874162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007168	TTTTTA	2	12	1925405	1925416	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007168	GTAAAA	2	12	1950839	1950850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007168	ATTTTT	2	12	1953744	1953755	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007168	TCCGTT	2	12	1974318	1974329	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007168	AATATC	2	12	1984781	1984792	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_007168	TAAATT	2	12	1989703	1989714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007168	ATTAAA	2	12	2010522	2010533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007168	GAATTT	2	12	2024197	2024208	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.