MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 chromosome

Total Repeats: 1263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007168	AAGTTG	2	12	3197	3208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
2	NC_007168	TAGAAA	2	12	5812	5823	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	70725006
3	NC_007168	CACGTG	2	12	6199	6210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	70725006
4	NC_007168	GTTATC	2	12	7355	7366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	70725007
5	NC_007168	TGAAGA	2	12	8886	8897	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	70725007
6	NC_007168	TAGAAG	2	12	9395	9406	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	70725007
7	NC_007168	TCTTTG	2	12	10096	10107	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	70725008
8	NC_007168	ATTAGA	2	12	11423	11434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70725009
9	NC_007168	TAAAGG	2	12	18421	18432	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	70725015
10	NC_007168	TTGAAG	2	12	18618	18629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725015
11	NC_007168	AGCAAA	2	12	19064	19075	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	70725016
12	NC_007168	TGATTG	2	12	19997	20008	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	70725016
13	NC_007168	GATGAC	2	12	20278	20289	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	70725016
14	NC_007168	TGAAAT	2	12	20328	20339	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70725016
15	NC_007168	AAGGTA	2	12	20766	20777	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	70725017
16	NC_007168	ATGAAG	2	12	24890	24901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	70725019
17	NC_007168	TGAACG	2	12	25002	25013	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	70725019
18	NC_007168	CAAGTT	2	12	30007	30018	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	70725025
19	NC_007168	GTTTAA	2	12	30348	30359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70725026
20	NC_007168	TCTACA	2	12	33368	33379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725031
21	NC_007168	AAATAA	2	12	35583	35594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	70725033
22	NC_007168	AGTAAC	2	12	46820	46831	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	70725041
23	NC_007168	AGTAAC	2	12	47153	47164	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	70725041
24	NC_007168	TTGAAA	2	12	49465	49476	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70725042
25	NC_007168	ATAAAA	2	12	50065	50076	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	70725042
26	NC_007168	CATTTT	2	12	53547	53558	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	70725044
27	NC_007168	TGTATT	2	12	55541	55552	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	70725046
28	NC_007168	TATAAA	2	12	55900	55911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725046
29	NC_007168	TTAAAC	2	12	56760	56771	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	70725049
30	NC_007168	CATAAC	2	12	57102	57113	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70725050
31	NC_007168	AATTTA	2	12	58536	58547	50 %	50 %	0 %	0 %	70725052
32	NC_007168	GTAGTG	2	12	58579	58590	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	70725052
33	NC_007168	TAAAAA	2	12	59092	59103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	70725053
34	NC_007168	AAATTA	2	12	59285	59296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725053
35	NC_007168	AAAATT	2	12	59674	59685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725053
36	NC_007168	TGAAGA	2	12	67555	67566	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	70725061
37	NC_007168	ATCTAA	2	12	70052	70063	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	70725063
38	NC_007168	TATTTC	2	12	71595	71606	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	70725064
39	NC_007168	CTGTTT	2	12	71930	71941	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	70725064
40	NC_007168	TTCCAT	2	12	78013	78024	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	70725070
41	NC_007168	TGCATC	2	12	78506	78517	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	70725071
42	NC_007168	TGTAAT	2	12	79193	79204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70725072
43	NC_007168	AATTGT	2	12	79531	79542	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70725072
44	NC_007168	TCTACA	2	12	87255	87266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725081
45	NC_007168	TTATAT	2	12	91970	91981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725086
46	NC_007168	GTTTAA	2	12	94963	94974	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70725088
47	NC_007168	AATGAA	2	12	97970	97981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	70725091
48	NC_007168	ACAACT	2	12	100035	100046	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70725092
49	NC_007168	TTAAAC	2	12	100774	100785	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	70725094
50	NC_007168	GCCCAT	2	12	106728	106739	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	70725103
51	NC_007168	ATTAAA	2	12	110331	110342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725106
52	NC_007168	CACCCC	2	12	110889	110900	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	70725107
53	NC_007168	TGATAA	2	12	111347	111358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70725107
54	NC_007168	GCCCAT	2	12	113228	113239	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	70725110
55	NC_007168	GATAAA	2	12	113909	113920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	70725110
56	NC_007168	GAAAAA	2	12	114398	114409	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	70725111
57	NC_007168	TATGTG	2	12	117378	117389	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	70725115
58	NC_007168	TGTTCT	2	12	117851	117862	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	70725116
59	NC_007168	GTTTAA	2	12	120361	120372	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70725120
60	NC_007168	GTGATA	2	12	125229	125240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725126
61	NC_007168	ATGTTG	2	12	125325	125336	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	70725126
62	NC_007168	GATAAA	2	12	125480	125491	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	70725126
63	NC_007168	TTTTCA	2	12	126764	126775	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	70725129
64	NC_007168	TTAGGC	2	12	131468	131479	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	70725134
65	NC_007168	AAAGTT	2	12	139932	139943	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70725141
66	NC_007168	CTTTGA	2	12	143767	143778	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	70725145
67	NC_007168	ATTAAT	2	12	148769	148780	50 %	50 %	0 %	0 %	70725149
68	NC_007168	GATATT	2	12	151390	151401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70725152
69	NC_007168	TAGGAA	2	12	152041	152052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	70725153
70	NC_007168	GAAAAA	2	12	153109	153120	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	70725154
71	NC_007168	ATTACC	2	12	156955	156966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725159
72	NC_007168	TTAAAT	2	12	157444	157455	50 %	50 %	0 %	0 %	70725159
73	NC_007168	ATCTTT	2	12	160081	160092	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	70725163
74	NC_007168	TTCCGG	2	12	160126	160137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725163
75	NC_007168	GATAAA	2	12	160933	160944	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	70725164
76	NC_007168	CATAAA	2	12	162010	162021	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	70725164
77	NC_007168	ATTCAA	2	12	164902	164913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	70725168
78	NC_007168	TGAAGT	2	12	167332	167343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725169
79	NC_007168	GAAATT	2	12	168904	168915	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70725171
80	NC_007168	ACACAT	2	12	170491	170502	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70725172
81	NC_007168	TAACCA	2	12	172692	172703	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70725175
82	NC_007168	GATGTT	2	12	172948	172959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	70725175
83	NC_007168	TCAAGC	2	12	173369	173380	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	70725176
84	NC_007168	TGAAAT	2	12	175182	175193	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70725178
85	NC_007168	TTAAAA	2	12	176863	176874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725180
86	NC_007168	AAAGTT	2	12	176910	176921	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70725180
87	NC_007168	CAATTT	2	12	178062	178073	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	70725181
88	NC_007168	TATTGG	2	12	179373	179384	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	70725182
89	NC_007168	AGTTGA	2	12	180685	180696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725184
90	NC_007168	AAAATT	2	12	182589	182600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725187
91	NC_007168	AAACAC	2	12	185469	185480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725191
92	NC_007168	TTTTAC	2	12	188200	188211	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	70725195
93	NC_007168	AATGTT	2	12	191784	191795	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70725198
94	NC_007168	GTTTGA	2	12	192574	192585	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	70725198
95	NC_007168	TTTAAG	2	12	195662	195673	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70725201
96	NC_007168	TAACTT	2	12	202671	202682	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	70725209
97	NC_007168	TAAGAA	2	12	203816	203827	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	70725210
98	NC_007168	AACTTA	2	12	204788	204799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	70725211
99	NC_007168	ATTATA	2	12	205210	205221	50 %	50 %	0 %	0 %	70725211
100	NC_007168	GTGAAT	2	12	211424	211435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725216
101	NC_007168	TATGGG	2	12	211656	211667	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	70725216
102	NC_007168	AAGTTA	2	12	218074	218085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70725224
103	NC_007168	CGGACA	2	12	219295	219306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725225
104	NC_007168	TAATTG	2	12	220878	220889	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70725226
105	NC_007168	TAGGTG	2	12	222249	222260	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	70725227
106	NC_007168	GATGAA	2	12	224894	224905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	70725230
107	NC_007168	CACCGC	2	12	225993	226004	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	70725231
108	NC_007168	GATACC	2	12	233459	233470	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	70725236
109	NC_007168	ATCTTT	2	12	236190	236201	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	70725239
110	NC_007168	AGAATT	2	12	244671	244682	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70725244
111	NC_007168	AAACAA	2	12	247690	247701	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	70725246
112	NC_007168	TAGCAA	2	12	250620	250631	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	70725247
113	NC_007168	AATTAG	2	12	259057	259068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161760703
114	NC_007168	TTCCCA	2	12	259206	259217	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	161760703
115	NC_007168	GATAAA	2	12	259620	259631	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161760703
116	NC_007168	ACCAAT	2	12	262390	262401	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	70725265
117	NC_007168	ATCTGG	2	12	263909	263920	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	70725267
118	NC_007168	AATAGA	2	12	269210	269221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	70725273
119	NC_007168	GTTTAA	2	12	271503	271514	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	70725274
120	NC_007168	AGTCAT	2	12	272066	272077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	70725275
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237	NC_007168	GTCATA	2	12	362294	362305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	70725353
238	NC_007168	TAAAAT	2	12	362672	362683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725353
239	NC_007168	CGTTTT	2	12	365402	365413	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	70725355
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266	NC_007168	GTTCAA	2	12	429756	429767	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	70725415
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351	NC_007168	GTATTT	2	12	653607	653618	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	70725633
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471	NC_007168	TAAAGT	2	12	921511	921522	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	70725914
472	NC_007168	TAAAGA	2	12	921838	921849	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	70725914
473	NC_007168	TCGATG	2	12	926362	926373	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	70725919
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