MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 chromosome

Total Repeats: 2404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007168	TTTAT	2	10	500	509	20 %	80 %	0 %	0 %	70725002
2	NC_007168	TCAAT	2	10	843	852	40 %	40 %	0 %	20 %	70725002
3	NC_007168	AAATT	2	10	2945	2954	60 %	40 %	0 %	0 %	70725003
4	NC_007168	CAAAT	2	10	5221	5230	60 %	20 %	0 %	20 %	70725006
5	NC_007168	GAAAA	2	10	7909	7918	80 %	0 %	20 %	0 %	70725007
6	NC_007168	AAATT	2	10	11292	11301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007168	CCTAA	2	10	11643	11652	40 %	20 %	0 %	40 %	70725009
8	NC_007168	ATAAA	2	10	14137	14146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007168	CGTGG	2	10	20146	20155	0 %	20 %	60 %	20 %	70725016
10	NC_007168	ACAAT	2	10	20397	20406	60 %	20 %	0 %	20 %	70725016
11	NC_007168	TGTTT	2	10	20499	20508	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007168	ATGTA	2	10	21934	21943	40 %	40 %	20 %	0 %	70725017
13	NC_007168	TGTCT	2	10	22447	22456	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007168	AATTT	2	10	23231	23240	40 %	60 %	0 %	0 %	70725018
15	NC_007168	CTATT	2	10	26427	26436	20 %	60 %	0 %	20 %	70725020
16	NC_007168	TTATT	2	10	27878	27887	20 %	80 %	0 %	0 %	70725022
17	NC_007168	GTATA	2	10	27943	27952	40 %	40 %	20 %	0 %	70725022
18	NC_007168	TATAA	2	10	29801	29810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007168	TATTT	2	10	31903	31912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007168	GTTTT	2	10	33993	34002	0 %	80 %	20 %	0 %	70725031
21	NC_007168	AAGTA	2	10	34123	34132	60 %	20 %	20 %	0 %	70725031
22	NC_007168	ATTTT	2	10	35791	35800	20 %	80 %	0 %	0 %	70725033
23	NC_007168	ATTTT	2	10	38394	38403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007168	TTGGT	2	10	40755	40764	0 %	60 %	40 %	0 %	70725035
25	NC_007168	GTGAG	2	10	42760	42769	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007168	TTTAG	2	10	43082	43091	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007168	AAATG	2	10	43204	43213	60 %	20 %	20 %	0 %	70725038
28	NC_007168	AAGTA	2	10	44576	44585	60 %	20 %	20 %	0 %	70725041
29	NC_007168	TATAC	2	10	50088	50097	40 %	40 %	0 %	20 %	70725042
30	NC_007168	ATTAA	2	10	50319	50328	60 %	40 %	0 %	0 %	70725042
31	NC_007168	ATATT	2	10	51176	51185	40 %	60 %	0 %	0 %	70725043
32	NC_007168	AATTT	2	10	51614	51623	40 %	60 %	0 %	0 %	70725043
33	NC_007168	ACTAA	2	10	52005	52014	60 %	20 %	0 %	20 %	70725043
34	NC_007168	TTTAT	2	10	52178	52187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007168	ATTAA	2	10	52896	52905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007168	CTTTT	2	10	53707	53716	0 %	80 %	0 %	20 %	70725044
37	NC_007168	ATTTT	2	10	54302	54311	20 %	80 %	0 %	0 %	70725045
38	NC_007168	GAACT	2	10	55198	55207	40 %	20 %	20 %	20 %	70725046
39	NC_007168	AACTA	2	10	55211	55220	60 %	20 %	0 %	20 %	70725046
40	NC_007168	CAAAC	2	10	55609	55618	60 %	0 %	0 %	40 %	70725046
41	NC_007168	TTTCA	2	10	56115	56124	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007168	GCCAT	2	10	56953	56962	20 %	20 %	20 %	40 %	70725049
43	NC_007168	TCAAA	2	10	59024	59033	60 %	20 %	0 %	20 %	70725053
44	NC_007168	AAACT	2	10	59963	59972	60 %	20 %	0 %	20 %	70725053
45	NC_007168	ATAAA	2	10	60069	60078	80 %	20 %	0 %	0 %	70725053
46	NC_007168	AATAA	2	10	60548	60557	80 %	20 %	0 %	0 %	70725053
47	NC_007168	TATAG	2	10	60745	60754	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007168	AGCTA	2	10	60999	61008	40 %	20 %	20 %	20 %	70725054
49	NC_007168	TAGAT	2	10	61170	61179	40 %	40 %	20 %	0 %	70725054
50	NC_007168	TATGA	2	10	64137	64146	40 %	40 %	20 %	0 %	70725057
51	NC_007168	CGGAG	2	10	64593	64602	20 %	0 %	60 %	20 %	70725057
52	NC_007168	AAATA	2	10	65326	65335	80 %	20 %	0 %	0 %	70725057
53	NC_007168	TAAAT	2	10	66214	66223	60 %	40 %	0 %	0 %	70725058
54	NC_007168	TTAGT	2	10	67823	67832	20 %	60 %	20 %	0 %	70725062
55	NC_007168	ATAAA	2	10	68357	68366	80 %	20 %	0 %	0 %	70725062
56	NC_007168	TCATA	2	10	70141	70150	40 %	40 %	0 %	20 %	70725063
57	NC_007168	TCGTT	2	10	70384	70393	0 %	60 %	20 %	20 %	70725063
58	NC_007168	AATAC	2	10	70425	70434	60 %	20 %	0 %	20 %	70725063
59	NC_007168	TAACC	2	10	72776	72785	40 %	20 %	0 %	40 %	70725064
60	NC_007168	ATTTA	2	10	74357	74366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007168	ATGAT	2	10	75284	75293	40 %	40 %	20 %	0 %	70725068
62	NC_007168	GTAAT	2	10	76362	76371	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007168	TCTTT	2	10	77100	77109	0 %	80 %	0 %	20 %	70725070
64	NC_007168	AATTA	2	10	77656	77665	60 %	40 %	0 %	0 %	70725070
65	NC_007168	GTGCT	2	10	78167	78176	0 %	40 %	40 %	20 %	70725071
66	NC_007168	ATTTA	2	10	78686	78695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007168	TAAAA	2	10	79003	79012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007168	TGACG	2	10	79905	79914	20 %	20 %	40 %	20 %	70725072
69	NC_007168	TTCAT	2	10	81489	81498	20 %	60 %	0 %	20 %	70725073
70	NC_007168	ATATC	2	10	82020	82029	40 %	40 %	0 %	20 %	70725073
71	NC_007168	AAAAG	2	10	84798	84807	80 %	0 %	20 %	0 %	70725076
72	NC_007168	CATGG	2	10	85222	85231	20 %	20 %	40 %	20 %	70725077
73	NC_007168	GTTTT	2	10	87880	87889	0 %	80 %	20 %	0 %	70725081
74	NC_007168	AAGTA	2	10	88010	88019	60 %	20 %	20 %	0 %	70725081
75	NC_007168	TATTT	2	10	89092	89101	20 %	80 %	0 %	0 %	70725083
76	NC_007168	TTCAT	2	10	93599	93608	20 %	60 %	0 %	20 %	70725087
77	NC_007168	ATCTT	2	10	94022	94031	20 %	60 %	0 %	20 %	70725087
78	NC_007168	TGATT	2	10	94177	94186	20 %	60 %	20 %	0 %	70725087
79	NC_007168	ATGAG	2	10	96608	96617	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007168	TGAAT	2	10	96955	96964	40 %	40 %	20 %	0 %	70725090
81	NC_007168	TTGGT	2	10	96997	97006	0 %	60 %	40 %	0 %	70725090
82	NC_007168	AATAT	2	10	97065	97074	60 %	40 %	0 %	0 %	70725090
83	NC_007168	TTCGT	2	10	97276	97285	0 %	60 %	20 %	20 %	70725090
84	NC_007168	CAAAA	2	10	97636	97645	80 %	0 %	0 %	20 %	70725091
85	NC_007168	AAATT	2	10	99735	99744	60 %	40 %	0 %	0 %	70725092
86	NC_007168	ATTCT	2	10	101105	101114	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007168	AAATT	2	10	103975	103984	60 %	40 %	0 %	0 %	70725098
88	NC_007168	ACATC	2	10	105852	105861	40 %	20 %	0 %	40 %	70725101
89	NC_007168	GAAAT	2	10	105942	105951	60 %	20 %	20 %	0 %	70725101
90	NC_007168	TTTCC	2	10	106320	106329	0 %	60 %	0 %	40 %	70725102
91	NC_007168	ATAAA	2	10	106373	106382	80 %	20 %	0 %	0 %	70725102
92	NC_007168	AATGA	2	10	107500	107509	60 %	20 %	20 %	0 %	70725103
93	NC_007168	TAATA	2	10	108241	108250	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007168	ATGAT	2	10	110446	110455	40 %	40 %	20 %	0 %	70725107
95	NC_007168	GAAAG	2	10	110624	110633	60 %	0 %	40 %	0 %	70725107
96	NC_007168	AAAAT	2	10	111429	111438	80 %	20 %	0 %	0 %	70725107
97	NC_007168	AAAGT	2	10	111878	111887	60 %	20 %	20 %	0 %	70725108
98	NC_007168	AATTA	2	10	112697	112706	60 %	40 %	0 %	0 %	70725109
99	NC_007168	AATTA	2	10	114346	114355	60 %	40 %	0 %	0 %	70725111
100	NC_007168	TTTCA	2	10	116039	116048	20 %	60 %	0 %	20 %	70725112
101	NC_007168	TTATT	2	10	118003	118012	20 %	80 %	0 %	0 %	70725116
102	NC_007168	TTTTG	2	10	119289	119298	0 %	80 %	20 %	0 %	70725118
103	NC_007168	TAAAT	2	10	119828	119837	60 %	40 %	0 %	0 %	70725119
104	NC_007168	AATCA	2	10	120018	120027	60 %	20 %	0 %	20 %	70725119
105	NC_007168	TAAAA	2	10	120947	120956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007168	GATAT	2	10	121490	121499	40 %	40 %	20 %	0 %	70725121
107	NC_007168	GAAAA	2	10	122188	122197	80 %	0 %	20 %	0 %	70725123
108	NC_007168	TTACT	2	10	123944	123953	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007168	TGAAT	2	10	124082	124091	40 %	40 %	20 %	0 %	70725125
110	NC_007168	ATGTT	2	10	126343	126352	20 %	60 %	20 %	0 %	70725127
111	NC_007168	CAAAA	2	10	127048	127057	80 %	0 %	0 %	20 %	70725129
112	NC_007168	TTAAT	2	10	128128	128137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007168	TAATA	2	10	130833	130842	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007168	TACAT	2	10	132292	132301	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_007168	TCAAA	2	10	133629	133638	60 %	20 %	0 %	20 %	70725135
116	NC_007168	GATTA	2	10	133799	133808	40 %	40 %	20 %	0 %	70725135
117	NC_007168	ATTCA	2	10	135059	135068	40 %	40 %	0 %	20 %	70725136
118	NC_007168	ACCTA	2	10	135716	135725	40 %	20 %	0 %	40 %	70725137
119	NC_007168	TCATT	2	10	136653	136662	20 %	60 %	0 %	20 %	70725139
120	NC_007168	TGTAT	2	10	136716	136725	20 %	60 %	20 %	0 %	70725139
121	NC_007168	TTAGT	2	10	137120	137129	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007168	TTATT	2	10	137514	137523	20 %	80 %	0 %	0 %	70725140
123	NC_007168	TTATT	2	10	137915	137924	20 %	80 %	0 %	0 %	70725140
124	NC_007168	AAATA	2	10	141721	141730	80 %	20 %	0 %	0 %	70725143
125	NC_007168	ATCAA	2	10	147366	147375	60 %	20 %	0 %	20 %	70725148
126	NC_007168	GTAAA	2	10	147440	147449	60 %	20 %	20 %	0 %	70725148
127	NC_007168	CAAGA	2	10	147679	147688	60 %	0 %	20 %	20 %	70725148
128	NC_007168	TACTT	2	10	148501	148510	20 %	60 %	0 %	20 %	70725149
129	NC_007168	ATACT	2	10	148569	148578	40 %	40 %	0 %	20 %	70725149
130	NC_007168	TTATT	2	10	148826	148835	20 %	80 %	0 %	0 %	70725149
131	NC_007168	TAAAT	2	10	154021	154030	60 %	40 %	0 %	0 %	70725155
132	NC_007168	AGTAA	2	10	154646	154655	60 %	20 %	20 %	0 %	70725156
133	NC_007168	TAAAT	2	10	156413	156422	60 %	40 %	0 %	0 %	70725158
134	NC_007168	TAGTA	2	10	156712	156721	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007168	TATTT	2	10	167674	167683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007168	TTTCA	2	10	167802	167811	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007168	ATTAA	2	10	168200	168209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007168	TTACA	2	10	170327	170336	40 %	40 %	0 %	20 %	70725172
139	NC_007168	AACTA	2	10	172334	172343	60 %	20 %	0 %	20 %	70725175
140	NC_007168	GATAT	2	10	173457	173466	40 %	40 %	20 %	0 %	70725176
141	NC_007168	CAATG	2	10	173552	173561	40 %	20 %	20 %	20 %	70725176
142	NC_007168	GAAAT	2	10	175691	175700	60 %	20 %	20 %	0 %	70725178
143	NC_007168	GTTTT	2	10	176049	176058	0 %	80 %	20 %	0 %	70725179
144	NC_007168	CATTA	2	10	176720	176729	40 %	40 %	0 %	20 %	70725180
145	NC_007168	CTTTC	2	10	178519	178528	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_007168	ATGAT	2	10	178670	178679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007168	TGAAA	2	10	178806	178815	60 %	20 %	20 %	0 %	70725182
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149	NC_007168	GTATA	2	10	180957	180966	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_007168	TAGTT	2	10	182423	182432	20 %	60 %	20 %	0 %	70725187
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161	NC_007168	GTTAT	2	10	196286	196295	20 %	60 %	20 %	0 %	70725201
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176	NC_007168	GATAT	2	10	221664	221673	40 %	40 %	20 %	0 %	70725227
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181	NC_007168	TAATA	2	10	225448	225457	60 %	40 %	0 %	0 %	70725230
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201	NC_007168	CTAAA	2	10	243270	243279	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
202	NC_007168	TGATG	2	10	245194	245203	20 %	40 %	40 %	0 %	70725245
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210	NC_007168	TTAAA	2	10	255424	255433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_007168	AGTAT	2	10	283106	283115	40 %	40 %	20 %	0 %	70725285
245	NC_007168	TGTTA	2	10	284125	284134	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
246	NC_007168	TATTT	2	10	285233	285242	20 %	80 %	0 %	0 %	70725288
247	NC_007168	TTATT	2	10	285622	285631	20 %	80 %	0 %	0 %	70725288
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258	NC_007168	TAATA	2	10	297985	297994	60 %	40 %	0 %	0 %	70725300
259	NC_007168	ATTAT	2	10	298100	298109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_007168	GTCTT	2	10	298426	298435	0 %	60 %	20 %	20 %	70725301
261	NC_007168	CAAAA	2	10	298534	298543	80 %	0 %	0 %	20 %	70725301
262	NC_007168	TTACT	2	10	298961	298970	20 %	60 %	0 %	20 %	70725301
263	NC_007168	AATCA	2	10	303830	303839	60 %	20 %	0 %	20 %	70725304
264	NC_007168	TAAAT	2	10	304084	304093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_007168	CATAT	2	10	304202	304211	40 %	40 %	0 %	20 %	70725305
266	NC_007168	CTTAT	2	10	305022	305031	20 %	60 %	0 %	20 %	70725306
267	NC_007168	GAAAT	2	10	306243	306252	60 %	20 %	20 %	0 %	70725306
268	NC_007168	GTTTA	2	10	306775	306784	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
269	NC_007168	TAGTT	2	10	307629	307638	20 %	60 %	20 %	0 %	70725307
270	NC_007168	ATTTT	2	10	308147	308156	20 %	80 %	0 %	0 %	70725307
271	NC_007168	TAATA	2	10	309787	309796	60 %	40 %	0 %	0 %	70725308
272	NC_007168	TGAAA	2	10	310071	310080	60 %	20 %	20 %	0 %	70725309
273	NC_007168	AATAA	2	10	310219	310228	80 %	20 %	0 %	0 %	70725309
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