MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 chromosome

Total Repeats: 546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007168	AAATT	2	10	11292	11301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007168	ATAAA	2	10	14137	14146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007168	TGTTT	2	10	20499	20508	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007168	TGTCT	2	10	22447	22456	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007168	TATAA	2	10	29801	29810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007168	TATTT	2	10	31903	31912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007168	ATTTT	2	10	38394	38403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007168	GTGAG	2	10	42760	42769	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007168	TTTAG	2	10	43082	43091	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007168	TTTAT	2	10	52178	52187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007168	ATTAA	2	10	52896	52905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007168	TTTCA	2	10	56115	56124	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007168	TATAG	2	10	60745	60754	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007168	ATTTA	2	10	74357	74366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007168	GTAAT	2	10	76362	76371	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007168	ATTTA	2	10	78686	78695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007168	TAAAA	2	10	79003	79012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007168	ATGAG	2	10	96608	96617	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007168	ATTCT	2	10	101105	101114	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007168	TAATA	2	10	108241	108250	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007168	TAAAA	2	10	120947	120956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007168	TTACT	2	10	123944	123953	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007168	TTAAT	2	10	128128	128137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007168	TAATA	2	10	130833	130842	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007168	TACAT	2	10	132292	132301	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_007168	TTAGT	2	10	137120	137129	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007168	TAGTA	2	10	156712	156721	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007168	TATTT	2	10	167674	167683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007168	TTTCA	2	10	167802	167811	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007168	ATTAA	2	10	168200	168209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007168	CTTTC	2	10	178519	178528	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_007168	ATGAT	2	10	178670	178679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007168	TTGAT	2	10	180867	180876	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007168	GTATA	2	10	180957	180966	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007168	ATTCT	2	10	195608	195617	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007168	ACTAA	2	10	197857	197866	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007168	AAGTA	2	10	209456	209465	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007168	CACAA	2	10	222517	222526	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_007168	TAAAT	2	10	224304	224313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007168	TTATA	2	10	224466	224475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007168	TTAAA	2	10	224859	224868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007168	ATATT	2	10	226692	226701	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007168	AAGCA	2	10	236026	236035	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007168	TTGTA	2	10	236470	236479	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007168	TTGCT	2	10	239877	239886	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007168	TCAGT	2	10	239974	239983	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007168	CTAAA	2	10	243270	243279	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007168	AATTA	2	10	253878	253887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007168	TTAAA	2	10	255424	255433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007168	GAAAA	2	10	256208	256217	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007168	TAAAA	2	10	256317	256326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007168	TAGCA	2	10	261017	261026	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007168	TTGCC	2	10	266737	266746	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007168	TTGTT	2	10	266815	266824	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007168	TATAA	2	10	268738	268747	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007168	AAATT	2	10	270473	270482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007168	TATTT	2	10	274495	274504	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007168	TGTTA	2	10	284125	284134	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007168	ATTAT	2	10	298100	298109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007168	TAAAT	2	10	304084	304093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007168	GTTTA	2	10	306775	306784	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007168	ATATA	2	10	313194	313203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007168	AGTTG	2	10	315764	315773	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007168	GTGAG	2	10	322398	322407	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007168	ATTTA	2	10	325549	325558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007168	TTTAA	2	10	348182	348191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007168	ATAGA	2	10	353035	353044	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007168	AATTA	2	10	353687	353696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007168	TTATA	2	10	356100	356109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007168	AGTTT	2	10	359999	360008	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007168	TAAAT	2	10	366287	366296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007168	TAAAA	2	10	378851	378860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007168	AATTT	2	10	379571	379580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007168	TCAGT	2	10	385918	385927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_007168	TAAAA	2	10	389753	389762	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007168	ATTTT	2	10	396310	396319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007168	ACTAA	2	10	396583	396592	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007168	TATAA	2	10	401306	401315	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007168	ATTAT	2	10	415322	415331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007168	AATTT	2	10	417832	417841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007168	AAGTA	2	10	417870	417879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007168	TATTT	2	10	418134	418143	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007168	TAATA	2	10	425038	425047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007168	CTAAT	2	10	435568	435577	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_007168	AAAAT	2	10	437423	437432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007168	TTAAA	2	10	437714	437723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007168	GATTT	2	10	439264	439273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007168	TCTTT	2	10	442489	442498	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007168	TCAAA	2	10	456232	456241	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_007168	GATAA	2	10	456293	456302	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007168	AAAAG	2	10	466984	466993	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007168	ATAAG	2	10	467030	467039	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007168	TCTCA	2	10	470341	470350	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_007168	ACTAA	2	10	472159	472168	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007168	TCAAT	2	10	475232	475241	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007168	ATTTT	2	10	482681	482690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007168	ATATA	2	10	482718	482727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007168	ACTAA	2	10	493197	493206	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007168	TCTTG	2	10	497127	497136	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007168	AAATA	2	10	510456	510465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007168	TTTAA	2	10	513345	513354	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007168	TATAA	2	10	514491	514500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007168	AAAAT	2	10	520174	520183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007168	ACTAA	2	10	529250	529259	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007168	ATTTT	2	10	550865	550874	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007168	TAAAT	2	10	554850	554859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007168	ACTTA	2	10	557758	557767	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007168	TCAGT	2	10	561606	561615	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007168	ATTAA	2	10	562740	562749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007168	TTTCA	2	10	578927	578936	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_007168	AAAAG	2	10	579245	579254	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007168	ATTAC	2	10	580591	580600	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007168	GAAAG	2	10	581190	581199	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007168	GTTGA	2	10	591970	591979	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007168	AATAC	2	10	592429	592438	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007168	TAAAG	2	10	597282	597291	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007168	CACAC	2	10	606167	606176	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_007168	TAATT	2	10	607452	607461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007168	AACCT	2	10	609549	609558	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_007168	ATTTA	2	10	616890	616899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007168	ATTAC	2	10	616979	616988	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007168	TTCTA	2	10	620068	620077	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007168	TCATT	2	10	621847	621856	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007168	ATTGT	2	10	621932	621941	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007168	ATAAA	2	10	629121	629130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007168	TTCAA	2	10	645271	645280	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007168	AATAT	2	10	652657	652666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007168	TAAAA	2	10	656173	656182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007168	ATTAA	2	10	656949	656958	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007168	CTAAT	2	10	660177	660186	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_007168	ATTAA	2	10	669380	669389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007168	AATAA	2	10	688227	688236	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007168	AATTG	2	10	691015	691024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007168	AAGTA	2	10	691483	691492	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007168	ATAGT	2	10	699122	699131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007168	GATTG	2	10	703588	703597	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007168	ATTTT	2	10	712457	712466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007168	ATATA	2	10	724098	724107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007168	ACTGA	2	10	725605	725614	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007168	AAATT	2	10	727017	727026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007168	CTATG	2	10	727032	727041	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007168	ATATT	2	10	731371	731380	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007168	TAATG	2	10	731437	731446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007168	CATTG	2	10	739129	739138	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007168	AAATT	2	10	746060	746069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007168	AAACT	2	10	759513	759522	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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