MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 chromosome

Total Repeats: 36555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007168	ATC	2	6	628	633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725002
2	NC_007168	AAG	2	6	680	685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
3	NC_007168	CTG	2	6	743	748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725002
4	NC_007168	TGA	2	6	765	770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725002
5	NC_007168	GCA	2	6	907	912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725002
6	NC_007168	TGG	2	6	966	971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725002
7	NC_007168	TCA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725002
8	NC_007168	TCA	2	6	1082	1087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725002
9	NC_007168	AAG	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
10	NC_007168	TTC	2	6	1201	1206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725002
11	NC_007168	AAG	2	6	1234	1239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
12	NC_007168	AGA	2	6	1287	1292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
13	NC_007168	CTC	2	6	1337	1342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70725002
14	NC_007168	TTC	2	6	1367	1372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725002
15	NC_007168	GAA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
16	NC_007168	CTG	2	6	1406	1411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725002
17	NC_007168	ATT	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725002
18	NC_007168	ACT	2	6	1610	1615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725002
19	NC_007168	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
20	NC_007168	GGT	2	6	1744	1749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725002
21	NC_007168	AAG	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
22	NC_007168	ATG	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
23	NC_007168	AGA	2	6	2182	2187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725003
24	NC_007168	ATT	2	6	2189	2194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
25	NC_007168	TTA	2	6	2195	2200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
26	NC_007168	AAC	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725003
27	NC_007168	TTC	2	6	2407	2412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725003
28	NC_007168	ATT	2	6	2419	2424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
29	NC_007168	CAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725003
30	NC_007168	TAC	2	6	2540	2545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725003
31	NC_007168	TGA	2	6	2559	2564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
32	NC_007168	AGA	2	6	2739	2744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725003
33	NC_007168	TCA	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725003
34	NC_007168	TTA	2	6	2893	2898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
35	NC_007168	ACA	2	6	2917	2922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725003
36	NC_007168	CTT	2	6	2996	3001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725003
37	NC_007168	CAA	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725003
38	NC_007168	TTA	2	6	3029	3034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
39	NC_007168	ATG	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
40	NC_007168	ATC	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725003
41	NC_007168	AGA	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725003
42	NC_007168	ATG	2	6	3163	3168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
43	NC_007168	ATG	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
44	NC_007168	AGA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725003
45	NC_007168	AAG	2	6	3683	3688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725004
46	NC_007168	TAG	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725004
47	NC_007168	ATT	2	6	3739	3744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725004
48	NC_007168	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725004
49	NC_007168	GAA	2	6	3948	3953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725005
50	NC_007168	AGA	2	6	4259	4264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725005
51	NC_007168	AGA	2	6	4381	4386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725005
52	NC_007168	CAA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725005
53	NC_007168	TCA	2	6	4501	4506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725005
54	NC_007168	GAT	2	6	4710	4715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725005
55	NC_007168	GCA	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725005
56	NC_007168	TTA	2	6	4845	4850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725005
57	NC_007168	GAT	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725005
58	NC_007168	GAT	2	6	4875	4880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725005
59	NC_007168	AAC	3	9	4934	4942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725005
60	NC_007168	AAT	2	6	4974	4979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725005
61	NC_007168	ACA	2	6	5056	5061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725006
62	NC_007168	CAC	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70725006
63	NC_007168	CGA	2	6	5198	5203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725006
64	NC_007168	TTA	2	6	5236	5241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725006
65	NC_007168	GTC	2	6	5314	5319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725006
66	NC_007168	CAG	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725006
67	NC_007168	TGG	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725006
68	NC_007168	CGG	2	6	5366	5371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	70725006
69	NC_007168	GGT	2	6	5391	5396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725006
70	NC_007168	TTC	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725006
71	NC_007168	GTT	2	6	5418	5423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70725006
72	NC_007168	AAC	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725006
73	NC_007168	GAA	2	6	5775	5780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725006
74	NC_007168	TCA	2	6	5792	5797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725006
75	NC_007168	GAT	2	6	5805	5810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725006
76	NC_007168	CAA	2	6	5851	5856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725006
77	NC_007168	TTA	2	6	5859	5864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725006
78	NC_007168	AAT	2	6	5874	5879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725006
79	NC_007168	GGT	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725006
80	NC_007168	ATT	2	6	5967	5972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725006
81	NC_007168	CGT	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725006
82	NC_007168	TTG	2	6	6106	6111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70725006
83	NC_007168	GCA	2	6	6213	6218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725006
84	NC_007168	CGT	2	6	6240	6245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725006
85	NC_007168	GAA	2	6	6309	6314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725006
86	NC_007168	TAG	2	6	6328	6333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725006
87	NC_007168	AAG	2	6	6361	6366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725006
88	NC_007168	AAT	2	6	6453	6458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725006
89	NC_007168	TGG	2	6	6497	6502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725006
90	NC_007168	TTA	2	6	6585	6590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725006
91	NC_007168	TTC	2	6	6597	6602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725006
92	NC_007168	ATG	2	6	6834	6839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725006
93	NC_007168	AGA	2	6	6854	6859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725006
94	NC_007168	CGT	2	6	7201	7206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725007
95	NC_007168	ATG	2	6	7322	7327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
96	NC_007168	ATG	2	6	7511	7516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
97	NC_007168	TTA	2	6	7561	7566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725007
98	NC_007168	CAA	2	6	7601	7606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725007
99	NC_007168	TCC	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70725007
100	NC_007168	TCA	2	6	7634	7639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725007
101	NC_007168	TAA	2	6	7866	7871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725007
102	NC_007168	TGA	2	6	7941	7946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
103	NC_007168	AGT	2	6	7971	7976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
104	NC_007168	CGT	3	9	8152	8160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725007
105	NC_007168	ATT	2	6	8242	8247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725007
106	NC_007168	GAA	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
107	NC_007168	TGA	2	6	8472	8477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
108	NC_007168	CGT	2	6	8512	8517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725007
109	NC_007168	GAT	2	6	8542	8547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
110	NC_007168	AGA	2	6	8550	8555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
111	NC_007168	GAA	2	6	8572	8577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
112	NC_007168	TCA	2	6	8585	8590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725007
113	NC_007168	ATA	2	6	8600	8605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725007
114	NC_007168	GAA	2	6	8686	8691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
115	NC_007168	TTC	2	6	8740	8745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725007
116	NC_007168	ATG	2	6	8846	8851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
117	NC_007168	GAT	2	6	8865	8870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
118	NC_007168	AGA	2	6	9000	9005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
119	NC_007168	CTG	2	6	9119	9124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725007
120	NC_007168	GAT	2	6	9154	9159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
121	NC_007168	GTG	2	6	9272	9277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725007
122	NC_007168	GAA	2	6	9349	9354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
123	NC_007168	GTG	2	6	9377	9382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725007
124	NC_007168	GAT	2	6	9460	9465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
125	NC_007168	AGA	2	6	9504	9509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
126	NC_007168	GCT	2	6	9526	9531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725007
127	NC_007168	GAA	2	6	9580	9585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
128	NC_007168	TGA	3	9	9591	9599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
129	NC_007168	TGA	2	6	9654	9659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
130	NC_007168	ATG	2	6	9740	9745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
131	NC_007168	GGT	2	6	9916	9921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725008
132	NC_007168	ATC	2	6	9999	10004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725008
133	NC_007168	CAA	2	6	10013	10018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725008
134	NC_007168	CCA	2	6	10054	10059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70725008
135	NC_007168	GCA	2	6	10144	10149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725008
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137	NC_007168	CAA	2	6	10307	10312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725008
138	NC_007168	GTA	2	6	10340	10345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725008
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140	NC_007168	GCA	2	6	10489	10494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725008
141	NC_007168	GAT	2	6	11397	11402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725009
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154	NC_007168	ATG	2	6	11910	11915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725009
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159	NC_007168	GAA	2	6	12261	12266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725009
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248	NC_007168	AAT	2	6	18491	18496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725015
249	NC_007168	AAC	2	6	18537	18542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725015
250	NC_007168	TGA	2	6	18580	18585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725015
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253	NC_007168	ACA	2	6	18706	18711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725015
254	NC_007168	AAG	2	6	18798	18803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725015
255	NC_007168	AAG	2	6	18840	18845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725015
256	NC_007168	ATA	2	6	19052	19057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725016
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258	NC_007168	ATT	2	6	19117	19122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725016
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