MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium jeikeium K411 chromosome

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007164	GTTTGT	2	12	108017	108028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007164	TTTTGT	2	12	108630	108641	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007164	GTTGGG	2	12	110353	110364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007164	ACTAAA	2	12	113967	113978	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007164	TGTGAG	2	12	128795	128806	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007164	ACGTAA	2	12	157520	157531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007164	GGGGAT	2	12	191078	191089	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007164	TTGAGC	2	12	286311	286322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007164	AAAAGC	2	12	289491	289502	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007164	CCATCG	2	12	380048	380059	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007164	GGTGGG	2	12	383349	383360	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007164	GGGTTT	2	12	405139	405150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007164	GCAATG	2	12	415115	415126	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007164	TTTTGC	2	12	459252	459263	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007164	GTTTGT	2	12	472097	472108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007164	TTTTGT	2	12	472710	472721	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007164	GTTGGG	2	12	474433	474444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007164	TTTTTG	2	12	520182	520193	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007164	GCCGGG	2	12	540503	540514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007164	GTTTGT	2	12	579543	579554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007164	GATCGG	2	12	637844	637855	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007164	GAAAAA	2	12	642879	642890	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007164	GGCTGT	2	12	695667	695678	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007164	CTTAAG	2	12	695699	695710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007164	CGAGTG	2	12	761864	761875	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007164	GATCGG	2	12	762040	762051	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007164	GCAGGG	2	12	769743	769754	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007164	TTGATA	2	12	774446	774457	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007164	GCGCCC	2	12	801518	801529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007164	CAAGGT	2	12	806479	806490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007164	ATGGGA	2	12	809779	809790	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007164	CATTTT	2	12	810045	810056	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007164	GCGTGG	2	12	810232	810243	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007164	CAAGGC	2	12	829313	829324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007164	TAACAC	2	12	832131	832142	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007164	GAGTGG	2	12	864594	864605	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007164	TTGAGT	2	12	904687	904698	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007164	GAAAGG	2	12	904845	904856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007164	TAGCGC	2	12	906014	906025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007164	GAACGA	2	12	1023093	1023104	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007164	TTTTGT	2	12	1024926	1024937	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007164	ACTAAA	2	12	1030259	1030270	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007164	GTGCGC	2	12	1052874	1052885	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007164	ATAACG	2	12	1113888	1113899	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007164	TTCGGC	2	12	1229921	1229932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007164	AACCAA	2	12	1262666	1262677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007164	ACGCCC	2	12	1374692	1374703	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007164	AAAAGG	2	12	1380809	1380820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007164	CAGCAA	2	12	1482274	1482285	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007164	ACGTGT	2	12	1545235	1545246	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007164	TTTTTC	2	12	1603111	1603122	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007164	AACGTG	2	12	1615687	1615698	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007164	CCAACC	2	12	1680649	1680660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007164	TTGAAC	2	12	1692913	1692924	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007164	TTGAAC	2	12	1698159	1698170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007164	CAGGAA	2	12	1785646	1785657	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007164	TTCACC	2	12	1793562	1793573	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007164	GTTTGG	2	12	1814521	1814532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007164	GTTGAA	2	12	1816277	1816288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007164	TTCAGT	2	12	1822929	1822940	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007164	TTTTCG	2	12	1869329	1869340	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007164	AAAAAC	2	12	1901752	1901763	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007164	ACCCCC	2	12	1909972	1909983	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
64	NC_007164	ACAGGC	2	12	1957147	1957158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007164	CTGCGC	2	12	1986154	1986165	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007164	GAAACT	2	12	1997990	1998001	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007164	CAGCAA	2	12	2065526	2065537	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007164	ATCCCA	2	12	2095139	2095150	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007164	GTCTTA	2	12	2134446	2134457	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007164	GGATAA	2	12	2144703	2144714	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007164	AGCAAA	2	12	2173935	2173946	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007164	GGCTAA	2	12	2237701	2237712	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007164	CCCACC	2	12	2252212	2252223	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
74	NC_007164	CTCTTT	2	12	2253998	2254009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007164	CCTCTC	2	12	2258592	2258603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007164	GTCGGT	2	12	2340550	2340561	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007164	CAGAAA	2	12	2363179	2363190	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007164	TGGCGG	2	12	2363700	2363711	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_007164	CGCGCA	2	12	2363906	2363917	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007164	CCCCCG	2	12	2371848	2371859	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
81	NC_007164	AGCAAC	2	12	2387081	2387092	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007164	CGGGGG	2	12	2437502	2437513	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.