MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae 86-028NP chromosome

Total Repeats: 859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007146	CTACAA	2	12	1003	1014	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	68248552
2	NC_007146	CAACCG	2	12	2344	2355	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	68248553
3	NC_007146	TTTCCT	2	12	4615	4626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248556
4	NC_007146	GTTCTG	2	12	6511	6522	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	68248557
5	NC_007146	AAATAA	2	12	7376	7387	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	68248557
6	NC_007146	AACTGG	2	12	8094	8105	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68248557
7	NC_007146	CACAAC	2	12	8425	8436	50 %	0 %	0 %	50 %	68248557
8	NC_007146	TCTAGC	2	12	9570	9581	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	68248558
9	NC_007146	GAAAAA	2	12	10411	10422	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007146	TGGCAA	2	12	14513	14524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68248565
11	NC_007146	AAACCA	2	12	16866	16877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248567
12	NC_007146	CACGCT	2	12	17728	17739	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	68248567
13	NC_007146	GAAAAG	2	12	17955	17966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007146	AAGATG	2	12	25478	25489	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	68248573
15	NC_007146	AAGCGA	2	12	26206	26217	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	68248574
16	NC_007146	ACCAAA	2	12	34113	34124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248583
17	NC_007146	TTTACT	2	12	41527	41538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	68248589
18	NC_007146	TACTTT	2	12	42054	42065	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	68248589
19	NC_007146	CTTGTA	2	12	42427	42438	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248590
20	NC_007146	AAAGCA	2	12	45950	45961	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	68248594
21	NC_007146	TGCATT	2	12	49470	49481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248599
22	NC_007146	GCTTTT	2	12	51027	51038	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	68248600
23	NC_007146	ACAATT	2	12	52214	52225	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248601
24	NC_007146	CAATAT	2	12	52407	52418	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248601
25	NC_007146	TTTAAA	2	12	56561	56572	50 %	50 %	0 %	0 %	68248605
26	NC_007146	GTAAAA	2	12	56868	56879	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	68248605
27	NC_007146	TGGAAT	2	12	62676	62687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248610
28	NC_007146	TCTAAA	2	12	63548	63559	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248611
29	NC_007146	TGCCAA	2	12	65028	65039	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	68248612
30	NC_007146	TTAGAT	2	12	69533	69544	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68248615
31	NC_007146	CGATTG	2	12	70366	70377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	68248617
32	NC_007146	ATCAAG	2	12	75232	75243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	68248620
33	NC_007146	TGCGCC	2	12	76798	76809	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	68248620
34	NC_007146	AGAACA	2	12	80246	80257	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	68248623
35	NC_007146	CAAATT	2	12	81471	81482	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248625
36	NC_007146	TTTGGT	2	12	82793	82804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248626
37	NC_007146	ATTAAA	2	12	86683	86694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248629
38	NC_007146	TGGGCT	2	12	87924	87935	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	68248631
39	NC_007146	TGATAC	2	12	92468	92479	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	68248637
40	NC_007146	TAAAAA	2	12	94540	94551	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	68248639
41	NC_007146	GCCACA	2	12	95536	95547	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	68248639
42	NC_007146	TTAATT	2	12	96694	96705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248640
43	NC_007146	CTCTAT	2	12	98598	98609	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	68248642
44	NC_007146	GCCTTT	2	12	99808	99819	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007146	GTTCTC	2	12	100542	100553	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	68248645
46	NC_007146	CTTTTC	2	12	101064	101075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007146	TAATTA	2	12	110938	110949	50 %	50 %	0 %	0 %	68248658
48	NC_007146	GAAGAT	2	12	113311	113322	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	68248659
49	NC_007146	AGAGCA	2	12	114613	114624	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	68248661
50	NC_007146	GGGATT	2	12	116501	116512	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	68248664
51	NC_007146	ATTGAT	2	12	118785	118796	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68248666
52	NC_007146	AATCCA	2	12	120096	120107	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	68248668
53	NC_007146	ATGAAG	2	12	121168	121179	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	68248668
54	NC_007146	TGGTTA	2	12	121746	121757	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	68248668
55	NC_007146	CCTAAT	2	12	122158	122169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248668
56	NC_007146	TTTTAT	2	12	122654	122665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	68248670
57	NC_007146	GCAAAA	2	12	122839	122850	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	68248670
58	NC_007146	CCAGCG	2	12	127081	127092	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	68248673
59	NC_007146	ATATTG	2	12	131043	131054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68248678
60	NC_007146	TTTTGA	2	12	133924	133935	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007146	CATTAT	2	12	135063	135074	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	68248683
62	NC_007146	TGAACC	2	12	137201	137212	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	68248686
63	NC_007146	AAAATA	2	12	142092	142103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007146	TAAGAT	2	12	144043	144054	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007146	ATAAAG	2	12	146247	146258	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	68248696
66	NC_007146	CTTCAA	2	12	151634	151645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248700
67	NC_007146	AGTTCA	2	12	151654	151665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	68248700
68	NC_007146	TTCGCC	2	12	168100	168111	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	68248714
69	NC_007146	ACACGC	2	12	168383	168394	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	68248714
70	NC_007146	GCAAAG	2	12	171158	171169	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	68248716
71	NC_007146	CCCAAT	2	12	176040	176051	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	68248719
72	NC_007146	ATTGCG	2	12	177183	177194	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	68248719
73	NC_007146	TACTTC	2	12	177515	177526	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	68248719
74	NC_007146	ATTGGA	2	12	177701	177712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248719
75	NC_007146	CACCCA	2	12	179113	179124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	68248720
76	NC_007146	GCATCA	2	12	183303	183314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007146	ATTTCA	2	12	190501	190512	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007146	CTTTCG	2	12	192475	192486	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007146	AACCCC	2	12	193914	193925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007146	GCCTTC	2	12	194023	194034	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007146	GTAATC	2	12	198640	198651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	68248730
82	NC_007146	CAAATT	2	12	199478	199489	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248731
83	NC_007146	TGAAAA	2	12	199834	199845	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007146	CACAAA	2	12	200330	200341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248732
85	NC_007146	ACGACC	2	12	200355	200366	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	68248732
86	NC_007146	CTAAAA	2	12	201062	201073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	68248733
87	NC_007146	ATATCA	2	12	203939	203950	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248735
88	NC_007146	TGCATC	2	12	208848	208859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	68248740
89	NC_007146	AAAAAC	2	12	210467	210478	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	68248742
90	NC_007146	CTTATA	2	12	211908	211919	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	68248743
91	NC_007146	GGCGCA	2	12	212264	212275	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	68248743
92	NC_007146	ACGTTT	2	12	212528	212539	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248744
93	NC_007146	CAATAA	2	12	213841	213852	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	68248744
94	NC_007146	AAAATT	2	12	216102	216113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007146	CTAGAA	2	12	217261	217272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	68248747
96	NC_007146	GAAAAA	2	12	217302	217313	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	68248747
97	NC_007146	CTTTTG	2	12	219999	220010	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	68248750
98	NC_007146	GTGCTG	2	12	227424	227435	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	68248756
99	NC_007146	GGCTGA	2	12	229479	229490	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	68248759
100	NC_007146	TTCGTT	2	12	232014	232025	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	68248761
101	NC_007146	TAAAAA	2	12	232853	232864	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	68248761
102	NC_007146	AATATC	2	12	234062	234073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248763
103	NC_007146	ACCTTT	2	12	234143	234154	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	68248763
104	NC_007146	CAACTG	2	12	239154	239165	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	68248769
105	NC_007146	GCATTA	2	12	241245	241256	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007146	CAACCT	2	12	243884	243895	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	68248772
107	NC_007146	TTGGCA	2	12	243942	243953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	68248772
108	NC_007146	TTAGTG	2	12	246229	246240	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	68248776
109	NC_007146	GCGGTG	2	12	246392	246403	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	68248776
110	NC_007146	TTGTGA	2	12	248728	248739	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	68248778
111	NC_007146	TAAACG	3	18	251199	251216	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	68248781
112	NC_007146	AAAAAT	2	12	254217	254228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007146	ATCTTT	2	12	254878	254889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	68248785
114	NC_007146	TTCAGT	2	12	255643	255654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248785
115	NC_007146	ACGACC	2	12	256015	256026	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	68248785
116	NC_007146	AAATCT	2	12	256689	256700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248786
117	NC_007146	CATAAT	2	12	256838	256849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68248786
118	NC_007146	TAAAGT	2	12	257138	257149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	68248786
119	NC_007146	TGTACT	2	12	259998	260009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248788
120	NC_007146	AAAGAG	2	12	263592	263603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248791
121	NC_007146	TTGCTT	2	12	264553	264564	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	68248793
122	NC_007146	GCAAGT	2	12	265532	265543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68248794
123	NC_007146	TCTGGT	2	12	266028	266039	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	68248794
124	NC_007146	CAAAAC	2	12	269171	269182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248798
125	NC_007146	TTTAAA	2	12	272235	272246	50 %	50 %	0 %	0 %	68248800
126	NC_007146	ATTCGT	2	12	273603	273614	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248800
127	NC_007146	GTGTTG	2	12	273730	273741	0 %	50 %	50 %	0 %	68248800
128	NC_007146	TTGGTA	2	12	278546	278557	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	68248805
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130	NC_007146	ATCTGC	2	12	290476	290487	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	68248818
131	NC_007146	TATGTC	2	12	291710	291721	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68248820
132	NC_007146	AAAAAC	2	12	292729	292740	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	68248820
133	NC_007146	ATCCCC	2	12	296037	296048	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	68248822
134	NC_007146	AGTTCC	2	12	296621	296632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	68248822
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137	NC_007146	CAACAT	2	12	303671	303682	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	68248827
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139	NC_007146	CTTTCG	2	12	308998	309009	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007146	AACCCC	2	12	310437	310448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_007146	GCCTTC	2	12	310546	310557	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007146	AATCCT	2	12	314270	314281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248831
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147	NC_007146	TATTGA	2	12	325606	325617	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68248840
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150	NC_007146	GTTGCC	2	12	332609	332620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248848
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177	NC_007146	ACTTGA	2	12	385166	385177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	68248892
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200	NC_007146	AAGGCT	2	12	435906	435917	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68248944
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221	NC_007146	AAAAAT	2	12	505173	505184	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_007146	CTTAGA	2	12	505518	505529	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	68249016
223	NC_007146	GGTATT	2	12	508307	508318	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	68249020
224	NC_007146	CCGTAC	2	12	513551	513562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
225	NC_007146	TACAAG	2	12	514761	514772	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	68249025
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229	NC_007146	CTTAAA	2	12	530017	530028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68249041
230	NC_007146	GTAAAA	2	12	533316	533327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	68249044
231	NC_007146	TAAAAT	2	12	535587	535598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68249046
232	NC_007146	ACAAGA	2	12	536509	536520	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	68249046
233	NC_007146	TCGTTT	2	12	545180	545191	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	68249057
234	NC_007146	CAGATA	2	12	545740	545751	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	68249057
235	NC_007146	ACATTC	2	12	554623	554634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68249064
236	NC_007146	TCTTGC	2	12	559764	559775	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	68249069
237	NC_007146	ACGTGC	2	12	570417	570428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	68249081
238	NC_007146	TTGTTT	2	12	572731	572742	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	68249083
239	NC_007146	CAGATG	2	12	573348	573359	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68249083
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354	NC_007146	TTTCAA	2	12	795428	795439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
355	NC_007146	AATGCA	2	12	795881	795892	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
356	NC_007146	TGAAGC	2	12	797237	797248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68249289
357	NC_007146	GAAATG	2	12	800259	800270	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	68249293
358	NC_007146	GCTGAA	2	12	802501	802512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68249296
359	NC_007146	TATGGT	2	12	804870	804881	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	68249299
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361	NC_007146	TTGATA	2	12	804964	804975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	68249299
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363	NC_007146	GGGGTT	2	12	806633	806644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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366	NC_007146	TTATTG	2	12	814597	814608	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	68249302
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375	NC_007146	GGGGTT	2	12	839957	839968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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386	NC_007146	AAAATA	2	12	859883	859894	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
387	NC_007146	CGTGAA	2	12	862322	862333	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68249337
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448	NC_007146	GCTGCA	2	12	992822	992833	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	68249470
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461	NC_007146	GGTTTA	2	12	1018398	1018409	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	68249490
462	NC_007146	CCTTGT	2	12	1023658	1023669	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	68249495
463	NC_007146	CAATGG	2	12	1025037	1025048	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68249497
464	NC_007146	CTGCAG	2	12	1027849	1027860	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161761272
465	NC_007146	CCAAAT	2	12	1028643	1028654	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	68249500
466	NC_007146	TCTGTA	2	12	1028773	1028784	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	68249500
467	NC_007146	CCATTC	2	12	1029239	1029250	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	68249501
468	NC_007146	CTTTTG	2	12	1030247	1030258	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	68249502
469	NC_007146	ATTACT	3	18	1031201	1031218	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	68249503
470	NC_007146	AGAAAT	2	12	1034606	1034617	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	68249505
471	NC_007146	TAAACG	2	12	1035036	1035047	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	68249505
472	NC_007146	CAACTT	2	12	1036777	1036788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68249507
473	NC_007146	TATCAA	2	12	1038478	1038489	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	68249507
474	NC_007146	GCAGAT	2	12	1038898	1038909	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	68249507
475	NC_007146	GCCACT	2	12	1041781	1041792	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	68249510
476	NC_007146	TCTTCA	2	12	1041793	1041804	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	68249510
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493	NC_007146	CTTCTG	2	12	1080729	1080740	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	68249550
494	NC_007146	TTCCAC	2	12	1081463	1081474	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	68249551
495	NC_007146	GGCGAA	2	12	1085444	1085455	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	68249555
496	NC_007146	CTAATT	2	12	1087177	1087188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	68249556
497	NC_007146	ACCAGC	2	12	1088098	1088109	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	68249558
498	NC_007146	TGGTAC	2	12	1093236	1093247	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	68249563
499	NC_007146	AATTTG	2	12	1095201	1095212	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_007146	AATTTC	2	12	1097397	1097408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	68249568

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