MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae 86-028NP chromosome

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007146	GAAAAA	2	12	10411	10422	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007146	GAAAAG	2	12	17955	17966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007146	GCCTTT	2	12	99808	99819	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007146	CTTTTC	2	12	101064	101075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007146	TTTTGA	2	12	133924	133935	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007146	AAAATA	2	12	142092	142103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007146	TAAGAT	2	12	144043	144054	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007146	GCATCA	2	12	183303	183314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007146	ATTTCA	2	12	190501	190512	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007146	CTTTCG	2	12	192475	192486	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007146	AACCCC	2	12	193914	193925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_007146	GCCTTC	2	12	194023	194034	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007146	TGAAAA	2	12	199834	199845	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007146	AAAATT	2	12	216102	216113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007146	GCATTA	2	12	241245	241256	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007146	AAAAAT	2	12	254217	254228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007146	ATTTCA	2	12	307024	307035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007146	CTTTCG	2	12	308998	309009	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007146	AACCCC	2	12	310437	310448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007146	GCCTTC	2	12	310546	310557	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007146	AGAAAA	2	12	366821	366832	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007146	TTACGT	2	12	372024	372035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007146	TAAATT	2	12	384873	384884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007146	TAAGGT	2	12	390816	390827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007146	AAAAAT	2	12	505173	505184	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007146	CCGTAC	2	12	513551	513562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007146	ATAAAA	2	12	597839	597850	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007146	CTTTTA	3	18	625469	625486	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007146	ATAAAA	2	12	634953	634964	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007146	ATTTCA	2	12	679879	679890	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007146	CTTTCG	2	12	681852	681863	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007146	CTAAAA	2	12	682392	682403	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007146	AACCCC	2	12	683531	683542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007146	GCCTTC	2	12	683640	683651	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007146	AATTGA	2	12	693369	693380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007146	AGGAAA	2	12	694319	694330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007146	TCTGTA	2	12	767487	767498	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007146	TGAGCT	2	12	770016	770027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007146	CTCGAT	2	12	793418	793429	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007146	TCTTTA	2	12	794704	794715	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007146	TTTCAA	2	12	795428	795439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007146	AATGCA	2	12	795881	795892	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007146	CGAAGG	2	12	806523	806534	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007146	GGGGTT	2	12	806633	806644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007146	AGCGAA	2	12	808070	808081	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007146	TGAAAT	2	12	810046	810057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007146	CGAAGG	2	12	839847	839858	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007146	GGGGTT	2	12	839957	839968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007146	GTTATT	2	12	841063	841074	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007146	GTTTTA	2	12	841101	841112	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007146	AGCGAA	2	12	841640	841651	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007146	TGAAAT	2	12	843616	843627	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007146	GTTTTT	2	12	844923	844934	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007146	TCAATA	2	12	857150	857161	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007146	AAAATA	2	12	859883	859894	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007146	ATAACG	2	12	890692	890703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007146	TAACTA	2	12	890935	890946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007146	GATTGG	2	12	909446	909457	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007146	GAGGAT	2	12	910177	910188	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007146	TCTTTT	2	12	910278	910289	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007146	TAAACA	2	12	915885	915896	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007146	GCTAAA	2	12	936528	936539	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007146	TCATTT	2	12	938852	938863	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007146	CACTTG	2	12	961473	961484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007146	TAACTT	2	12	966761	966772	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007146	TGAAAT	2	12	967688	967699	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007146	TTAATT	2	12	991495	991506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007146	TAAGTT	2	12	1000931	1000942	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007146	AATTTG	2	12	1095201	1095212	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007146	TAATGA	2	12	1110751	1110762	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007146	TTTATA	2	12	1125891	1125902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007146	GAGATC	2	12	1131019	1131030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007146	ATATTC	2	12	1141830	1141841	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007146	ATTCTT	2	12	1183403	1183414	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007146	TACTTT	2	12	1228078	1228089	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007146	ATATGT	2	12	1303911	1303922	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007146	TTGTAA	2	12	1309487	1309498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007146	TATAAA	2	12	1369836	1369847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007146	TTCCCT	2	12	1378754	1378765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007146	ATGTTG	2	12	1422176	1422187	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007146	TTTCAT	2	12	1425842	1425853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007146	GAAAGG	2	12	1430159	1430170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007146	TCTGTA	2	12	1431315	1431326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007146	ATAAAA	2	12	1464211	1464222	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007146	TAGTTT	2	12	1501116	1501127	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007146	ATTTTT	2	12	1510079	1510090	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007146	TCAATT	2	12	1557546	1557557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007146	ATTTTA	2	12	1570956	1570967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007146	TTAAAT	2	12	1572105	1572116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007146	TTGGTT	2	12	1603290	1603301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007146	ATTTTT	2	12	1614412	1614423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007146	AAAAGT	2	12	1620698	1620709	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007146	TTAAGT	2	12	1638979	1638990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007146	TAGTAA	2	12	1702017	1702028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007146	TGTAAC	2	12	1703454	1703465	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007146	AACAAA	2	12	1796409	1796420	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007146	TAAAGA	2	12	1798724	1798735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007146	ATCTAA	2	12	1862719	1862730	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007146	CTAAAT	2	12	1863369	1863380	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_007146	CTAATG	2	12	1863525	1863536	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007146	GATAGT	2	12	1863795	1863806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007146	CAAAAC	2	12	1863900	1863911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007146	TCTAAA	2	12	1866542	1866553	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_007146	AGGTTT	2	12	1893299	1893310	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007146	TAAAAA	2	12	1898411	1898422	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007146	ATTTCA	2	12	1901965	1901976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007146	CTTTCG	2	12	1903939	1903950	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007146	CTAAAA	2	12	1904479	1904490	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007146	AACCCC	2	12	1905618	1905629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007146	GCCTTC	2	12	1905727	1905738	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.