MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae 86-028NP chromosome

Total Repeats: 1530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007146	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	68248552
2	NC_007146	CAATT	2	10	1633	1642	40 %	40 %	0 %	20 %	68248553
3	NC_007146	CGCAC	2	10	3259	3268	20 %	0 %	20 %	60 %	68248554
4	NC_007146	ATTCT	2	10	4318	4327	20 %	60 %	0 %	20 %	68248555
5	NC_007146	TAAAA	2	10	4770	4779	80 %	20 %	0 %	0 %	68248556
6	NC_007146	TGCAC	2	10	9071	9080	20 %	20 %	20 %	40 %	68248558
7	NC_007146	TATTG	2	10	9181	9190	20 %	60 %	20 %	0 %	68248558
8	NC_007146	AATTT	2	10	10890	10899	40 %	60 %	0 %	0 %	68248560
9	NC_007146	ATTTG	2	10	13138	13147	20 %	60 %	20 %	0 %	68248563
10	NC_007146	TTATT	2	10	15024	15033	20 %	80 %	0 %	0 %	68248566
11	NC_007146	CAACC	2	10	17104	17113	40 %	0 %	0 %	60 %	68248567
12	NC_007146	AAAAC	2	10	17994	18003	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007146	GAAAA	2	10	18713	18722	80 %	0 %	20 %	0 %	68248569
14	NC_007146	GGCTT	2	10	18898	18907	0 %	40 %	40 %	20 %	68248569
15	NC_007146	TTAAA	2	10	21203	21212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007146	AATAC	2	10	21732	21741	60 %	20 %	0 %	20 %	68248571
17	NC_007146	CAATT	2	10	25949	25958	40 %	40 %	0 %	20 %	68248574
18	NC_007146	AACAT	2	10	27986	27995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007146	CTTTT	2	10	29991	30000	0 %	80 %	0 %	20 %	68248579
20	NC_007146	ATAAA	2	10	30164	30173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007146	AAAAT	2	10	32637	32646	80 %	20 %	0 %	0 %	68248582
22	NC_007146	TAAAC	2	10	33696	33705	60 %	20 %	0 %	20 %	68248583
23	NC_007146	CAATC	2	10	36004	36013	40 %	20 %	0 %	40 %	68248585
24	NC_007146	AATTA	2	10	36071	36080	60 %	40 %	0 %	0 %	68248585
25	NC_007146	AAGAA	2	10	36685	36694	80 %	0 %	20 %	0 %	68248586
26	NC_007146	TTACC	2	10	39449	39458	20 %	40 %	0 %	40 %	68248587
27	NC_007146	TGGTA	2	10	40998	41007	20 %	40 %	40 %	0 %	229335608
28	NC_007146	CCCCT	2	10	41280	41289	0 %	20 %	0 %	80 %	68248589
29	NC_007146	AATGC	2	10	43699	43708	40 %	20 %	20 %	20 %	68248592
30	NC_007146	ATTTT	2	10	45185	45194	20 %	80 %	0 %	0 %	68248594
31	NC_007146	GCCAA	2	10	46025	46034	40 %	0 %	20 %	40 %	68248594
32	NC_007146	TTCCA	2	10	46641	46650	20 %	40 %	0 %	40 %	68248595
33	NC_007146	TTATG	2	10	48443	48452	20 %	60 %	20 %	0 %	68248598
34	NC_007146	TCATT	2	10	49285	49294	20 %	60 %	0 %	20 %	68248599
35	NC_007146	ACAAA	2	10	53789	53798	80 %	0 %	0 %	20 %	68248602
36	NC_007146	ATTTC	2	10	54133	54142	20 %	60 %	0 %	20 %	68248603
37	NC_007146	TAATT	2	10	54579	54588	40 %	60 %	0 %	0 %	68248603
38	NC_007146	TATGA	2	10	56104	56113	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007146	AATCA	2	10	58669	58678	60 %	20 %	0 %	20 %	68248607
40	NC_007146	AATGC	2	10	59287	59296	40 %	20 %	20 %	20 %	68248608
41	NC_007146	CACAG	2	10	63259	63268	40 %	0 %	20 %	40 %	68248611
42	NC_007146	TTGCC	2	10	64347	64356	0 %	40 %	20 %	40 %	68248611
43	NC_007146	TAAAT	2	10	65576	65585	60 %	40 %	0 %	0 %	68248612
44	NC_007146	GCTTC	2	10	69853	69862	0 %	40 %	20 %	40 %	68248616
45	NC_007146	ATTTT	2	10	70308	70317	20 %	80 %	0 %	0 %	68248617
46	NC_007146	GCCTT	2	10	74044	74053	0 %	40 %	20 %	40 %	68248619
47	NC_007146	TGAAA	2	10	75389	75398	60 %	20 %	20 %	0 %	68248620
48	NC_007146	ATGTT	2	10	77246	77255	20 %	60 %	20 %	0 %	68248620
49	NC_007146	ATTTA	2	10	79180	79189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007146	AGGTA	2	10	79374	79383	40 %	20 %	40 %	0 %	68248622
51	NC_007146	CAACG	2	10	82293	82302	40 %	0 %	20 %	40 %	68248626
52	NC_007146	AGAAA	2	10	83653	83662	80 %	0 %	20 %	0 %	68248626
53	NC_007146	GAAGA	2	10	84007	84016	60 %	0 %	40 %	0 %	68248626
54	NC_007146	ACATC	2	10	86121	86130	40 %	20 %	0 %	40 %	68248628
55	NC_007146	TTACA	2	10	86657	86666	40 %	40 %	0 %	20 %	68248629
56	NC_007146	TGATT	2	10	87969	87978	20 %	60 %	20 %	0 %	68248631
57	NC_007146	AATTT	2	10	88127	88136	40 %	60 %	0 %	0 %	68248631
58	NC_007146	CACAT	2	10	91269	91278	40 %	20 %	0 %	40 %	68248636
59	NC_007146	CTTCT	2	10	92339	92348	0 %	60 %	0 %	40 %	68248637
60	NC_007146	CGTTA	2	10	94672	94681	20 %	40 %	20 %	20 %	68248639
61	NC_007146	CGTTA	2	10	96795	96804	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007146	AATTA	2	10	96912	96921	60 %	40 %	0 %	0 %	68248641
63	NC_007146	TGGCA	2	10	97027	97036	20 %	20 %	40 %	20 %	68248641
64	NC_007146	CAGTA	2	10	97689	97698	40 %	20 %	20 %	20 %	68248641
65	NC_007146	GTACT	2	10	97724	97733	20 %	40 %	20 %	20 %	68248641
66	NC_007146	GTGAA	2	10	97876	97885	40 %	20 %	40 %	0 %	68248641
67	NC_007146	TGAAG	2	10	101168	101177	40 %	20 %	40 %	0 %	68248646
68	NC_007146	TTTGC	2	10	102415	102424	0 %	60 %	20 %	20 %	68248647
69	NC_007146	CTTTG	2	10	102610	102619	0 %	60 %	20 %	20 %	68248647
70	NC_007146	CTTTT	2	10	104331	104340	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007146	GCCTT	2	10	104472	104481	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_007146	GATTG	2	10	107119	107128	20 %	40 %	40 %	0 %	68248653
73	NC_007146	GATTG	2	10	107440	107449	20 %	40 %	40 %	0 %	68248653
74	NC_007146	CTTTT	2	10	108328	108337	0 %	80 %	0 %	20 %	68248654
75	NC_007146	TCAAA	2	10	110558	110567	60 %	20 %	0 %	20 %	68248657
76	NC_007146	TCTTT	2	10	113650	113659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007146	ACTTT	2	10	115188	115197	20 %	60 %	0 %	20 %	68248662
78	NC_007146	TATTC	2	10	116704	116713	20 %	60 %	0 %	20 %	68248665
79	NC_007146	GCGGT	2	10	116781	116790	0 %	20 %	60 %	20 %	68248665
80	NC_007146	TTTCT	2	10	117534	117543	0 %	80 %	0 %	20 %	68248666
81	NC_007146	TTGCC	2	10	123372	123381	0 %	40 %	20 %	40 %	68248671
82	NC_007146	TAATA	2	10	124503	124512	60 %	40 %	0 %	0 %	68248672
83	NC_007146	TGATC	2	10	126050	126059	20 %	40 %	20 %	20 %	68248673
84	NC_007146	TTTAA	2	10	129642	129651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007146	GCCTT	2	10	134061	134070	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_007146	ATTTT	2	10	134525	134534	20 %	80 %	0 %	0 %	68248681
87	NC_007146	TATAT	2	10	137391	137400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007146	ATGTT	2	10	137954	137963	20 %	60 %	20 %	0 %	68248687
89	NC_007146	AACAA	2	10	139921	139930	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_007146	CTTCC	2	10	140203	140212	0 %	40 %	0 %	60 %	68248691
91	NC_007146	ATTTC	2	10	141713	141722	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007146	AAATG	2	10	142453	142462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007146	TTTTG	2	10	144591	144600	0 %	80 %	20 %	0 %	68248695
94	NC_007146	GTCGA	2	10	146727	146736	20 %	20 %	40 %	20 %	68248696
95	NC_007146	AAAAT	2	10	148955	148964	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007146	ATGCC	2	10	152744	152753	20 %	20 %	20 %	40 %	68248700
97	NC_007146	TTTGA	2	10	153435	153444	20 %	60 %	20 %	0 %	68248700
98	NC_007146	AAATT	2	10	154864	154873	60 %	40 %	0 %	0 %	68248702
99	NC_007146	CTTGC	2	10	155777	155786	0 %	40 %	20 %	40 %	68248702
100	NC_007146	GCAAT	2	10	156471	156480	40 %	20 %	20 %	20 %	68248703
101	NC_007146	CCAAT	2	10	159909	159918	40 %	20 %	0 %	40 %	68248706
102	NC_007146	CAATT	2	10	160208	160217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_007146	GTTTT	2	10	160586	160595	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007146	CTGAA	2	10	160671	160680	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007146	TACGC	2	10	163962	163971	20 %	20 %	20 %	40 %	68248710
106	NC_007146	GCAAA	2	10	164633	164642	60 %	0 %	20 %	20 %	68248711
107	NC_007146	TGTAA	2	10	167275	167284	40 %	40 %	20 %	0 %	68248714
108	NC_007146	GTGAT	2	10	169916	169925	20 %	40 %	40 %	0 %	68248716
109	NC_007146	TACTT	2	10	169956	169965	20 %	60 %	0 %	20 %	68248716
110	NC_007146	TTACC	2	10	170837	170846	20 %	40 %	0 %	40 %	68248716
111	NC_007146	CAAAC	2	10	171831	171840	60 %	0 %	0 %	40 %	68248716
112	NC_007146	AACAA	2	10	173485	173494	80 %	0 %	0 %	20 %	68248717
113	NC_007146	GATTT	2	10	176700	176709	20 %	60 %	20 %	0 %	68248719
114	NC_007146	GGTTG	2	10	179646	179655	0 %	40 %	60 %	0 %	68248720
115	NC_007146	AGGCA	2	10	179804	179813	40 %	0 %	40 %	20 %	68248720
116	NC_007146	TGGCG	2	10	180497	180506	0 %	20 %	60 %	20 %	68248721
117	NC_007146	GTATT	2	10	182334	182343	20 %	60 %	20 %	0 %	68248722
118	NC_007146	GCTTT	2	10	182458	182467	0 %	60 %	20 %	20 %	68248723
119	NC_007146	CAAAA	2	10	186146	186155	80 %	0 %	0 %	20 %	68248728
120	NC_007146	AATGG	2	10	186358	186367	40 %	20 %	40 %	0 %	68248728
121	NC_007146	GTTAT	2	10	187847	187856	20 %	60 %	20 %	0 %	68248728
122	NC_007146	AAACT	2	10	188637	188646	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007146	GTCTA	2	10	188674	188683	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007146	TTAAT	2	10	189211	189220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007146	TAACC	2	10	191080	191089	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007146	CGACT	2	10	191523	191532	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_007146	TCGGT	2	10	191898	191907	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007146	TCGCT	2	10	192125	192134	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_007146	GCTTC	2	10	193493	193502	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_007146	TTCAA	2	10	194747	194756	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_007146	AAGAT	2	10	195022	195031	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007146	ATCAA	2	10	195635	195644	60 %	20 %	0 %	20 %	68248729
133	NC_007146	AAATC	2	10	196817	196826	60 %	20 %	0 %	20 %	68248729
134	NC_007146	AAAGT	2	10	197349	197358	60 %	20 %	20 %	0 %	68248729
135	NC_007146	AAAAG	2	10	197582	197591	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007146	AAAAG	2	10	203036	203045	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007146	TAACT	2	10	204654	204663	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007146	AAAAC	2	10	205261	205270	80 %	0 %	0 %	20 %	68248736
139	NC_007146	AAATA	2	10	206004	206013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_007146	GGTTA	2	10	376115	376124	20 %	40 %	40 %	0 %	161761279
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