MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae 86-028NP chromosome

Total Repeats: 25433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007146	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68248552
2	NC_007146	TGA	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248552
3	NC_007146	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248552
4	NC_007146	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	68248552
5	NC_007146	ACA	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248552
6	NC_007146	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248552
7	NC_007146	GCG	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	68248552
8	NC_007146	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248552
9	NC_007146	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248552
10	NC_007146	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248552
11	NC_007146	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248552
12	NC_007146	TGT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248552
13	NC_007146	TAG	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248552
14	NC_007146	AAT	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007146	TTC	2	6	1136	1141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007146	CAA	3	9	1248	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248553
17	NC_007146	ATA	2	6	1414	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248553
18	NC_007146	TCG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248553
19	NC_007146	TCA	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248553
20	NC_007146	ACA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248553
21	NC_007146	CAA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248553
22	NC_007146	ATT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248553
23	NC_007146	GGC	2	6	1919	1924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	68248553
24	NC_007146	TTC	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248553
25	NC_007146	AGA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248553
26	NC_007146	AAT	2	6	2093	2098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248553
27	NC_007146	GAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248553
28	NC_007146	ATT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248553
29	NC_007146	ATG	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248553
30	NC_007146	GGA	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	68248553
31	NC_007146	AAT	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248553
32	NC_007146	AAG	2	6	2484	2489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248553
33	NC_007146	AGA	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248553
34	NC_007146	ATC	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248553
35	NC_007146	ATT	2	6	2792	2797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248553
36	NC_007146	AAG	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248553
37	NC_007146	ATT	2	6	3050	3055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248554
38	NC_007146	TCT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248554
39	NC_007146	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248554
40	NC_007146	AAT	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248554
41	NC_007146	TCT	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248554
42	NC_007146	AAT	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248554
43	NC_007146	TCA	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248554
44	NC_007146	ATT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248554
45	NC_007146	TAA	2	6	3520	3525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248554
46	NC_007146	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248554
47	NC_007146	ATT	2	6	3657	3662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248554
48	NC_007146	TAA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248554
49	NC_007146	CAT	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248554
50	NC_007146	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248555
51	NC_007146	ATC	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248555
52	NC_007146	TTC	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248555
53	NC_007146	AAC	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248555
54	NC_007146	GAC	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68248555
55	NC_007146	AAT	2	6	4437	4442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007146	CCA	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007146	GCG	2	6	4690	4695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	68248556
58	NC_007146	ACG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68248556
59	NC_007146	ACA	2	6	5146	5151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248556
60	NC_007146	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248556
61	NC_007146	AAT	2	6	5181	5186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248556
62	NC_007146	CAT	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248556
63	NC_007146	TTG	2	6	5313	5318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248556
64	NC_007146	TTA	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007146	ATT	2	6	5434	5439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007146	TTG	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007146	GAT	2	6	5550	5555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007146	CTA	2	6	5601	5606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007146	CAA	2	6	5636	5641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007146	TTG	3	9	5643	5651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007146	AAG	2	6	5675	5680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248557
72	NC_007146	TTC	2	6	5685	5690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248557
73	NC_007146	AGG	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	68248557
74	NC_007146	ATT	2	6	5780	5785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248557
75	NC_007146	TGT	2	6	5839	5844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248557
76	NC_007146	AGC	2	6	5877	5882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68248557
77	NC_007146	ATC	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248557
78	NC_007146	GTG	2	6	5950	5955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	68248557
79	NC_007146	TTG	2	6	6121	6126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248557
80	NC_007146	TTA	2	6	6210	6215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248557
81	NC_007146	CAT	2	6	6304	6309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248557
82	NC_007146	ATC	2	6	6363	6368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248557
83	NC_007146	GAA	2	6	6428	6433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248557
84	NC_007146	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248557
85	NC_007146	CAT	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248557
86	NC_007146	TGA	2	6	6620	6625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248557
87	NC_007146	GAA	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248557
88	NC_007146	TGA	2	6	6710	6715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248557
89	NC_007146	ACA	2	6	6746	6751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248557
90	NC_007146	CTT	2	6	6842	6847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248557
91	NC_007146	GAA	2	6	6858	6863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248557
92	NC_007146	TAT	2	6	7173	7178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248557
93	NC_007146	ATG	2	6	7206	7211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248557
94	NC_007146	TGA	2	6	7312	7317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248557
95	NC_007146	ATC	2	6	7448	7453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248557
96	NC_007146	ATG	2	6	7483	7488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248557
97	NC_007146	ACT	2	6	7530	7535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248557
98	NC_007146	AGA	3	9	7544	7552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248557
99	NC_007146	GAA	2	6	7656	7661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248557
100	NC_007146	TGA	2	6	7865	7870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248557
101	NC_007146	ACA	3	9	7875	7883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248557
102	NC_007146	CCG	2	6	8006	8011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	68248557
103	NC_007146	CAT	2	6	8029	8034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248557
104	NC_007146	ACC	2	6	8132	8137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	68248557
105	NC_007146	GTA	2	6	8280	8285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248557
106	NC_007146	AGA	2	6	8312	8317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248557
107	NC_007146	CAA	2	6	8359	8364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248557
108	NC_007146	ATC	2	6	8418	8423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248557
109	NC_007146	TCG	2	6	8510	8515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248557
110	NC_007146	ATA	2	6	8747	8752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248557
111	NC_007146	TTA	2	6	8789	8794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248558
112	NC_007146	CAC	2	6	8825	8830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	68248558
113	NC_007146	GTT	2	6	8909	8914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248558
114	NC_007146	GAA	2	6	9025	9030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248558
115	NC_007146	GTT	2	6	9089	9094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248558
116	NC_007146	AGA	2	6	9336	9341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248558
117	NC_007146	AAC	2	6	9359	9364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248558
118	NC_007146	TCC	2	6	9414	9419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	68248558
119	NC_007146	ACT	2	6	9593	9598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248558
120	NC_007146	AGA	3	9	9618	9626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248558
121	NC_007146	ATC	3	9	9635	9643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248558
122	NC_007146	GAA	2	6	9652	9657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248558
123	NC_007146	AAT	2	6	9679	9684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248558
124	NC_007146	TTC	2	6	9803	9808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248559
125	NC_007146	TTC	2	6	9890	9895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248559
126	NC_007146	TTA	2	6	10076	10081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248559
127	NC_007146	CAT	2	6	10090	10095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248559
128	NC_007146	TTG	2	6	10245	10250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248559
129	NC_007146	CAC	2	6	10283	10288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	68248559
130	NC_007146	GAA	2	6	10304	10309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248559
131	NC_007146	TAT	2	6	10449	10454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007146	ATC	2	6	10602	10607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248560
133	NC_007146	ATT	2	6	10617	10622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248560
134	NC_007146	TAT	2	6	10623	10628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248560
135	NC_007146	TGC	2	6	10630	10635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248560
136	NC_007146	TGA	2	6	10780	10785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248560
137	NC_007146	TGC	2	6	10813	10818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248560
138	NC_007146	CTG	2	6	10848	10853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248560
139	NC_007146	CAG	2	6	10903	10908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68248560
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141	NC_007146	CAA	2	6	10964	10969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248560
142	NC_007146	ATA	2	6	10977	10982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248560
143	NC_007146	GAA	2	6	11180	11185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248560
144	NC_007146	ATG	2	6	11237	11242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248560
145	NC_007146	GAT	2	6	11279	11284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248560
146	NC_007146	GAA	2	6	11315	11320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248560
147	NC_007146	CAG	2	6	11361	11366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68248560
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150	NC_007146	CAA	2	6	11607	11612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248561
151	NC_007146	TGA	2	6	11635	11640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248561
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153	NC_007146	ATT	2	6	11757	11762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248561
154	NC_007146	ATA	2	6	11851	11856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248561
155	NC_007146	GCT	2	6	11869	11874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248562
156	NC_007146	TTG	2	6	11879	11884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248562
157	NC_007146	TGA	2	6	11904	11909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248562
158	NC_007146	TGC	2	6	11922	11927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248562
159	NC_007146	GCT	2	6	12025	12030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248562
160	NC_007146	CAA	2	6	12113	12118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248562
161	NC_007146	AGA	2	6	12249	12254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248562
162	NC_007146	TTA	2	6	12315	12320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_007146	TAT	2	6	12435	12440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248563
164	NC_007146	TCA	2	6	12491	12496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248563
165	NC_007146	TAT	2	6	12590	12595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248563
166	NC_007146	TCG	2	6	12757	12762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248563
167	NC_007146	ATA	2	6	12933	12938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248563
168	NC_007146	CTA	2	6	13008	13013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248563
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170	NC_007146	ATG	2	6	13170	13175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248563
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172	NC_007146	ACA	2	6	13297	13302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248563
173	NC_007146	AAT	2	6	13388	13393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_007146	TCA	2	6	13471	13476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248564
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179	NC_007146	ATT	2	6	13854	13859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248564
180	NC_007146	TAA	2	6	13919	13924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248564
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192	NC_007146	ACC	2	6	14714	14719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	68248565
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234	NC_007146	CCT	2	6	18436	18441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
235	NC_007146	ATA	3	9	18455	18463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_007146	AAT	2	6	18606	18611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_007146	TTA	2	6	18669	18674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_007146	AAT	2	6	19972	19977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248570
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261	NC_007146	CAT	2	6	20301	20306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248570
262	NC_007146	GAC	2	6	20313	20318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68248570
263	NC_007146	CTT	2	6	20322	20327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248570
264	NC_007146	ACC	2	6	20479	20484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	68248570
265	NC_007146	ATA	2	6	20537	20542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248570
266	NC_007146	CTT	2	6	20577	20582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248570
267	NC_007146	GCC	2	6	20596	20601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	68248570
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272	NC_007146	TAA	2	6	20761	20766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248570
273	NC_007146	AAT	2	6	20868	20873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_007146	ACT	2	6	21170	21175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_007146	TAA	2	6	21245	21250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248571
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283	NC_007146	CAA	2	6	21763	21768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68248571
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389	NC_007146	TTC	2	6	30796	30801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248580
390	NC_007146	AAT	2	6	30814	30819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248580
391	NC_007146	AAT	2	6	30829	30834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248580
392	NC_007146	GAA	2	6	30851	30856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248580
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394	NC_007146	TTG	2	6	30916	30921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68248580
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402	NC_007146	TTA	2	6	31433	31438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248581
403	NC_007146	TCA	2	6	31487	31492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248581
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419	NC_007146	AAT	2	6	33278	33283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68248582
420	NC_007146	TTA	2	6	33288	33293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248582
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431	NC_007146	TCT	2	6	34084	34089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68248583
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455	NC_007146	CTG	2	6	35747	35752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248584
456	NC_007146	AAG	2	6	35825	35830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248584
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459	NC_007146	GAT	2	6	36144	36149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68248585
460	NC_007146	ATT	2	6	36344	36349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_007146	TGC	2	6	36357	36362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248586
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473	NC_007146	ATC	2	6	37290	37295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68248586
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482	NC_007146	AAG	2	6	37977	37982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68248586
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490	NC_007146	TAT	2	6	38572	38577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248587
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494	NC_007146	TAT	2	6	38801	38806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248587
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497	NC_007146	GTC	2	6	38915	38920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68248587
498	NC_007146	TTA	2	6	38939	38944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248587
499	NC_007146	CAG	2	6	39052	39057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68248587
500	NC_007146	ATT	2	6	39085	39090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68248587

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