MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007111	GATTAT	2	12	2224	2235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67459865
2	NC_007111	AAAATT	2	12	3125	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007111	TCTAAA	2	12	3703	3714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67459867
4	NC_007111	AAATTC	2	12	4179	4190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67459867
5	NC_007111	TTATTG	2	12	5947	5958	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	67459868
6	NC_007111	TTTAAG	2	12	6777	6788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67459869
7	NC_007111	GATAAT	2	12	11002	11013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67459873
8	NC_007111	TGTTGG	2	12	12332	12343	0 %	50 %	50 %	0 %	67459875
9	NC_007111	TATAGC	2	12	13849	13860	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	67459877
10	NC_007111	TGCTCT	2	12	21834	21845	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	67459884
11	NC_007111	TGATAA	2	12	22363	22374	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67459885
12	NC_007111	AGCAGT	2	12	30532	30543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	67459895
13	NC_007111	AATGTA	2	12	32543	32554	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67459899
14	NC_007111	TTTTAT	2	12	32872	32883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	67459899
15	NC_007111	AACGTA	2	12	32975	32986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67459899
16	NC_007111	TTCTGC	2	12	33992	34003	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	67459900
17	NC_007111	ACTGAA	2	12	35062	35073	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67459901
18	NC_007111	GTTATA	2	12	35560	35571	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67459903

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.