MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007111	ATTTA	2	10	3861	3870	40 %	60 %	0 %	0 %	67459867
2	NC_007111	AATGA	2	10	5422	5431	60 %	20 %	20 %	0 %	67459867
3	NC_007111	AAGAG	2	10	5556	5565	60 %	0 %	40 %	0 %	67459867
4	NC_007111	AAGCG	2	10	5959	5968	40 %	0 %	40 %	20 %	67459868
5	NC_007111	GAATT	2	10	6280	6289	40 %	40 %	20 %	0 %	67459868
6	NC_007111	ATAAA	2	10	6379	6388	80 %	20 %	0 %	0 %	67459868
7	NC_007111	TTGTT	2	10	8736	8745	0 %	80 %	20 %	0 %	67459872
8	NC_007111	TTTTG	2	10	11698	11707	0 %	80 %	20 %	0 %	67459874
9	NC_007111	AGAGT	2	10	15002	15011	40 %	20 %	40 %	0 %	67459877
10	NC_007111	TTAAA	2	10	15570	15579	60 %	40 %	0 %	0 %	67459877
11	NC_007111	TCAGC	2	10	16703	16712	20 %	20 %	20 %	40 %	67459878
12	NC_007111	TTCTC	2	10	17333	17342	0 %	60 %	0 %	40 %	67459879
13	NC_007111	TAGCT	2	10	17965	17974	20 %	40 %	20 %	20 %	67459879
14	NC_007111	TTTAT	2	10	21144	21153	20 %	80 %	0 %	0 %	67459884
15	NC_007111	ACCAT	2	10	24661	24670	40 %	20 %	0 %	40 %	67459888
16	NC_007111	GGGTA	2	10	25231	25240	20 %	20 %	60 %	0 %	67459889
17	NC_007111	ATCTT	2	10	30339	30348	20 %	60 %	0 %	20 %	67459895
18	NC_007111	TGTTT	2	10	31635	31644	0 %	80 %	20 %	0 %	67459897
19	NC_007111	ATTTA	2	10	32043	32052	40 %	60 %	0 %	0 %	67459898
20	NC_007111	AAGAA	2	10	36817	36826	80 %	0 %	20 %	0 %	67459904
21	NC_007111	ATTTT	2	10	38429	38438	20 %	80 %	0 %	0 %	67459906

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.