MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007111	CTAT	2	8	618	625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007111	GTAT	2	8	1707	1714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007111	TAAA	2	8	3015	3022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007111	AGAT	2	8	3199	3206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007111	ATAG	2	8	3297	3304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007111	TAAA	2	8	3336	3343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007111	CTTT	2	8	8321	8328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007111	AAGT	2	8	9170	9177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007111	TCTT	2	8	9245	9252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007111	ATAC	2	8	18844	18851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007111	TAAA	2	8	25411	25418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007111	CTAT	2	8	28056	28063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007111	TTAA	2	8	28148	28155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007111	TACT	2	8	28168	28175	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007111	CATT	2	8	31435	31442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007111	GATA	2	8	34511	34518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007111	ATTT	2	8	36028	36035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007111	ATAC	2	8	36330	36337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007111	CATT	2	8	37497	37504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007111	GTTA	2	8	37594	37601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007111	ATAC	2	8	37898	37905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007111	TAAA	2	8	37948	37955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007111	TTTA	2	8	38102	38109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007111	CTTT	2	8	38147	38154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.