MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta

Total Repeats: 611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007111	GGT	2	6	16	21	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007111	TAA	2	6	37	42	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007111	TAC	2	6	98	103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007111	CCT	2	6	145	150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007111	GAG	3	9	333	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007111	CTC	2	6	381	386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007111	CTA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007111	CAG	2	6	469	474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007111	ATC	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459863
10	NC_007111	TAA	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007111	ATA	2	6	1227	1232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007111	ATT	2	6	1349	1354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459864
13	NC_007111	AGT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459864
14	NC_007111	TAA	2	6	1425	1430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459864
15	NC_007111	ATA	2	6	1493	1498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459864
16	NC_007111	TTA	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459864
17	NC_007111	ATT	2	6	1616	1621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459864
18	NC_007111	TAT	2	6	1743	1748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007111	ATT	2	6	1782	1787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007111	AAT	2	6	1796	1801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007111	ATT	2	6	1864	1869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
22	NC_007111	AAT	2	6	1872	1877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
23	NC_007111	GGT	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67459865
24	NC_007111	CTA	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459865
25	NC_007111	TAA	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
26	NC_007111	TAA	2	6	2067	2072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
27	NC_007111	AAT	2	6	2110	2115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
28	NC_007111	ATT	2	6	2122	2127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
29	NC_007111	TAG	2	6	2166	2171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459865
30	NC_007111	CCA	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67459865
31	NC_007111	AAT	2	6	2301	2306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
32	NC_007111	TTA	2	6	2353	2358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
33	NC_007111	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
34	NC_007111	TAT	2	6	2496	2501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
35	NC_007111	TAA	2	6	2535	2540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
36	NC_007111	TTA	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
37	NC_007111	TAG	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459866
38	NC_007111	AAT	2	6	2677	2682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459866
39	NC_007111	TTA	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459866
40	NC_007111	AAT	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459866
41	NC_007111	AAC	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459866
42	NC_007111	ATT	2	6	2798	2803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459866
43	NC_007111	TTA	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459866
44	NC_007111	TTC	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459866
45	NC_007111	TAT	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007111	TGT	2	6	3053	3058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007111	GTT	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007111	ATT	2	6	3447	3452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
49	NC_007111	AGA	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
50	NC_007111	AAT	2	6	3790	3795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
51	NC_007111	TAC	3	9	3807	3815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459867
52	NC_007111	ACA	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
53	NC_007111	TTA	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
54	NC_007111	TAT	2	6	4070	4075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
55	NC_007111	GTA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459867
56	NC_007111	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
57	NC_007111	CAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459867
58	NC_007111	CAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
59	NC_007111	TTA	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
60	NC_007111	TTA	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
61	NC_007111	ATT	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
62	NC_007111	CAG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459867
63	NC_007111	ATG	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459867
64	NC_007111	GAA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
65	NC_007111	TTA	2	6	4462	4467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
66	NC_007111	ACA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
67	NC_007111	CCT	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459867
68	NC_007111	ATA	3	9	4622	4630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
69	NC_007111	TAA	2	6	4632	4637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
70	NC_007111	GAA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
71	NC_007111	TAC	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459867
72	NC_007111	AAT	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
73	NC_007111	TTA	2	6	4909	4914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
74	NC_007111	ACA	2	6	5029	5034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
75	NC_007111	GAA	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
76	NC_007111	AGG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459867
77	NC_007111	ATA	2	6	5222	5227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
78	NC_007111	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
79	NC_007111	CAA	2	6	5651	5656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
80	NC_007111	AAT	2	6	5680	5685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
81	NC_007111	ATT	2	6	5759	5764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
82	NC_007111	GAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459868
83	NC_007111	GTA	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
84	NC_007111	ATA	2	6	5929	5934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459868
85	NC_007111	TGA	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
86	NC_007111	GAA	2	6	6111	6116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459868
87	NC_007111	ATT	2	6	6126	6131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459868
88	NC_007111	CAA	2	6	6132	6137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459868
89	NC_007111	TGA	2	6	6182	6187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
90	NC_007111	CAA	2	6	6236	6241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459868
91	NC_007111	TCT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459868
92	NC_007111	TAG	2	6	6328	6333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
93	NC_007111	GAT	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
94	NC_007111	ATT	2	6	6439	6444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459868
95	NC_007111	ATT	2	6	6455	6460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459868
96	NC_007111	TGG	2	6	6474	6479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007111	GAT	2	6	6547	6552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459869
98	NC_007111	GGA	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459869
99	NC_007111	TTA	2	6	6746	6751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459869
100	NC_007111	TTA	2	6	6956	6961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459869
101	NC_007111	GTA	2	6	7006	7011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459869
102	NC_007111	ATA	2	6	7124	7129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459869
103	NC_007111	ATT	2	6	7272	7277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459869
104	NC_007111	AGC	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459869
105	NC_007111	CTA	2	6	7384	7389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459869
106	NC_007111	ATC	2	6	7396	7401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459869
107	NC_007111	CTT	2	6	7416	7421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459869
108	NC_007111	TTA	2	6	7479	7484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459869
109	NC_007111	ACA	2	6	7550	7555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459870
110	NC_007111	AGT	2	6	7564	7569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459870
111	NC_007111	CCT	2	6	7614	7619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459870
112	NC_007111	TAT	2	6	7636	7641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459870
113	NC_007111	TAA	2	6	7764	7769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007111	TCT	2	6	7791	7796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007111	TAA	2	6	7812	7817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007111	AAT	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459871
117	NC_007111	AAT	2	6	7957	7962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459871
118	NC_007111	TAA	2	6	8077	8082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459871
119	NC_007111	TCC	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459871
120	NC_007111	GAT	2	6	8144	8149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459871
121	NC_007111	TTC	2	6	8191	8196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459871
122	NC_007111	ATC	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459871
123	NC_007111	TGA	3	9	8254	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459871
124	NC_007111	ATT	2	6	8415	8420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459872
125	NC_007111	TTG	2	6	8453	8458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459872
126	NC_007111	ATA	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459872
127	NC_007111	TAC	2	6	8504	8509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459872
128	NC_007111	ATG	2	6	8516	8521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459872
129	NC_007111	CCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459872
130	NC_007111	CAT	2	6	8600	8605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459872
131	NC_007111	ATT	2	6	8659	8664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459872
132	NC_007111	CTA	2	6	8669	8674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459872
133	NC_007111	TGA	2	6	8817	8822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459872
134	NC_007111	CTT	2	6	8885	8890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459872
135	NC_007111	ATA	3	9	8902	8910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459872
136	NC_007111	TAC	2	6	9040	9045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007111	TAA	2	6	9106	9111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007111	GTT	2	6	9137	9142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007111	TTG	2	6	9150	9155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_007111	TTG	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007111	CAT	2	6	9386	9391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007111	CAT	2	6	9399	9404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007111	ATT	2	6	9414	9419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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385	NC_007111	TTA	2	6	23962	23967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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