MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007111	AT	3	6	295	300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007111	AT	3	6	316	321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007111	AT	3	6	430	435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007111	TA	3	6	780	785	50 %	50 %	0 %	0 %	67459863
5	NC_007111	TA	3	6	1031	1036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007111	AT	3	6	1111	1116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007111	TA	3	6	1212	1217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007111	GT	3	6	1817	1822	0 %	50 %	50 %	0 %	67459865
9	NC_007111	TA	3	6	1934	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	67459865
10	NC_007111	TA	3	6	1995	2000	50 %	50 %	0 %	0 %	67459865
11	NC_007111	AT	3	6	2284	2289	50 %	50 %	0 %	0 %	67459865
12	NC_007111	AT	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	67459865
13	NC_007111	AT	3	6	3088	3093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007111	GA	3	6	3688	3693	50 %	0 %	50 %	0 %	67459867
15	NC_007111	TA	4	8	3759	3766	50 %	50 %	0 %	0 %	67459867
16	NC_007111	TA	3	6	4598	4603	50 %	50 %	0 %	0 %	67459867
17	NC_007111	TA	3	6	4648	4653	50 %	50 %	0 %	0 %	67459867
18	NC_007111	AT	3	6	6152	6157	50 %	50 %	0 %	0 %	67459868
19	NC_007111	AG	3	6	7183	7188	50 %	0 %	50 %	0 %	67459869
20	NC_007111	TA	3	6	7255	7260	50 %	50 %	0 %	0 %	67459869
21	NC_007111	TG	3	6	7297	7302	0 %	50 %	50 %	0 %	67459869
22	NC_007111	TC	3	6	7332	7337	0 %	50 %	0 %	50 %	67459869
23	NC_007111	TA	3	6	7558	7563	50 %	50 %	0 %	0 %	67459870
24	NC_007111	TA	3	6	7715	7720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007111	TA	3	6	7828	7833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007111	TA	3	6	8008	8013	50 %	50 %	0 %	0 %	67459871
27	NC_007111	TA	3	6	8046	8051	50 %	50 %	0 %	0 %	67459871
28	NC_007111	AT	3	6	8679	8684	50 %	50 %	0 %	0 %	67459872
29	NC_007111	CT	3	6	8707	8712	0 %	50 %	0 %	50 %	67459872
30	NC_007111	TA	3	6	8952	8957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007111	CT	3	6	9628	9633	0 %	50 %	0 %	50 %	67459873
32	NC_007111	CT	3	6	9816	9821	0 %	50 %	0 %	50 %	67459873
33	NC_007111	TA	3	6	10080	10085	50 %	50 %	0 %	0 %	67459873
34	NC_007111	GT	4	8	11114	11121	0 %	50 %	50 %	0 %	67459873
35	NC_007111	TC	3	6	11155	11160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007111	TA	3	6	11242	11247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007111	TC	3	6	11649	11654	0 %	50 %	0 %	50 %	67459874
38	NC_007111	TC	3	6	11755	11760	0 %	50 %	0 %	50 %	67459874
39	NC_007111	TA	3	6	11831	11836	50 %	50 %	0 %	0 %	67459874
40	NC_007111	TA	3	6	11969	11974	50 %	50 %	0 %	0 %	67459874
41	NC_007111	TG	3	6	12879	12884	0 %	50 %	50 %	0 %	67459875
42	NC_007111	AT	4	8	13086	13093	50 %	50 %	0 %	0 %	67459876
43	NC_007111	AT	3	6	13218	13223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007111	TA	3	6	13412	13417	50 %	50 %	0 %	0 %	67459877
45	NC_007111	GA	4	8	14301	14308	50 %	0 %	50 %	0 %	67459877
46	NC_007111	AT	3	6	15065	15070	50 %	50 %	0 %	0 %	67459877
47	NC_007111	AG	3	6	15174	15179	50 %	0 %	50 %	0 %	67459877
48	NC_007111	AG	3	6	16044	16049	50 %	0 %	50 %	0 %	67459878
49	NC_007111	GA	3	6	16264	16269	50 %	0 %	50 %	0 %	67459878
50	NC_007111	AG	3	6	16279	16284	50 %	0 %	50 %	0 %	67459878
51	NC_007111	AG	3	6	16654	16659	50 %	0 %	50 %	0 %	67459878
52	NC_007111	TA	3	6	16971	16976	50 %	50 %	0 %	0 %	67459878
53	NC_007111	TA	3	6	18506	18511	50 %	50 %	0 %	0 %	67459880
54	NC_007111	TA	3	6	18792	18797	50 %	50 %	0 %	0 %	67459880
55	NC_007111	AT	3	6	19210	19215	50 %	50 %	0 %	0 %	67459881
56	NC_007111	AC	3	6	22757	22762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007111	CA	3	6	23113	23118	50 %	0 %	0 %	50 %	67459886
58	NC_007111	TC	3	6	23461	23466	0 %	50 %	0 %	50 %	67459886
59	NC_007111	TA	3	6	24675	24680	50 %	50 %	0 %	0 %	67459888
60	NC_007111	AC	3	6	24744	24749	50 %	0 %	0 %	50 %	67459888
61	NC_007111	GA	3	6	25018	25023	50 %	0 %	50 %	0 %	67459889
62	NC_007111	AT	3	6	25699	25704	50 %	50 %	0 %	0 %	67459890
63	NC_007111	TA	3	6	25946	25951	50 %	50 %	0 %	0 %	67459890
64	NC_007111	TA	3	6	25974	25979	50 %	50 %	0 %	0 %	67459890
65	NC_007111	AT	3	6	25980	25985	50 %	50 %	0 %	0 %	67459890
66	NC_007111	GT	3	6	26622	26627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007111	TA	3	6	27885	27890	50 %	50 %	0 %	0 %	67459893
68	NC_007111	AC	3	6	27906	27911	50 %	0 %	0 %	50 %	67459893
69	NC_007111	TA	4	8	28529	28536	50 %	50 %	0 %	0 %	67459894
70	NC_007111	AC	3	6	28885	28890	50 %	0 %	0 %	50 %	67459894
71	NC_007111	TA	4	8	29994	30001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007111	AC	3	6	30148	30153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007111	TC	4	8	30826	30833	0 %	50 %	0 %	50 %	67459895
74	NC_007111	TC	3	6	31099	31104	0 %	50 %	0 %	50 %	67459896
75	NC_007111	AT	3	6	31233	31238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007111	TA	3	6	31626	31631	50 %	50 %	0 %	0 %	67459897
77	NC_007111	AT	3	6	31857	31862	50 %	50 %	0 %	0 %	67459897
78	NC_007111	AT	3	6	32412	32417	50 %	50 %	0 %	0 %	67459899
79	NC_007111	AT	3	6	32916	32921	50 %	50 %	0 %	0 %	67459899
80	NC_007111	CT	3	6	33356	33361	0 %	50 %	0 %	50 %	67459900
81	NC_007111	AT	3	6	33465	33470	50 %	50 %	0 %	0 %	67459900
82	NC_007111	AT	3	6	34783	34788	50 %	50 %	0 %	0 %	67459901
83	NC_007111	AT	3	6	35720	35725	50 %	50 %	0 %	0 %	67459903
84	NC_007111	AT	3	6	35825	35830	50 %	50 %	0 %	0 %	67459903
85	NC_007111	AT	3	6	36352	36357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007111	TA	3	6	36694	36699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007111	AT	3	6	37245	37250	50 %	50 %	0 %	0 %	67459904
88	NC_007111	CT	3	6	37921	37926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007111	CT	3	6	38163	38168	0 %	50 %	0 %	50 %	67459906
90	NC_007111	TG	3	6	38515	38520	0 %	50 %	50 %	0 %	67459906

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.