MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007111	T	6	6	1153	1158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007111	A	7	7	1201	1207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007111	T	6	6	1467	1472	0 %	100 %	0 %	0 %	67459864
4	NC_007111	A	7	7	1537	1543	100 %	0 %	0 %	0 %	67459864
5	NC_007111	T	6	6	1554	1559	0 %	100 %	0 %	0 %	67459864
6	NC_007111	A	7	7	1939	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
7	NC_007111	A	7	7	2217	2223	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
8	NC_007111	T	6	6	2398	2403	0 %	100 %	0 %	0 %	67459865
9	NC_007111	A	6	6	2409	2414	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
10	NC_007111	A	7	7	2426	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
11	NC_007111	A	6	6	2505	2510	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
12	NC_007111	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	67459866
13	NC_007111	A	7	7	2902	2908	100 %	0 %	0 %	0 %	67459866
14	NC_007111	T	6	6	2991	2996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007111	A	6	6	3007	3012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007111	T	6	6	3060	3065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007111	A	6	6	3104	3109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007111	T	7	7	3385	3391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007111	A	6	6	3394	3399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007111	A	6	6	5395	5400	100 %	0 %	0 %	0 %	67459867
21	NC_007111	A	6	6	6392	6397	100 %	0 %	0 %	0 %	67459868
22	NC_007111	A	7	7	6813	6819	100 %	0 %	0 %	0 %	67459869
23	NC_007111	T	6	6	7883	7888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007111	T	6	6	8242	8247	0 %	100 %	0 %	0 %	67459871
25	NC_007111	T	6	6	8695	8700	0 %	100 %	0 %	0 %	67459872
26	NC_007111	T	6	6	9177	9182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007111	T	8	8	9357	9364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007111	C	6	6	9973	9978	0 %	0 %	0 %	100 %	67459873
29	NC_007111	T	6	6	12166	12171	0 %	100 %	0 %	0 %	67459874
30	NC_007111	T	6	6	12702	12707	0 %	100 %	0 %	0 %	67459875
31	NC_007111	A	6	6	13546	13551	100 %	0 %	0 %	0 %	67459877
32	NC_007111	T	6	6	13582	13587	0 %	100 %	0 %	0 %	67459877
33	NC_007111	A	6	6	13744	13749	100 %	0 %	0 %	0 %	67459877
34	NC_007111	A	6	6	18063	18068	100 %	0 %	0 %	0 %	67459879
35	NC_007111	A	7	7	18860	18866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007111	A	7	7	20178	20184	100 %	0 %	0 %	0 %	67459882
37	NC_007111	T	6	6	20463	20468	0 %	100 %	0 %	0 %	67459882
38	NC_007111	T	7	7	20832	20838	0 %	100 %	0 %	0 %	67459883
39	NC_007111	T	6	6	21195	21200	0 %	100 %	0 %	0 %	67459884
40	NC_007111	T	6	6	21228	21233	0 %	100 %	0 %	0 %	67459884
41	NC_007111	T	6	6	21613	21618	0 %	100 %	0 %	0 %	67459884
42	NC_007111	T	7	7	21641	21647	0 %	100 %	0 %	0 %	67459884
43	NC_007111	T	7	7	22908	22914	0 %	100 %	0 %	0 %	67459886
44	NC_007111	T	6	6	23900	23905	0 %	100 %	0 %	0 %	67459887
45	NC_007111	T	7	7	23931	23937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007111	T	6	6	24009	24014	0 %	100 %	0 %	0 %	67459888
47	NC_007111	C	6	6	24066	24071	0 %	0 %	0 %	100 %	67459888
48	NC_007111	T	6	6	24864	24869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007111	T	6	6	24929	24934	0 %	100 %	0 %	0 %	67459889
50	NC_007111	T	6	6	25064	25069	0 %	100 %	0 %	0 %	67459889
51	NC_007111	A	7	7	26543	26549	100 %	0 %	0 %	0 %	67459891
52	NC_007111	A	6	6	26669	26674	100 %	0 %	0 %	0 %	67459892
53	NC_007111	T	6	6	26716	26721	0 %	100 %	0 %	0 %	67459892
54	NC_007111	T	6	6	26789	26794	0 %	100 %	0 %	0 %	67459892
55	NC_007111	A	6	6	27343	27348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007111	T	6	6	28161	28166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007111	C	6	6	28341	28346	0 %	0 %	0 %	100 %	67459894
58	NC_007111	T	6	6	29190	29195	0 %	100 %	0 %	0 %	67459894
59	NC_007111	A	6	6	29219	29224	100 %	0 %	0 %	0 %	67459894
60	NC_007111	A	6	6	29386	29391	100 %	0 %	0 %	0 %	67459894
61	NC_007111	T	7	7	29496	29502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007111	A	7	7	29839	29845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007111	A	6	6	29881	29886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007111	T	7	7	29891	29897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007111	T	6	6	30310	30315	0 %	100 %	0 %	0 %	67459895
66	NC_007111	T	6	6	30615	30620	0 %	100 %	0 %	0 %	67459895
67	NC_007111	T	7	7	30633	30639	0 %	100 %	0 %	0 %	67459895
68	NC_007111	T	6	6	30815	30820	0 %	100 %	0 %	0 %	67459895
69	NC_007111	T	6	6	31110	31115	0 %	100 %	0 %	0 %	67459896
70	NC_007111	T	6	6	31455	31460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007111	T	6	6	31595	31600	0 %	100 %	0 %	0 %	67459897
72	NC_007111	T	6	6	31779	31784	0 %	100 %	0 %	0 %	67459897
73	NC_007111	T	6	6	31869	31874	0 %	100 %	0 %	0 %	67459897
74	NC_007111	T	6	6	32122	32127	0 %	100 %	0 %	0 %	67459898
75	NC_007111	A	6	6	32140	32145	100 %	0 %	0 %	0 %	67459898
76	NC_007111	T	6	6	34643	34648	0 %	100 %	0 %	0 %	67459901
77	NC_007111	A	6	6	35454	35459	100 %	0 %	0 %	0 %	67459902
78	NC_007111	A	8	8	35571	35578	100 %	0 %	0 %	0 %	67459903
79	NC_007111	T	6	6	35735	35740	0 %	100 %	0 %	0 %	67459903
80	NC_007111	A	6	6	36857	36862	100 %	0 %	0 %	0 %	67459904
81	NC_007111	T	6	6	37514	37519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007111	T	6	6	37746	37751	0 %	100 %	0 %	0 %	67459905
83	NC_007111	T	7	7	38041	38047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007111	A	6	6	38588	38593	100 %	0 %	0 %	0 %	67459906
85	NC_007111	T	6	6	39234	39239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.