MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRF

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007110	GATTAT	2	12	2224	2235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67459796
2	NC_007110	AAAATT	2	12	3125	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007110	TCTAAA	2	12	3703	3714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67459798
4	NC_007110	AAATTC	2	12	4179	4190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67459798
5	NC_007110	TTATTG	2	12	5947	5958	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	67459799
6	NC_007110	TTTAAG	2	12	6777	6788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67459800
7	NC_007110	GATAAT	2	12	11002	11013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67459804
8	NC_007110	TGTTGG	2	12	12332	12343	0 %	50 %	50 %	0 %	67459806
9	NC_007110	CATTCC	2	12	18526	18537	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	67459813
10	NC_007110	TATTTA	2	12	19444	19455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459814
11	NC_007110	ATCTAA	2	12	20328	20339	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67459816
12	NC_007110	TAAAGA	2	12	22644	22655	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67459818
13	NC_007110	ATCAAG	2	12	22994	23005	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67459818
14	NC_007110	GCAAAG	2	12	23613	23624	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	67459818
15	NC_007110	TGAACA	2	12	27466	27477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67459820
16	NC_007110	TTTTGA	2	12	28936	28947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	67459822
17	NC_007110	GCAAGG	2	12	29107	29118	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	67459822
18	NC_007110	ATAAAA	2	12	29533	29544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	67459822
19	NC_007110	TTCTTT	2	12	31692	31703	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007110	TTTCTA	2	12	35456	35467	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	67459829
21	NC_007110	TATAGC	2	12	37415	37426	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	67459832
22	NC_007110	TGCTCT	2	12	45400	45411	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	67459839
23	NC_007110	TGATAA	2	12	45929	45940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67459840
24	NC_007110	AGCAGT	2	12	54098	54109	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	67459850
25	NC_007110	AATGTA	2	12	56109	56120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67459854
26	NC_007110	TTTTAT	2	12	56438	56449	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	67459854
27	NC_007110	AACGTA	2	12	56541	56552	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67459854
28	NC_007110	TTCTGC	2	12	57558	57569	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	67459855
29	NC_007110	ACTGAA	2	12	58628	58639	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67459856
30	NC_007110	GTTATA	2	12	59126	59137	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67459858

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.