MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRF

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007110	ATTTA	2	10	3861	3870	40 %	60 %	0 %	0 %	67459798
2	NC_007110	AATGA	2	10	5422	5431	60 %	20 %	20 %	0 %	67459798
3	NC_007110	AAGAG	2	10	5556	5565	60 %	0 %	40 %	0 %	67459798
4	NC_007110	AAGCG	2	10	5959	5968	40 %	0 %	40 %	20 %	67459799
5	NC_007110	GAATT	2	10	6280	6289	40 %	40 %	20 %	0 %	67459799
6	NC_007110	ATAAA	2	10	6379	6388	80 %	20 %	0 %	0 %	67459799
7	NC_007110	TTGTT	2	10	8736	8745	0 %	80 %	20 %	0 %	67459803
8	NC_007110	TTTTG	2	10	11698	11707	0 %	80 %	20 %	0 %	67459805
9	NC_007110	CTTTG	2	10	13961	13970	0 %	60 %	20 %	20 %	67459808
10	NC_007110	CATAC	2	10	17342	17351	40 %	20 %	0 %	40 %	67459812
11	NC_007110	TTCTT	2	10	20205	20214	0 %	80 %	0 %	20 %	67459816
12	NC_007110	AGAGT	2	10	23194	23203	40 %	20 %	40 %	0 %	67459818
13	NC_007110	TAATA	2	10	28147	28156	60 %	40 %	0 %	0 %	67459820
14	NC_007110	ATCAT	2	10	29074	29083	40 %	40 %	0 %	20 %	67459822
15	NC_007110	GCCTT	2	10	33785	33794	0 %	40 %	20 %	40 %	67459827
16	NC_007110	ATTCA	2	10	33868	33877	40 %	40 %	0 %	20 %	67459827
17	NC_007110	CATAT	2	10	34213	34222	40 %	40 %	0 %	20 %	67459827
18	NC_007110	AATTA	2	10	35648	35657	60 %	40 %	0 %	0 %	67459829
19	NC_007110	AGAGT	2	10	38568	38577	40 %	20 %	40 %	0 %	67459832
20	NC_007110	TTAAA	2	10	39136	39145	60 %	40 %	0 %	0 %	67459832
21	NC_007110	TCAGC	2	10	40269	40278	20 %	20 %	20 %	40 %	67459833
22	NC_007110	TTCTC	2	10	40899	40908	0 %	60 %	0 %	40 %	67459834
23	NC_007110	TAGCT	2	10	41531	41540	20 %	40 %	20 %	20 %	67459834
24	NC_007110	TTTAT	2	10	44710	44719	20 %	80 %	0 %	0 %	67459839
25	NC_007110	ACCAT	2	10	48227	48236	40 %	20 %	0 %	40 %	67459843
26	NC_007110	GGGTA	2	10	48797	48806	20 %	20 %	60 %	0 %	67459844
27	NC_007110	ATCTT	2	10	53905	53914	20 %	60 %	0 %	20 %	67459850
28	NC_007110	TGTTT	2	10	55201	55210	0 %	80 %	20 %	0 %	67459852
29	NC_007110	ATTTA	2	10	55609	55618	40 %	60 %	0 %	0 %	67459853
30	NC_007110	AAGAA	2	10	60383	60392	80 %	0 %	20 %	0 %	67459859
31	NC_007110	ATTTT	2	10	61995	62004	20 %	80 %	0 %	0 %	67459861

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.