MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRF

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007110	CTAT	2	8	618	625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007110	GTAT	2	8	1707	1714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007110	TAAA	2	8	3015	3022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007110	AGAT	2	8	3199	3206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007110	ATAG	2	8	3297	3304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007110	TAAA	2	8	3336	3343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007110	CTTT	2	8	8321	8328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007110	AAGT	2	8	9170	9177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007110	TCTT	2	8	9245	9252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007110	TTAA	2	8	15654	15661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007110	ACTG	2	8	15662	15669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007110	ATTT	2	8	16935	16942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007110	TAAT	2	8	17273	17280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007110	ATCT	2	8	17312	17319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007110	TGAT	2	8	19013	19020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007110	ATAA	2	8	20987	20994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007110	AGCA	2	8	21618	21625	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007110	AGCA	2	8	22001	22008	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007110	AGGT	2	8	23731	23738	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007110	CAAG	2	8	29575	29582	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007110	AGTA	2	8	29668	29675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007110	ATTA	2	8	29724	29731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007110	AACC	2	8	29758	29765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007110	TAAT	2	8	29954	29961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007110	TAAT	2	8	30026	30033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007110	TAAG	2	8	30125	30132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007110	TACT	2	8	31713	31720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007110	AATT	2	8	33146	33153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007110	TTAT	2	8	33179	33186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007110	TAAT	2	8	35165	35172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007110	AATA	2	8	35321	35328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007110	ATAC	2	8	42410	42417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007110	TAAA	2	8	48977	48984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007110	CTAT	2	8	51622	51629	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007110	TTAA	2	8	51714	51721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007110	TACT	2	8	51734	51741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007110	CATT	2	8	55001	55008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007110	GATA	2	8	58077	58084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007110	ATTT	2	8	59594	59601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007110	ATAC	2	8	59896	59903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007110	CATT	2	8	61063	61070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007110	GTTA	2	8	61160	61167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007110	ATAC	2	8	61464	61471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007110	TAAA	2	8	61514	61521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007110	TTTA	2	8	61668	61675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007110	CTTT	2	8	61713	61720	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.