MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRF

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007110	GGT	2	6	16	21	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007110	TAA	2	6	37	42	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007110	TAC	2	6	98	103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007110	CCT	2	6	145	150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007110	GAG	3	9	333	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007110	CTC	2	6	381	386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007110	CTA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007110	CAG	2	6	469	474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007110	TAA	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007110	ATA	2	6	1227	1232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007110	TAT	2	6	1743	1748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007110	ATT	2	6	1782	1787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007110	AAT	2	6	1796	1801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007110	TAT	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007110	TGT	2	6	3053	3058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007110	GTT	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007110	TGG	2	6	6474	6479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007110	TAA	2	6	7764	7769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007110	TCT	2	6	7791	7796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007110	TAA	2	6	7812	7817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007110	TAC	2	6	9040	9045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007110	TAA	2	6	9106	9111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007110	GTT	2	6	9137	9142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007110	TTG	2	6	9150	9155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007110	TTC	2	6	9190	9195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007110	AAC	2	6	9280	9285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007110	TTG	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007110	CAT	2	6	9386	9391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007110	CAT	2	6	9399	9404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007110	ATT	2	6	9414	9419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007110	CTC	2	6	11142	11147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007110	ATT	2	6	11167	11172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007110	TTA	2	6	11190	11195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007110	AAC	2	6	11214	11219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007110	TAG	2	6	11257	11262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007110	AAC	2	6	11290	11295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007110	AAT	2	6	11298	11303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007110	TAT	2	6	11329	11334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007110	ATT	2	6	12957	12962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007110	GTT	2	6	14089	14094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007110	TTC	2	6	14125	14130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007110	ATT	2	6	14281	14286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007110	AAT	2	6	14852	14857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007110	GTT	2	6	16947	16952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007110	TAC	2	6	17041	17046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007110	TAA	2	6	17111	17116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007110	TAT	3	9	17132	17140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007110	TAA	2	6	17219	17224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007110	GGT	2	6	17226	17231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007110	ACT	2	6	17244	17249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007110	AAT	2	6	19083	19088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007110	GTT	2	6	19192	19197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007110	TAA	3	9	20732	20740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007110	ATT	2	6	20757	20762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007110	ATC	2	6	20787	20792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007110	TTC	2	6	20798	20803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007110	ATT	2	6	20814	20819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007110	GTA	2	6	20885	20890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007110	ATT	2	6	20910	20915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007110	AAC	2	6	20979	20984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007110	AGA	3	9	21563	21571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007110	AGT	2	6	21610	21615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007110	GAG	2	6	21641	21646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007110	GAA	2	6	21655	21660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007110	AGC	2	6	21681	21686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007110	AGC	2	6	21723	21728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007110	GAA	2	6	21732	21737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007110	GAG	2	6	21739	21744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007110	GGT	2	6	21921	21926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007110	AAT	2	6	21927	21932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007110	ATA	2	6	21942	21947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007110	AGA	2	6	21959	21964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007110	CAC	2	6	22108	22113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_007110	TAG	2	6	22127	22132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007110	AGA	2	6	22136	22141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007110	GAA	2	6	22176	22181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007110	TAA	2	6	22189	22194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007110	AGA	2	6	22214	22219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007110	CAA	2	6	23676	23681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007110	AGT	2	6	26317	26322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007110	CAA	2	6	26335	26340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007110	TCT	2	6	29566	29571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007110	TTA	2	6	29602	29607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007110	TTA	2	6	29676	29681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007110	GTA	2	6	29907	29912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007110	ATC	2	6	29969	29974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007110	AAT	2	6	30072	30077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007110	TAC	2	6	30081	30086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007110	ATT	2	6	30087	30092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007110	GCA	2	6	30112	30117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007110	ATA	2	6	30148	30153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007110	ATT	2	6	30193	30198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007110	AGC	2	6	30204	30209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007110	GGA	2	6	30211	30216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007110	TGC	2	6	30324	30329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007110	AAT	2	6	30358	30363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007110	ATT	2	6	30381	30386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007110	TTA	2	6	30400	30405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007110	AGT	2	6	31652	31657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007110	TAC	3	9	31661	31669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007110	CTT	2	6	31726	31731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007110	TTC	2	6	31765	31770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007110	AGA	2	6	31996	32001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007110	ATT	2	6	32493	32498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007110	TGC	2	6	32559	32564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007110	AGA	2	6	32583	32588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007110	AGC	2	6	32591	32596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007110	CAA	2	6	32618	32623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007110	TAA	2	6	33082	33087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007110	ATT	2	6	33090	33095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007110	TTG	2	6	33155	33160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007110	TAA	2	6	33211	33216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007110	AAG	2	6	35280	35285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007110	ATG	2	6	35329	35334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007110	TAT	2	6	35360	35365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007110	ATG	2	6	36267	36272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007110	AGC	2	6	36298	36303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007110	AGC	2	6	36337	36342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007110	AGC	2	6	36403	36408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007110	ACT	2	6	45555	45560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007110	TAA	2	6	45564	45569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007110	ATA	2	6	46166	46171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007110	TTA	2	6	46192	46197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007110	TAG	3	9	46203	46211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007110	ATA	2	6	46280	46285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007110	AAT	2	6	46337	46342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007110	TTA	2	6	47528	47533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007110	AGT	2	6	48338	48343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007110	AAT	2	6	48397	48402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007110	ATA	2	6	48408	48413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007110	AGT	2	6	49597	49602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007110	ACA	2	6	49624	49629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007110	AAT	2	6	51495	51500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007110	CAA	2	6	51639	51644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007110	TCT	2	6	51645	51650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007110	AGT	2	6	51683	51688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007110	CTT	2	6	51747	51752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007110	ATG	2	6	51760	51765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007110	TTA	2	6	51801	51806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007110	CTC	2	6	51821	51826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_007110	TAA	2	6	53024	53029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007110	TTC	2	6	53051	53056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.