MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRF

Total Repeats: 798

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007110	ATC	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459794
2	NC_007110	ATT	2	6	1349	1354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459795
3	NC_007110	AGT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459795
4	NC_007110	TAA	2	6	1425	1430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459795
5	NC_007110	ATA	2	6	1493	1498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459795
6	NC_007110	TTA	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459795
7	NC_007110	ATT	2	6	1616	1621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459795
8	NC_007110	ATT	2	6	1864	1869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459796
9	NC_007110	AAT	2	6	1872	1877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459796
10	NC_007110	GGT	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67459796
11	NC_007110	CTA	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459796
12	NC_007110	TAA	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459796
13	NC_007110	TAA	2	6	2067	2072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459796
14	NC_007110	AAT	2	6	2110	2115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459796
15	NC_007110	ATT	2	6	2122	2127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459796
16	NC_007110	TAG	2	6	2166	2171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459796
17	NC_007110	CCA	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67459796
18	NC_007110	AAT	2	6	2301	2306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459796
19	NC_007110	TTA	2	6	2353	2358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459796
20	NC_007110	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459796
21	NC_007110	TAT	2	6	2496	2501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459796
22	NC_007110	TAA	2	6	2535	2540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459796
23	NC_007110	TTA	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459796
24	NC_007110	TAG	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459797
25	NC_007110	AAT	2	6	2677	2682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459797
26	NC_007110	TTA	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459797
27	NC_007110	AAT	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459797
28	NC_007110	AAC	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459797
29	NC_007110	ATT	2	6	2798	2803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459797
30	NC_007110	TTA	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459797
31	NC_007110	TTC	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459797
32	NC_007110	ATT	2	6	3447	3452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
33	NC_007110	AGA	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459798
34	NC_007110	AAT	2	6	3790	3795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459798
35	NC_007110	TAC	3	9	3807	3815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459798
36	NC_007110	ACA	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459798
37	NC_007110	TTA	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
38	NC_007110	TAT	2	6	4070	4075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
39	NC_007110	GTA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459798
40	NC_007110	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
41	NC_007110	CAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459798
42	NC_007110	CAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459798
43	NC_007110	TTA	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
44	NC_007110	TTA	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
45	NC_007110	ATT	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
46	NC_007110	CAG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459798
47	NC_007110	ATG	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459798
48	NC_007110	GAA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459798
49	NC_007110	TTA	2	6	4462	4467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
50	NC_007110	ACA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459798
51	NC_007110	CCT	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459798
52	NC_007110	ATA	3	9	4622	4630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459798
53	NC_007110	TAA	2	6	4632	4637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459798
54	NC_007110	GAA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459798
55	NC_007110	TAC	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459798
56	NC_007110	AAT	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459798
57	NC_007110	TTA	2	6	4909	4914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
58	NC_007110	ACA	2	6	5029	5034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459798
59	NC_007110	GAA	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459798
60	NC_007110	AGG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459798
61	NC_007110	ATA	2	6	5222	5227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459798
62	NC_007110	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
63	NC_007110	CAA	2	6	5651	5656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459798
64	NC_007110	AAT	2	6	5680	5685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459798
65	NC_007110	ATT	2	6	5759	5764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459798
66	NC_007110	GAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459799
67	NC_007110	GTA	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459799
68	NC_007110	ATA	2	6	5929	5934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459799
69	NC_007110	TGA	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459799
70	NC_007110	GAA	2	6	6111	6116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459799
71	NC_007110	ATT	2	6	6126	6131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459799
72	NC_007110	CAA	2	6	6132	6137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459799
73	NC_007110	TGA	2	6	6182	6187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459799
74	NC_007110	CAA	2	6	6236	6241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459799
75	NC_007110	TCT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459799
76	NC_007110	TAG	2	6	6328	6333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459799
77	NC_007110	GAT	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459799
78	NC_007110	ATT	2	6	6439	6444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459799
79	NC_007110	ATT	2	6	6455	6460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459799
80	NC_007110	GAT	2	6	6547	6552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459800
81	NC_007110	GGA	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459800
82	NC_007110	TTA	2	6	6746	6751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459800
83	NC_007110	TTA	2	6	6956	6961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459800
84	NC_007110	GTA	2	6	7006	7011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459800
85	NC_007110	ATA	2	6	7124	7129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459800
86	NC_007110	ATT	2	6	7272	7277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459800
87	NC_007110	AGC	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459800
88	NC_007110	CTA	2	6	7384	7389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459800
89	NC_007110	ATC	2	6	7396	7401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459800
90	NC_007110	CTT	2	6	7416	7421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459800
91	NC_007110	TTA	2	6	7479	7484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459800
92	NC_007110	ACA	2	6	7550	7555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459801
93	NC_007110	AGT	2	6	7564	7569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459801
94	NC_007110	CCT	2	6	7614	7619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459801
95	NC_007110	TAT	2	6	7636	7641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459801
96	NC_007110	AAT	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459802
97	NC_007110	AAT	2	6	7957	7962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459802
98	NC_007110	TAA	2	6	8077	8082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459802
99	NC_007110	TCC	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459802
100	NC_007110	GAT	2	6	8144	8149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459802
101	NC_007110	TTC	2	6	8191	8196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459802
102	NC_007110	ATC	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459802
103	NC_007110	TGA	3	9	8254	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459802
104	NC_007110	ATT	2	6	8415	8420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459803
105	NC_007110	TTG	2	6	8453	8458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459803
106	NC_007110	ATA	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459803
107	NC_007110	TAC	2	6	8504	8509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459803
108	NC_007110	ATG	2	6	8516	8521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459803
109	NC_007110	CCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459803
110	NC_007110	CAT	2	6	8600	8605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459803
111	NC_007110	ATT	2	6	8659	8664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459803
112	NC_007110	CTA	2	6	8669	8674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459803
113	NC_007110	TGA	2	6	8817	8822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459803
114	NC_007110	CTT	2	6	8885	8890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459803
115	NC_007110	ATA	3	9	8902	8910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459803
116	NC_007110	TTC	2	6	9521	9526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459804
117	NC_007110	TCA	2	6	9553	9558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
118	NC_007110	CTT	2	6	9581	9586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459804
119	NC_007110	ATG	2	6	9779	9784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459804
120	NC_007110	ATA	2	6	9835	9840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459804
121	NC_007110	CAT	2	6	9854	9859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
122	NC_007110	TTA	2	6	9871	9876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459804
123	NC_007110	TCA	2	6	9925	9930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
124	NC_007110	CTA	2	6	9931	9936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
125	NC_007110	TGC	2	6	9987	9992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459804
126	NC_007110	CTC	2	6	10074	10079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459804
127	NC_007110	CTA	2	6	10100	10105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
128	NC_007110	CTA	2	6	10126	10131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
129	NC_007110	ACT	2	6	10140	10145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
130	NC_007110	CTG	2	6	10214	10219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459804
131	NC_007110	GAC	2	6	10247	10252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459804
132	NC_007110	GCT	2	6	10314	10319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459804
133	NC_007110	ATA	2	6	10349	10354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459804
134	NC_007110	ATC	2	6	10362	10367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
135	NC_007110	CTA	2	6	10390	10395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
136	NC_007110	TGC	2	6	10539	10544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459804
137	NC_007110	ATT	2	6	10651	10656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459804
138	NC_007110	TGT	2	6	10665	10670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459804
139	NC_007110	ATC	2	6	10671	10676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459804
140	NC_007110	TGC	2	6	10696	10701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459804
141	NC_007110	ATG	2	6	10770	10775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459804
142	NC_007110	TGC	2	6	10791	10796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459804
143	NC_007110	ATA	2	6	10909	10914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459804
144	NC_007110	AAT	2	6	10918	10923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459804
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146	NC_007110	TAT	2	6	11057	11062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459804
147	NC_007110	TGT	2	6	11127	11132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459804
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149	NC_007110	TCA	2	6	11512	11517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459805
150	NC_007110	AAT	2	6	11571	11576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459805
151	NC_007110	TAT	2	6	11579	11584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459805
152	NC_007110	ATA	2	6	11591	11596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459805
153	NC_007110	ATG	2	6	11621	11626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459805
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155	NC_007110	TAT	2	6	11730	11735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459805
156	NC_007110	TTC	2	6	11742	11747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459805
157	NC_007110	TGC	2	6	11788	11793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67459805
158	NC_007110	TTG	2	6	11889	11894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459805
159	NC_007110	CAA	2	6	11903	11908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459805
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163	NC_007110	ATA	2	6	12308	12313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459806
164	NC_007110	TCT	2	6	12421	12426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459806
165	NC_007110	TAA	2	6	12429	12434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459806
166	NC_007110	TAT	2	6	12457	12462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459806
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168	NC_007110	TAC	2	6	12487	12492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459806
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228	NC_007110	AGT	2	6	17401	17406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459812
229	NC_007110	TTG	2	6	17434	17439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459812
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259	NC_007110	TAT	2	6	19361	19366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459814
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