MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRF

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007110	T	6	6	1153	1158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007110	A	7	7	1201	1207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007110	T	6	6	1467	1472	0 %	100 %	0 %	0 %	67459795
4	NC_007110	A	7	7	1537	1543	100 %	0 %	0 %	0 %	67459795
5	NC_007110	T	6	6	1554	1559	0 %	100 %	0 %	0 %	67459795
6	NC_007110	A	7	7	1939	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	67459796
7	NC_007110	A	7	7	2217	2223	100 %	0 %	0 %	0 %	67459796
8	NC_007110	T	6	6	2398	2403	0 %	100 %	0 %	0 %	67459796
9	NC_007110	A	6	6	2409	2414	100 %	0 %	0 %	0 %	67459796
10	NC_007110	A	7	7	2426	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	67459796
11	NC_007110	A	6	6	2505	2510	100 %	0 %	0 %	0 %	67459796
12	NC_007110	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	67459797
13	NC_007110	A	7	7	2902	2908	100 %	0 %	0 %	0 %	67459797
14	NC_007110	T	6	6	2991	2996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007110	A	6	6	3007	3012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007110	T	6	6	3060	3065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007110	A	6	6	3104	3109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007110	T	7	7	3385	3391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007110	A	6	6	3394	3399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007110	A	6	6	5395	5400	100 %	0 %	0 %	0 %	67459798
21	NC_007110	A	6	6	6392	6397	100 %	0 %	0 %	0 %	67459799
22	NC_007110	A	7	7	6813	6819	100 %	0 %	0 %	0 %	67459800
23	NC_007110	T	6	6	7883	7888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007110	T	6	6	8242	8247	0 %	100 %	0 %	0 %	67459802
25	NC_007110	T	6	6	8695	8700	0 %	100 %	0 %	0 %	67459803
26	NC_007110	T	6	6	9177	9182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007110	T	8	8	9357	9364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007110	C	6	6	9973	9978	0 %	0 %	0 %	100 %	67459804
29	NC_007110	T	6	6	12166	12171	0 %	100 %	0 %	0 %	67459805
30	NC_007110	T	6	6	12702	12707	0 %	100 %	0 %	0 %	67459806
31	NC_007110	A	6	6	13209	13214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007110	T	6	6	14465	14470	0 %	100 %	0 %	0 %	67459809
33	NC_007110	T	6	6	14677	14682	0 %	100 %	0 %	0 %	67459809
34	NC_007110	T	6	6	14771	14776	0 %	100 %	0 %	0 %	67459809
35	NC_007110	A	7	7	15054	15060	100 %	0 %	0 %	0 %	67459810
36	NC_007110	T	7	7	15620	15626	0 %	100 %	0 %	0 %	67459810
37	NC_007110	A	6	6	16594	16599	100 %	0 %	0 %	0 %	67459811
38	NC_007110	T	6	6	16784	16789	0 %	100 %	0 %	0 %	67459811
39	NC_007110	T	6	6	17001	17006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007110	T	6	6	17120	17125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007110	T	6	6	17294	17299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007110	T	8	8	18417	18424	0 %	100 %	0 %	0 %	67459812
43	NC_007110	A	6	6	19307	19312	100 %	0 %	0 %	0 %	67459814
44	NC_007110	A	6	6	19352	19357	100 %	0 %	0 %	0 %	67459814
45	NC_007110	A	6	6	19611	19616	100 %	0 %	0 %	0 %	67459814
46	NC_007110	T	7	7	20023	20029	0 %	100 %	0 %	0 %	67459815
47	NC_007110	A	6	6	20199	20204	100 %	0 %	0 %	0 %	67459816
48	NC_007110	A	6	6	20749	20754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007110	A	6	6	20806	20811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007110	A	6	6	20925	20930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007110	A	6	6	21479	21484	100 %	0 %	0 %	0 %	67459817
52	NC_007110	A	6	6	22666	22671	100 %	0 %	0 %	0 %	67459818
53	NC_007110	A	6	6	23683	23688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55	NC_007110	G	6	6	25994	25999	0 %	0 %	100 %	0 %	67459819
56	NC_007110	A	6	6	26190	26195	100 %	0 %	0 %	0 %	67459819
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69	NC_007110	T	6	6	29492	29497	0 %	100 %	0 %	0 %	67459822
70	NC_007110	A	6	6	29541	29546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007110	A	7	7	29613	29619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007110	T	7	7	29747	29753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007110	A	7	7	29841	29847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007110	A	7	7	29851	29857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007110	A	6	6	29990	29995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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86	NC_007110	A	6	6	35295	35300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_007110	T	7	7	47497	47503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_007110	T	6	6	48630	48635	0 %	100 %	0 %	0 %	67459844
112	NC_007110	A	7	7	50109	50115	100 %	0 %	0 %	0 %	67459846
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114	NC_007110	T	6	6	50282	50287	0 %	100 %	0 %	0 %	67459847
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116	NC_007110	A	6	6	50909	50914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007110	T	6	6	51727	51732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_007110	A	6	6	53447	53452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007110	T	7	7	53457	53463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007110	T	6	6	53876	53881	0 %	100 %	0 %	0 %	67459850
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143	NC_007110	T	6	6	61312	61317	0 %	100 %	0 %	0 %	67459860
144	NC_007110	T	7	7	61607	61613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007110	A	6	6	62154	62159	100 %	0 %	0 %	0 %	67459861
146	NC_007110	T	6	6	62800	62805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.