MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome

Total Repeats: 559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007109	AAAGTA	2	12	1205	1216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67458394
2	NC_007109	TTTCTC	2	12	1493	1504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458395
3	NC_007109	CTAATA	2	12	4799	4810	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67458397
4	NC_007109	CAAAAT	2	12	6163	6174	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	67458397
5	NC_007109	AACCGT	2	12	7286	7297	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	67458399
6	NC_007109	AAACCC	2	12	8341	8352	50 %	0 %	0 %	50 %	67458400
7	NC_007109	TAAAGA	2	12	11008	11019	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67458402
8	NC_007109	AGAAAA	2	12	14536	14547	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	67458405
9	NC_007109	ATTAAA	2	12	16048	16059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458409
10	NC_007109	ATCAAG	2	12	16799	16810	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67458410
11	NC_007109	CTAATT	2	12	17754	17765	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67458411
12	NC_007109	ACCGGA	2	12	21030	21041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458414
13	NC_007109	CAAAAT	2	12	21238	21249	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	67458414
14	NC_007109	AATAAA	2	12	21813	21824	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	67458414
15	NC_007109	GCAGAA	2	12	23026	23037	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	67458414
16	NC_007109	CAGATG	2	12	23093	23104	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	67458414
17	NC_007109	AGAAAG	2	12	23501	23512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458414
18	NC_007109	AGAAGT	2	12	24435	24446	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	67458414
19	NC_007109	GCATTA	2	12	24763	24774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	67458414
20	NC_007109	ATTTAA	2	12	25221	25232	50 %	50 %	0 %	0 %	67458414
21	NC_007109	AATTAT	2	12	25444	25455	50 %	50 %	0 %	0 %	67458414
22	NC_007109	TTAGAA	2	12	33152	33163	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67458423
23	NC_007109	CATATA	2	12	35603	35614	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67458426
24	NC_007109	AATACA	2	12	39264	39275	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	67458430
25	NC_007109	TTTTTG	2	12	39841	39852	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	67458431
26	NC_007109	AGAGTT	2	12	44170	44181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458433
27	NC_007109	CAAGCT	2	12	49317	49328	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	67458439
28	NC_007109	AAATGA	2	12	49433	49444	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67458439
29	NC_007109	TTAAAG	2	12	50856	50867	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67458440
30	NC_007109	TTTTTA	2	12	56623	56634	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	67458446
31	NC_007109	ACGGAT	2	12	57856	57867	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	67458448
32	NC_007109	TCAAGC	2	12	60352	60363	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	67458451
33	NC_007109	CCTATA	2	12	61610	61621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458452
34	NC_007109	ACCGCT	2	12	63192	63203	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	67458453
35	NC_007109	TGACTT	2	12	71239	71250	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	67458459
36	NC_007109	TTCTTT	2	12	72570	72581	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	67458459
37	NC_007109	GTGATG	2	12	77309	77320	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	67458463
38	NC_007109	TAGCGG	2	12	78659	78670	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	67458464
39	NC_007109	CTTTTT	2	12	79018	79029	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	67458464
40	NC_007109	TTTATT	2	12	83720	83731	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	67458469
41	NC_007109	TAAAAT	2	12	87680	87691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458473
42	NC_007109	ATAGTT	2	12	90332	90343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67458477
43	NC_007109	TTGCTA	2	12	94975	94986	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	67458481
44	NC_007109	AAGATA	2	12	95140	95151	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67458481
45	NC_007109	CTTTAG	2	12	95302	95313	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	67458481
46	NC_007109	TTTAGT	2	12	95961	95972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	67458481
47	NC_007109	GCGGAG	2	12	96916	96927	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	67458481
48	NC_007109	AAGAGA	2	12	97523	97534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458481
49	NC_007109	TAATGC	2	12	100149	100160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	67458483
50	NC_007109	GATTCC	2	12	100395	100406	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	67458483
51	NC_007109	TAAAGA	2	12	101229	101240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67458483
52	NC_007109	TAAAGT	2	12	112401	112412	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67458489
53	NC_007109	CCTTTA	2	12	119272	119283	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	67458499
54	NC_007109	TGCTTC	2	12	121527	121538	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	67458500
55	NC_007109	AAATCA	2	12	122579	122590	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	67458501
56	NC_007109	CGATCA	2	12	124927	124938	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	67458502
57	NC_007109	ATGCCC	2	12	126328	126339	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	67458504
58	NC_007109	ATTTTG	2	12	126688	126699	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	67458504
59	NC_007109	GCTTCA	2	12	137801	137812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	67458512
60	NC_007109	TAGCTT	2	12	140193	140204	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	67458514
61	NC_007109	TCAGGA	2	12	140612	140623	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	67458514
62	NC_007109	GCTTAC	2	12	141565	141576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	67458515
63	NC_007109	GCCTAA	2	12	142004	142015	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	67458515
64	NC_007109	CTTCAT	2	12	143813	143824	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	67458517
65	NC_007109	CTTTTT	2	12	144024	144035	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	67458518
66	NC_007109	GATACA	2	12	146207	146218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67458520
67	NC_007109	CTTTTT	2	12	147884	147895	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	67458523
68	NC_007109	TCACTA	2	12	148711	148722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458523
69	NC_007109	TGCTGT	2	12	149044	149055	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	67458523
70	NC_007109	ATATTA	2	12	149678	149689	50 %	50 %	0 %	0 %	67458524
71	NC_007109	ACAAAA	2	12	157059	157070	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	67458531
72	NC_007109	TTCTGA	2	12	158967	158978	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	67458533
73	NC_007109	CTATTA	2	12	162124	162135	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67458537
74	NC_007109	CCTTAT	2	12	162906	162917	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	67458538
75	NC_007109	ATAAAT	2	12	163105	163116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458538
76	NC_007109	ATTTCA	2	12	164633	164644	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67458540
77	NC_007109	TAAGAA	2	12	166045	166056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67458542
78	NC_007109	TGATAA	2	12	172279	172290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67458546
79	NC_007109	TAAAAA	2	12	173663	173674	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	67458548
80	NC_007109	AGCTAA	2	12	180435	180446	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67458555
81	NC_007109	TATTTT	2	12	191801	191812	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	67458565
82	NC_007109	TACCTG	2	12	195581	195592	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	67458566
83	NC_007109	CAAAAT	2	12	197756	197767	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	67458569
84	NC_007109	TATTTT	2	12	199602	199613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	67458571
85	NC_007109	TCCAAA	2	12	200036	200047	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	67458571
86	NC_007109	CTAAAC	2	12	200080	200091	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	67458571
87	NC_007109	TCCTGG	2	12	200156	200167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458572
88	NC_007109	TCAAAT	2	12	201500	201511	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67458575
89	NC_007109	TTTGTT	2	12	204777	204788	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	67458579
90	NC_007109	GATTTT	2	12	207988	207999	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	67458583
91	NC_007109	GATAGA	2	12	210486	210497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	67458585
92	NC_007109	GGTCTT	2	12	211345	211356	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	67458586
93	NC_007109	GTTAAT	2	12	211905	211916	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67458586
94	NC_007109	GCATTT	2	12	212930	212941	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	67458587
95	NC_007109	TGGTTT	2	12	214950	214961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67458589
96	NC_007109	AATTTG	2	12	215301	215312	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67458590
97	NC_007109	GCTAAT	2	12	220195	220206	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	67458597
98	NC_007109	TTGATT	2	12	221741	221752	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	67458597
99	NC_007109	GGTCTT	2	12	222778	222789	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	67458597
100	NC_007109	CTCAGT	2	12	224744	224755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	67458597
101	NC_007109	TAAATT	2	12	226847	226858	50 %	50 %	0 %	0 %	67458598
102	NC_007109	ATTAAA	2	12	232419	232430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458601
103	NC_007109	ATCATA	2	12	234605	234616	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67458603
104	NC_007109	TTGAAT	2	12	243503	243514	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67458612
105	NC_007109	ACAATG	2	12	246507	246518	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67458614
106	NC_007109	CTGCAG	2	12	246693	246704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	67458614
107	NC_007109	AGAATT	2	12	247039	247050	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67458614
108	NC_007109	TCATAA	2	12	252797	252808	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67458619
109	NC_007109	AAAAAT	2	12	253706	253717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	67458620
110	NC_007109	TTTATC	2	12	254721	254732	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	67458621
111	NC_007109	TTTAGA	2	12	254922	254933	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67458621
112	NC_007109	CAAAAA	2	12	265082	265093	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	67458629
113	NC_007109	CCGACT	2	12	269776	269787	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	67458634
114	NC_007109	TAGCGG	2	12	270510	270521	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	67458635
115	NC_007109	CTTTAA	2	12	270575	270586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67458635
116	NC_007109	GATTTA	2	12	272169	272180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67458636
117	NC_007109	AAAATT	2	12	274933	274944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458638
118	NC_007109	TAAAGA	2	12	275128	275139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67458638
119	NC_007109	ATCAAA	2	12	277582	277593	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	67458640
120	NC_007109	AAAAGC	2	12	279824	279835	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	67458643
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354	NC_007109	CGGTAG	2	12	919986	919997	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	67459257
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468	NC_007109	TTTTAT	2	12	1228005	1228016	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	162022120
469	NC_007109	TGCTCC	2	12	1229423	1229434	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	162022120
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471	NC_007109	GCTCTA	2	12	1234285	1234296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	67459551
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