MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome

Total Repeats: 1334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007109	TAACG	2	10	1066	1075	40 %	20 %	20 %	20 %	67458394
2	NC_007109	TTAAT	2	10	1952	1961	40 %	60 %	0 %	0 %	67458395
3	NC_007109	TTTTA	2	10	2641	2650	20 %	80 %	0 %	0 %	67458396
4	NC_007109	ATTTA	2	10	2994	3003	40 %	60 %	0 %	0 %	67458396
5	NC_007109	GGTCA	2	10	4382	4391	20 %	20 %	40 %	20 %	67458397
6	NC_007109	TAAAT	2	10	5091	5100	60 %	40 %	0 %	0 %	67458397
7	NC_007109	ATAAA	2	10	5552	5561	80 %	20 %	0 %	0 %	67458397
8	NC_007109	TATTT	2	10	7689	7698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007109	TCGCT	2	10	12947	12956	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007109	AGCAG	2	10	13878	13887	40 %	0 %	40 %	20 %	67458404
11	NC_007109	GCTTG	2	10	15057	15066	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007109	TAATA	2	10	15266	15275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007109	GTTTA	2	10	17545	17554	20 %	60 %	20 %	0 %	67458411
14	NC_007109	CGCTC	2	10	20104	20113	0 %	20 %	20 %	60 %	67458413
15	NC_007109	TTTAA	2	10	20768	20777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007109	AGAAC	2	10	26469	26478	60 %	0 %	20 %	20 %	67458415
17	NC_007109	TTACT	2	10	27400	27409	20 %	60 %	0 %	20 %	67458416
18	NC_007109	TAAAT	2	10	31070	31079	60 %	40 %	0 %	0 %	67458419
19	NC_007109	TTTGT	2	10	31526	31535	0 %	80 %	20 %	0 %	67458420
20	NC_007109	AATAA	2	10	32668	32677	80 %	20 %	0 %	0 %	67458422
21	NC_007109	CTCAT	2	10	33423	33432	20 %	40 %	0 %	40 %	67458424
22	NC_007109	TGCTA	2	10	34343	34352	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007109	TTGTT	2	10	35379	35388	0 %	80 %	20 %	0 %	67458426
24	NC_007109	TTTGC	2	10	37758	37767	0 %	60 %	20 %	20 %	67458427
25	NC_007109	GTTAA	2	10	38462	38471	40 %	40 %	20 %	0 %	67458428
26	NC_007109	TGAGT	2	10	38492	38501	20 %	40 %	40 %	0 %	67458428
27	NC_007109	TGTCT	2	10	38866	38875	0 %	60 %	20 %	20 %	67458429
28	NC_007109	CTTTT	2	10	43414	43423	0 %	80 %	0 %	20 %	67458433
29	NC_007109	TTATT	2	10	43845	43854	20 %	80 %	0 %	0 %	67458433
30	NC_007109	TTTTA	2	10	43954	43963	20 %	80 %	0 %	0 %	67458433
31	NC_007109	TTTAT	2	10	45139	45148	20 %	80 %	0 %	0 %	67458435
32	NC_007109	TCGCT	2	10	47228	47237	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007109	TAAGT	2	10	47401	47410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007109	TAAAG	2	10	48066	48075	60 %	20 %	20 %	0 %	67458438
35	NC_007109	AAAGT	2	10	48613	48622	60 %	20 %	20 %	0 %	67458438
36	NC_007109	ATCCA	2	10	53105	53114	40 %	20 %	0 %	40 %	67458444
37	NC_007109	ACAGT	2	10	53247	53256	40 %	20 %	20 %	20 %	67458444
38	NC_007109	TTGAT	2	10	55316	55325	20 %	60 %	20 %	0 %	67458445
39	NC_007109	TTTAA	2	10	56012	56021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007109	TTGTA	2	10	56094	56103	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007109	ATTTA	2	10	57196	57205	40 %	60 %	0 %	0 %	67458447
42	NC_007109	AATTA	2	10	57565	57574	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007109	TTAAT	2	10	59624	59633	40 %	60 %	0 %	0 %	67458450
44	NC_007109	AACCG	2	10	61041	61050	40 %	0 %	20 %	40 %	67458451
45	NC_007109	TTAGT	2	10	62536	62545	20 %	60 %	20 %	0 %	67458453
46	NC_007109	TAAAA	2	10	64686	64695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007109	TAATA	2	10	67883	67892	60 %	40 %	0 %	0 %	67458458
48	NC_007109	ATATT	2	10	68588	68597	40 %	60 %	0 %	0 %	67458459
49	NC_007109	ATTAT	2	10	68836	68845	40 %	60 %	0 %	0 %	67458459
50	NC_007109	AAAAC	2	10	76638	76647	80 %	0 %	0 %	20 %	67458462
51	NC_007109	ATAAA	2	10	79606	79615	80 %	20 %	0 %	0 %	67458464
52	NC_007109	TAAAA	2	10	81924	81933	80 %	20 %	0 %	0 %	67458467
53	NC_007109	AAAAC	2	10	82620	82629	80 %	0 %	0 %	20 %	67458467
54	NC_007109	TTTAA	2	10	82696	82705	40 %	60 %	0 %	0 %	67458467
55	NC_007109	TGAAA	2	10	84146	84155	60 %	20 %	20 %	0 %	67458469
56	NC_007109	CAAGA	2	10	84752	84761	60 %	0 %	20 %	20 %	67458470
57	NC_007109	AGGAC	2	10	86144	86153	40 %	0 %	40 %	20 %	67458471
58	NC_007109	CTTGT	2	10	87344	87353	0 %	60 %	20 %	20 %	67458472
59	NC_007109	ATGAT	2	10	88261	88270	40 %	40 %	20 %	0 %	67458473
60	NC_007109	GGCTT	2	10	88597	88606	0 %	40 %	40 %	20 %	67458474
61	NC_007109	AAATC	2	10	90072	90081	60 %	20 %	0 %	20 %	67458477
62	NC_007109	TTAAC	2	10	91209	91218	40 %	40 %	0 %	20 %	67458478
63	NC_007109	TATAA	2	10	91301	91310	60 %	40 %	0 %	0 %	67458478
64	NC_007109	TTATA	2	10	91675	91684	40 %	60 %	0 %	0 %	67458479
65	NC_007109	TTTTA	2	10	93276	93285	20 %	80 %	0 %	0 %	67458480
66	NC_007109	GCTTT	2	10	94909	94918	0 %	60 %	20 %	20 %	67458481
67	NC_007109	TATGT	2	10	95559	95568	20 %	60 %	20 %	0 %	67458481
68	NC_007109	AGAAA	2	10	97475	97484	80 %	0 %	20 %	0 %	67458481
69	NC_007109	AGAAA	2	10	97629	97638	80 %	0 %	20 %	0 %	67458481
70	NC_007109	GTTTT	2	10	98160	98169	0 %	80 %	20 %	0 %	67458482
71	NC_007109	CTTGG	2	10	98977	98986	0 %	40 %	40 %	20 %	67458482
72	NC_007109	ATTGC	2	10	102490	102499	20 %	40 %	20 %	20 %	67458483
73	NC_007109	ACAAG	2	10	102757	102766	60 %	0 %	20 %	20 %	67458483
74	NC_007109	AGTTT	2	10	103150	103159	20 %	60 %	20 %	0 %	67458484
75	NC_007109	TTAGT	2	10	103673	103682	20 %	60 %	20 %	0 %	67458484
76	NC_007109	ATATA	2	10	104576	104585	60 %	40 %	0 %	0 %	67458484
77	NC_007109	TATTT	2	10	107172	107181	20 %	80 %	0 %	0 %	67458485
78	NC_007109	CAAAG	2	10	107564	107573	60 %	0 %	20 %	20 %	67458485
79	NC_007109	TAATT	2	10	110110	110119	40 %	60 %	0 %	0 %	67458487
80	NC_007109	AAAGA	2	10	110636	110645	80 %	0 %	20 %	0 %	67458488
81	NC_007109	TCATT	2	10	111751	111760	20 %	60 %	0 %	20 %	67458489
82	NC_007109	AAATA	2	10	112533	112542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007109	AATTA	2	10	112991	113000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007109	ATCCG	2	10	117149	117158	20 %	20 %	20 %	40 %	67458496
85	NC_007109	CCCAT	2	10	119438	119447	20 %	20 %	0 %	60 %	67458499
86	NC_007109	TGCGG	2	10	122337	122346	0 %	20 %	60 %	20 %	67458501
87	NC_007109	CTTGA	2	10	128026	128035	20 %	40 %	20 %	20 %	67458504
88	NC_007109	CTTGA	2	10	128134	128143	20 %	40 %	20 %	20 %	67458504
89	NC_007109	TAATT	2	10	130500	130509	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007109	TAATT	2	10	133636	133645	40 %	60 %	0 %	0 %	67458508
91	NC_007109	TTTTA	2	10	134340	134349	20 %	80 %	0 %	0 %	67458508
92	NC_007109	CATTG	2	10	134804	134813	20 %	40 %	20 %	20 %	67458509
93	NC_007109	ATTTA	2	10	135432	135441	40 %	60 %	0 %	0 %	67458510
94	NC_007109	TCTAC	2	10	137156	137165	20 %	40 %	0 %	40 %	67458511
95	NC_007109	TATTG	2	10	138086	138095	20 %	60 %	20 %	0 %	67458512
96	NC_007109	TAAGC	2	10	138450	138459	40 %	20 %	20 %	20 %	67458513
97	NC_007109	AAATA	2	10	139618	139627	80 %	20 %	0 %	0 %	67458514
98	NC_007109	CAACC	2	10	139995	140004	40 %	0 %	0 %	60 %	67458514
99	NC_007109	TCTTT	2	10	140205	140214	0 %	80 %	0 %	20 %	67458514
100	NC_007109	TAAAT	2	10	140982	140991	60 %	40 %	0 %	0 %	67458514
101	NC_007109	TAAAA	2	10	141159	141168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007109	CAGAT	2	10	142099	142108	40 %	20 %	20 %	20 %	67458515
103	NC_007109	TATAT	2	10	142506	142515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007109	CCGCA	2	10	143058	143067	20 %	0 %	20 %	60 %	67458516
105	NC_007109	AAATC	2	10	143302	143311	60 %	20 %	0 %	20 %	67458516
106	NC_007109	TAAGG	2	10	144649	144658	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007109	CTAAT	2	10	144922	144931	40 %	40 %	0 %	20 %	67458519
108	NC_007109	AGCAG	2	10	146110	146119	40 %	0 %	40 %	20 %	67458520
109	NC_007109	TAATA	2	10	147485	147494	60 %	40 %	0 %	0 %	67458523
110	NC_007109	GATTG	2	10	148561	148570	20 %	40 %	40 %	0 %	67458523
111	NC_007109	ATTAA	2	10	149128	149137	60 %	40 %	0 %	0 %	67458523
112	NC_007109	TTTAA	2	10	149339	149348	40 %	60 %	0 %	0 %	67458524
113	NC_007109	TAAGC	2	10	150067	150076	40 %	20 %	20 %	20 %	67458524
114	NC_007109	TAAAG	2	10	150255	150264	60 %	20 %	20 %	0 %	67458524
115	NC_007109	TAACA	2	10	150412	150421	60 %	20 %	0 %	20 %	67458524
116	NC_007109	ATTTT	2	10	150531	150540	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007109	TTTGT	2	10	151045	151054	0 %	80 %	20 %	0 %	67458525
118	NC_007109	TTTTA	2	10	153177	153186	20 %	80 %	0 %	0 %	67458528
119	NC_007109	AGGTA	2	10	157456	157465	40 %	20 %	40 %	0 %	67458532
120	NC_007109	AAAGC	2	10	157883	157892	60 %	0 %	20 %	20 %	67458532
121	NC_007109	AATTT	2	10	159052	159061	40 %	60 %	0 %	0 %	67458533
122	NC_007109	AACCG	2	10	159141	159150	40 %	0 %	20 %	40 %	67458533
123	NC_007109	TATAA	2	10	161074	161083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007109	TCATA	2	10	166476	166485	40 %	40 %	0 %	20 %	67458542
125	NC_007109	ATCAA	2	10	166670	166679	60 %	20 %	0 %	20 %	67458542
126	NC_007109	TGCAG	2	10	166920	166929	20 %	20 %	40 %	20 %	67458542
127	NC_007109	TAATG	2	10	168673	168682	40 %	40 %	20 %	0 %	67458543
128	NC_007109	AGAAA	2	10	169706	169715	80 %	0 %	20 %	0 %	67458544
129	NC_007109	GCAGG	2	10	170365	170374	20 %	0 %	60 %	20 %	67458545
130	NC_007109	CTTTA	2	10	170883	170892	20 %	60 %	0 %	20 %	67458546
131	NC_007109	ATTTC	2	10	170901	170910	20 %	60 %	0 %	20 %	67458546
132	NC_007109	TCAGA	2	10	172884	172893	40 %	20 %	20 %	20 %	67458548
133	NC_007109	GAAAC	2	10	173442	173451	60 %	0 %	20 %	20 %	67458548
134	NC_007109	TGAAA	2	10	173960	173969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007109	CGGAG	2	10	174019	174028	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007109	AAATA	2	10	175994	176003	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007109	AGAAA	2	10	177502	177511	80 %	0 %	20 %	0 %	67458553
138	NC_007109	TTAAT	2	10	178731	178740	40 %	60 %	0 %	0 %	67458554
139	NC_007109	ATTTT	2	10	178931	178940	20 %	80 %	0 %	0 %	67458554
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270	NC_007109	ATTAC	2	10	320333	320342	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
271	NC_007109	TATGA	2	10	320436	320445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_007109	ATCCA	2	10	322755	322764	40 %	20 %	0 %	40 %	67458700
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