MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome

Total Repeats: 4333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007109	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007109	TTAT	2	8	2802	2809	25 %	75 %	0 %	0 %	67458396
3	NC_007109	TTAT	2	8	3024	3031	25 %	75 %	0 %	0 %	67458396
4	NC_007109	CAAA	2	8	3453	3460	75 %	0 %	0 %	25 %	67458397
5	NC_007109	GCGA	2	8	3572	3579	25 %	0 %	50 %	25 %	67458397
6	NC_007109	CCTC	2	8	3723	3730	0 %	25 %	0 %	75 %	67458397
7	NC_007109	TATT	2	8	3861	3868	25 %	75 %	0 %	0 %	67458397
8	NC_007109	AATA	2	8	5368	5375	75 %	25 %	0 %	0 %	67458397
9	NC_007109	ATTC	2	8	5593	5600	25 %	50 %	0 %	25 %	67458397
10	NC_007109	TTAA	2	8	5725	5732	50 %	50 %	0 %	0 %	67458397
11	NC_007109	GCGA	2	8	6251	6258	25 %	0 %	50 %	25 %	67458397
12	NC_007109	ATTC	2	8	6618	6625	25 %	50 %	0 %	25 %	67458398
13	NC_007109	ACCT	2	8	6783	6790	25 %	25 %	0 %	50 %	67458398
14	NC_007109	ATAA	2	8	6874	6881	75 %	25 %	0 %	0 %	67458398
15	NC_007109	ATTT	2	8	7665	7672	25 %	75 %	0 %	0 %	67458399
16	NC_007109	TTTA	2	8	7680	7687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007109	CAAT	2	8	10115	10122	50 %	25 %	0 %	25 %	67458401
18	NC_007109	GCGA	2	8	10631	10638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007109	ATTA	2	8	11331	11338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007109	ATTT	2	8	11957	11964	25 %	75 %	0 %	0 %	67458403
21	NC_007109	GATT	2	8	12400	12407	25 %	50 %	25 %	0 %	67458403
22	NC_007109	AAAT	2	8	12408	12415	75 %	25 %	0 %	0 %	67458403
23	NC_007109	AATT	2	8	12435	12442	50 %	50 %	0 %	0 %	67458403
24	NC_007109	AAAG	2	8	12693	12700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007109	TTGG	2	8	13970	13977	0 %	50 %	50 %	0 %	67458404
26	NC_007109	TAAA	2	8	14562	14569	75 %	25 %	0 %	0 %	67458405
27	NC_007109	TAAA	2	8	14716	14723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007109	TCAT	2	8	14837	14844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007109	CTTT	2	8	14971	14978	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007109	TAAA	2	8	15382	15389	75 %	25 %	0 %	0 %	67458407
31	NC_007109	GCAA	2	8	15470	15477	50 %	0 %	25 %	25 %	67458407
32	NC_007109	AATA	2	8	15547	15554	75 %	25 %	0 %	0 %	67458407
33	NC_007109	AGCA	2	8	15609	15616	50 %	0 %	25 %	25 %	67458408
34	NC_007109	GTAA	2	8	16015	16022	50 %	25 %	25 %	0 %	67458409
35	NC_007109	AATT	2	8	16994	17001	50 %	50 %	0 %	0 %	67458410
36	NC_007109	GCGA	2	8	17250	17257	25 %	0 %	50 %	25 %	67458410
37	NC_007109	AATA	2	8	17573	17580	75 %	25 %	0 %	0 %	67458411
38	NC_007109	GTAA	2	8	18015	18022	50 %	25 %	25 %	0 %	67458411
39	NC_007109	TCTA	2	8	18034	18041	25 %	50 %	0 %	25 %	67458411
40	NC_007109	AAGC	2	8	19129	19136	50 %	0 %	25 %	25 %	67458412
41	NC_007109	ATTA	2	8	19214	19221	50 %	50 %	0 %	0 %	67458412
42	NC_007109	AATA	2	8	19258	19265	75 %	25 %	0 %	0 %	67458412
43	NC_007109	TAAA	2	8	19491	19498	75 %	25 %	0 %	0 %	67458412
44	NC_007109	ATAA	2	8	19833	19840	75 %	25 %	0 %	0 %	67458413
45	NC_007109	TAAA	2	8	19855	19862	75 %	25 %	0 %	0 %	67458413
46	NC_007109	AGCA	2	8	19995	20002	50 %	0 %	25 %	25 %	67458413
47	NC_007109	TTAT	2	8	20730	20737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007109	ACAG	2	8	21543	21550	50 %	0 %	25 %	25 %	67458414
49	NC_007109	AGAA	2	8	23677	23684	75 %	0 %	25 %	0 %	67458414
50	NC_007109	AGCA	2	8	23828	23835	50 %	0 %	25 %	25 %	67458414
51	NC_007109	AGCA	2	8	24044	24051	50 %	0 %	25 %	25 %	67458414
52	NC_007109	AGAA	2	8	24824	24831	75 %	0 %	25 %	0 %	67458414
53	NC_007109	TTCA	2	8	25211	25218	25 %	50 %	0 %	25 %	67458414
54	NC_007109	AATA	2	8	25704	25711	75 %	25 %	0 %	0 %	67458414
55	NC_007109	TAAA	2	8	25850	25857	75 %	25 %	0 %	0 %	67458414
56	NC_007109	TTTA	2	8	26301	26308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007109	TTTA	2	8	26693	26700	25 %	75 %	0 %	0 %	67458415
58	NC_007109	AGCA	2	8	26995	27002	50 %	0 %	25 %	25 %	67458416
59	NC_007109	ATTA	2	8	27048	27055	50 %	50 %	0 %	0 %	67458416
60	NC_007109	TTAT	2	8	27257	27264	25 %	75 %	0 %	0 %	67458416
61	NC_007109	TAAA	2	8	27370	27377	75 %	25 %	0 %	0 %	67458416
62	NC_007109	AAGT	2	8	28057	28064	50 %	25 %	25 %	0 %	67458416
63	NC_007109	CAGT	2	8	28228	28235	25 %	25 %	25 %	25 %	67458417
64	NC_007109	TTTA	2	8	28317	28324	25 %	75 %	0 %	0 %	67458417
65	NC_007109	AGAA	2	8	28402	28409	75 %	0 %	25 %	0 %	67458417
66	NC_007109	TAAT	2	8	28519	28526	50 %	50 %	0 %	0 %	67458417
67	NC_007109	AAAT	2	8	28760	28767	75 %	25 %	0 %	0 %	67458417
68	NC_007109	ATTA	2	8	28788	28795	50 %	50 %	0 %	0 %	67458417
69	NC_007109	AAAT	2	8	29075	29082	75 %	25 %	0 %	0 %	67458418
70	NC_007109	ATTT	2	8	29143	29150	25 %	75 %	0 %	0 %	67458418
71	NC_007109	TAAA	2	8	30280	30287	75 %	25 %	0 %	0 %	67458418
72	NC_007109	GATA	2	8	30369	30376	50 %	25 %	25 %	0 %	67458418
73	NC_007109	AACA	2	8	30527	30534	75 %	0 %	0 %	25 %	67458418
74	NC_007109	GCGA	2	8	31180	31187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007109	CTAT	2	8	31511	31518	25 %	50 %	0 %	25 %	67458420
76	NC_007109	ATTT	2	8	31554	31561	25 %	75 %	0 %	0 %	67458420
77	NC_007109	TGTC	2	8	31618	31625	0 %	50 %	25 %	25 %	67458420
78	NC_007109	ATAC	2	8	32256	32263	50 %	25 %	0 %	25 %	67458422
79	NC_007109	AAAC	2	8	32682	32689	75 %	0 %	0 %	25 %	67458422
80	NC_007109	ACTT	2	8	32775	32782	25 %	50 %	0 %	25 %	67458422
81	NC_007109	TATT	2	8	33311	33318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007109	CTAT	2	8	33486	33493	25 %	50 %	0 %	25 %	67458424
83	NC_007109	TATT	2	8	33678	33685	25 %	75 %	0 %	0 %	67458424
84	NC_007109	ATTT	2	8	34109	34116	25 %	75 %	0 %	0 %	67458424
85	NC_007109	AATT	2	8	35225	35232	50 %	50 %	0 %	0 %	67458426
86	NC_007109	TACC	2	8	35315	35322	25 %	25 %	0 %	50 %	67458426
87	NC_007109	AATG	2	8	35481	35488	50 %	25 %	25 %	0 %	67458426
88	NC_007109	GTTA	2	8	35697	35704	25 %	50 %	25 %	0 %	67458426
89	NC_007109	ATAC	2	8	36038	36045	50 %	25 %	0 %	25 %	67458426
90	NC_007109	CCAG	2	8	36231	36238	25 %	0 %	25 %	50 %	67458426
91	NC_007109	TAAA	2	8	36709	36716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007109	TTAG	2	8	37084	37091	25 %	50 %	25 %	0 %	67458427
93	NC_007109	TTGC	2	8	37379	37386	0 %	50 %	25 %	25 %	67458427
94	NC_007109	ACTA	2	8	37533	37540	50 %	25 %	0 %	25 %	67458427
95	NC_007109	CCTG	2	8	37839	37846	0 %	25 %	25 %	50 %	67458427
96	NC_007109	TTTA	2	8	38832	38839	25 %	75 %	0 %	0 %	67458429
97	NC_007109	TATT	2	8	38940	38947	25 %	75 %	0 %	0 %	67458429
98	NC_007109	GTAA	2	8	38951	38958	50 %	25 %	25 %	0 %	67458429
99	NC_007109	ATAA	2	8	41049	41056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007109	AACA	2	8	41144	41151	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007109	CTGA	2	8	43109	43116	25 %	25 %	25 %	25 %	67458433
102	NC_007109	ATTG	2	8	43285	43292	25 %	50 %	25 %	0 %	67458433
103	NC_007109	GAAT	2	8	43366	43373	50 %	25 %	25 %	0 %	67458433
104	NC_007109	TAAA	2	8	43446	43453	75 %	25 %	0 %	0 %	67458433
105	NC_007109	AATT	2	8	43473	43480	50 %	50 %	0 %	0 %	67458433
106	NC_007109	ATTT	2	8	43551	43558	25 %	75 %	0 %	0 %	67458433
107	NC_007109	ATTA	2	8	44535	44542	50 %	50 %	0 %	0 %	67458434
108	NC_007109	GTGG	2	8	44732	44739	0 %	25 %	75 %	0 %	67458434
109	NC_007109	ATTA	2	8	44913	44920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007109	AAAT	2	8	45032	45039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007109	GAAA	2	8	45243	45250	75 %	0 %	25 %	0 %	67458435
112	NC_007109	ATTT	2	8	45287	45294	25 %	75 %	0 %	0 %	67458435
113	NC_007109	AAAC	2	8	45552	45559	75 %	0 %	0 %	25 %	67458435
114	NC_007109	AAAT	2	8	45758	45765	75 %	25 %	0 %	0 %	67458436
115	NC_007109	AACC	2	8	45783	45790	50 %	0 %	0 %	50 %	67458436
116	NC_007109	ATAA	2	8	46234	46241	75 %	25 %	0 %	0 %	67458436
117	NC_007109	AAGA	2	8	46376	46383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007109	CAAA	2	8	46898	46905	75 %	0 %	0 %	25 %	67458437
119	NC_007109	ATCC	2	8	47254	47261	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007109	TAAT	3	12	47319	47330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007109	ATTA	3	12	47354	47365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007109	AAAT	2	8	47377	47384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007109	TAAT	2	8	47687	47694	50 %	50 %	0 %	0 %	67458438
124	NC_007109	GCAG	2	8	47887	47894	25 %	0 %	50 %	25 %	67458438
125	NC_007109	ATTA	2	8	47979	47986	50 %	50 %	0 %	0 %	67458438
126	NC_007109	GAAA	2	8	48446	48453	75 %	0 %	25 %	0 %	67458438
127	NC_007109	CAAA	2	8	48462	48469	75 %	0 %	0 %	25 %	67458438
128	NC_007109	ATAC	2	8	48577	48584	50 %	25 %	0 %	25 %	67458438
129	NC_007109	TAAA	2	8	48718	48725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007109	CAAT	2	8	49609	49616	50 %	25 %	0 %	25 %	67458439
131	NC_007109	AAGA	2	8	50331	50338	75 %	0 %	25 %	0 %	67458439
132	NC_007109	ATGT	2	8	50532	50539	25 %	50 %	25 %	0 %	67458439
133	NC_007109	ATTT	2	8	50691	50698	25 %	75 %	0 %	0 %	67458440
134	NC_007109	TTAC	2	8	50770	50777	25 %	50 %	0 %	25 %	67458440
135	NC_007109	AAAG	2	8	53840	53847	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007109	TTTA	2	8	53884	53891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007109	TGAG	2	8	54353	54360	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007109	CGAC	2	8	54809	54816	25 %	0 %	25 %	50 %	67458445
139	NC_007109	TTCC	2	8	54963	54970	0 %	50 %	0 %	50 %	67458445
140	NC_007109	AAAT	2	8	55741	55748	75 %	25 %	0 %	0 %	67458445
141	NC_007109	AAAT	2	8	55913	55920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007109	ATTA	2	8	56132	56139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007109	ATCA	2	8	56865	56872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007109	TAGC	2	8	57288	57295	25 %	25 %	25 %	25 %	67458447
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