MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus cereus E33L plasmid pE33L54

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007105	ACTAA	2	10	1460	1469	60 %	20 %	0 %	20 %	67078328
2	NC_007105	TGAAA	2	10	2816	2825	60 %	20 %	20 %	0 %	67078330
3	NC_007105	ATATT	2	10	5603	5612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007105	CAATC	2	10	6223	6232	40 %	20 %	0 %	40 %	67078334
5	NC_007105	CCCTT	2	10	6897	6906	0 %	40 %	0 %	60 %	67078335
6	NC_007105	AGCAC	2	10	6941	6950	40 %	0 %	20 %	40 %	67078335
7	NC_007105	CTGCC	2	10	7068	7077	0 %	20 %	20 %	60 %	67078335
8	NC_007105	ATTTG	2	10	8807	8816	20 %	60 %	20 %	0 %	67078338
9	NC_007105	CCCAA	2	10	8866	8875	40 %	0 %	0 %	60 %	67078338
10	NC_007105	ACCTT	2	10	9439	9448	20 %	40 %	0 %	40 %	67078339
11	NC_007105	ATTTC	2	10	9988	9997	20 %	60 %	0 %	20 %	67078339
12	NC_007105	TTTTC	2	10	10064	10073	0 %	80 %	0 %	20 %	67078339
13	NC_007105	ATGTT	2	10	10255	10264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007105	TACCT	2	10	11759	11768	20 %	40 %	0 %	40 %	67078342
15	NC_007105	AAGAT	2	10	13066	13075	60 %	20 %	20 %	0 %	67078344
16	NC_007105	ATCTT	2	10	13087	13096	20 %	60 %	0 %	20 %	67078344
17	NC_007105	TTATA	2	10	13187	13196	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007105	TATTT	2	10	13978	13987	20 %	80 %	0 %	0 %	67078346
19	NC_007105	GAAAT	2	10	15014	15023	60 %	20 %	20 %	0 %	67078346
20	NC_007105	ATTGA	2	10	18513	18522	40 %	40 %	20 %	0 %	67078350
21	NC_007105	TTGTT	2	10	18872	18881	0 %	80 %	20 %	0 %	67078350
22	NC_007105	CCATC	2	10	20664	20673	20 %	20 %	0 %	60 %	67078353
23	NC_007105	TTAAA	2	10	22227	22236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007105	AAAAT	2	10	24752	24761	80 %	20 %	0 %	0 %	67078357
25	NC_007105	CAAAA	2	10	25231	25240	80 %	0 %	0 %	20 %	67078358
26	NC_007105	ACACA	2	10	25364	25373	60 %	0 %	0 %	40 %	67078358
27	NC_007105	ATTTT	2	10	26151	26160	20 %	80 %	0 %	0 %	67078359
28	NC_007105	TATAT	2	10	26494	26503	40 %	60 %	0 %	0 %	67078359
29	NC_007105	GAAAT	2	10	26631	26640	60 %	20 %	20 %	0 %	67078359
30	NC_007105	AACAA	2	10	27200	27209	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007105	ATTTC	2	10	27328	27337	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007105	CATAT	2	10	29426	29435	40 %	40 %	0 %	20 %	67078361
33	NC_007105	AAAAT	2	10	29542	29551	80 %	20 %	0 %	0 %	67078361
34	NC_007105	TGAAG	2	10	29867	29876	40 %	20 %	40 %	0 %	67078362
35	NC_007105	TAGTA	2	10	32110	32119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007105	TTTAC	2	10	33475	33484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007105	ATTTA	2	10	35786	35795	40 %	60 %	0 %	0 %	67078365
38	NC_007105	AAATT	2	10	38480	38489	60 %	40 %	0 %	0 %	67078367
39	NC_007105	CATAT	2	10	41749	41758	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007105	TAATA	2	10	42735	42744	60 %	40 %	0 %	0 %	67078369
41	NC_007105	AACCC	2	10	43183	43192	40 %	0 %	0 %	60 %	67078370
42	NC_007105	AAGGT	2	10	44694	44703	40 %	20 %	40 %	0 %	67078371
43	NC_007105	TTTTC	2	10	45508	45517	0 %	80 %	0 %	20 %	67078372
44	NC_007105	AGCGA	2	10	47577	47586	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007105	TTTTA	2	10	48448	48457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007105	TTATG	2	10	48496	48505	20 %	60 %	20 %	0 %	67078375
47	NC_007105	TGATT	2	10	49381	49390	20 %	60 %	20 %	0 %	67078376
48	NC_007105	TTTAG	2	10	49622	49631	20 %	60 %	20 %	0 %	67078377
49	NC_007105	TCAGT	2	10	49776	49785	20 %	40 %	20 %	20 %	67078377
50	NC_007105	ATGAA	2	10	50118	50127	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007105	TCTTT	2	10	51704	51713	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007105	TTTTG	2	10	53202	53211	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007105	TGTTT	2	10	53264	53273	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.