MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. 8004 chromosome

Total Repeats: 76985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007086	TTG	2	6	175	180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66766353
2	NC_007086	CGG	2	6	322	327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766353
3	NC_007086	GCA	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766353
4	NC_007086	CTG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766353
5	NC_007086	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766353
6	NC_007086	CGG	2	6	547	552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766353
7	NC_007086	TTC	2	6	582	587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66766353
8	NC_007086	GAT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766353
9	NC_007086	GCT	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766353
10	NC_007086	CGA	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766353
11	NC_007086	GGA	2	6	707	712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66766353
12	NC_007086	GCC	2	6	745	750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766353
13	NC_007086	ATC	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766353
14	NC_007086	CCG	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766353
15	NC_007086	GCG	2	6	873	878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766353
16	NC_007086	GCG	2	6	904	909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766353
17	NC_007086	CGA	2	6	920	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766353
18	NC_007086	AAG	2	6	945	950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766353
19	NC_007086	TGG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766353
20	NC_007086	AGA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766353
21	NC_007086	ACT	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766353
22	NC_007086	TGC	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766353
23	NC_007086	GGT	2	6	1693	1698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766354
24	NC_007086	GTC	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
25	NC_007086	AAC	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66766354
26	NC_007086	CAG	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766354
27	NC_007086	TTA	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66766354
28	NC_007086	CTG	2	6	2114	2119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
29	NC_007086	CTG	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
30	NC_007086	ATC	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766354
31	NC_007086	GCT	2	6	2251	2256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
32	NC_007086	CTG	2	6	2261	2266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
33	NC_007086	GGC	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766354
34	NC_007086	GCG	2	6	2325	2330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766354
35	NC_007086	GCG	2	6	2453	2458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766354
36	NC_007086	GAA	2	6	2543	2548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766354
37	NC_007086	GAT	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766354
38	NC_007086	CTG	2	6	2615	2620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
39	NC_007086	CGA	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766354
40	NC_007086	TCG	2	6	2678	2683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
41	NC_007086	AGC	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766354
42	NC_007086	CGT	2	6	2722	2727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766354
43	NC_007086	TCG	2	6	3665	3670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766355
44	NC_007086	GCC	2	6	3928	3933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766355
45	NC_007086	GGT	2	6	3983	3988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766355
46	NC_007086	GGC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766355
47	NC_007086	CGG	2	6	4038	4043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766355
48	NC_007086	GCC	2	6	4321	4326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766355
49	NC_007086	CTG	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766355
50	NC_007086	GTT	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66766355
51	NC_007086	GGA	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66766355
52	NC_007086	CAT	2	6	4541	4546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766355
53	NC_007086	GAT	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766355
54	NC_007086	TCA	3	9	4580	4588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766355
55	NC_007086	CGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
56	NC_007086	TGC	2	6	4917	4922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
57	NC_007086	ACG	2	6	4974	4979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
58	NC_007086	CAC	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766356
59	NC_007086	GGT	2	6	5008	5013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766356
60	NC_007086	CGA	2	6	5026	5031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
61	NC_007086	GAA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766356
62	NC_007086	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
63	NC_007086	CGG	2	6	5182	5187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
64	NC_007086	CGA	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
65	NC_007086	CGG	2	6	5218	5223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
66	NC_007086	GGT	2	6	5245	5250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766356
67	NC_007086	CAG	2	6	5306	5311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
68	NC_007086	AGC	2	6	5346	5351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
69	NC_007086	CAC	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766356
70	NC_007086	CGG	2	6	5394	5399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
71	NC_007086	CGA	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
72	NC_007086	GCG	2	6	5505	5510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
73	NC_007086	CGA	2	6	5521	5526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
74	NC_007086	GGC	2	6	5540	5545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
75	NC_007086	GTG	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766356
76	NC_007086	GGC	2	6	5714	5719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
77	NC_007086	CGA	2	6	5818	5823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
78	NC_007086	CGG	2	6	5922	5927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
79	NC_007086	TCG	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
80	NC_007086	GCC	2	6	6014	6019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
81	NC_007086	GCC	2	6	6032	6037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
82	NC_007086	CGC	2	6	6059	6064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
83	NC_007086	TCG	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
84	NC_007086	TGC	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
85	NC_007086	CGA	2	6	6322	6327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
86	NC_007086	ACC	2	6	6351	6356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66766356
87	NC_007086	CAT	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66766356
88	NC_007086	TGA	2	6	6366	6371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66766356
89	NC_007086	GCT	3	9	6406	6414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
90	NC_007086	TTC	2	6	6419	6424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66766356
91	NC_007086	GCC	2	6	6475	6480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
92	NC_007086	GAC	2	6	6524	6529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
93	NC_007086	CAG	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
94	NC_007086	CGA	2	6	6592	6597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766356
95	NC_007086	GCC	2	6	6598	6603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
96	NC_007086	CTG	3	9	6629	6637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
97	NC_007086	AGG	2	6	6654	6659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66766356
98	NC_007086	GCC	2	6	6718	6723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
99	NC_007086	GTG	2	6	6731	6736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766356
100	NC_007086	GCC	3	9	6854	6862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
101	NC_007086	TGC	2	6	6909	6914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
102	NC_007086	GTG	2	6	6933	6938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766356
103	NC_007086	CAA	2	6	7012	7017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66766356
104	NC_007086	GCT	2	6	7057	7062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
105	NC_007086	GAA	2	6	7064	7069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766356
106	NC_007086	GCC	2	6	7080	7085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766356
107	NC_007086	CTG	2	6	7166	7171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766356
108	NC_007086	GGC	2	6	7195	7200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766356
109	NC_007086	TGG	2	6	7233	7238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766356
110	NC_007086	TTC	2	6	7375	7380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66766357
111	NC_007086	CCG	2	6	7429	7434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766357
112	NC_007086	CTG	2	6	7455	7460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766357
113	NC_007086	TGC	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766357
114	NC_007086	GCA	2	6	7522	7527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766357
115	NC_007086	GGC	2	6	7557	7562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766357
116	NC_007086	GCC	2	6	7587	7592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766357
117	NC_007086	GCT	2	6	7619	7624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766357
118	NC_007086	CGG	2	6	7651	7656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766357
119	NC_007086	TGC	2	6	7657	7662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766357
120	NC_007086	GCC	2	6	7758	7763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66766357
121	NC_007086	GAA	2	6	7848	7853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766357
122	NC_007086	GAA	2	6	7914	7919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66766357
123	NC_007086	CTG	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766357
124	NC_007086	GTT	2	6	7937	7942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66766357
125	NC_007086	CTG	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66766357
126	NC_007086	GGC	2	6	7963	7968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766357
127	NC_007086	GTG	2	6	7980	7985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66766357
128	NC_007086	CAG	2	6	7988	7993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66766357
129	NC_007086	CGG	2	6	8075	8080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766357
130	NC_007086	GCG	2	6	8088	8093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66766357
131	NC_007086	CAA	2	6	8153	8158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66766357
132	NC_007086	GTT	2	6	8275	8280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66766358
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