MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pKNR01

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006969	GGC	2	6	480	485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226315873
2	NC_006969	AAG	2	6	490	495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226315873
3	NC_006969	TCC	2	6	509	514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226315873
4	NC_006969	GGT	2	6	594	599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226315873
5	NC_006969	CGT	2	6	618	623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226315873
6	NC_006969	CGG	2	6	626	631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226315873
7	NC_006969	CTT	2	6	1032	1037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62739042
8	NC_006969	GCG	2	6	1038	1043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62739042
9	NC_006969	CGA	2	6	1082	1087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62739042
10	NC_006969	GCA	2	6	1168	1173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62739042
11	NC_006969	CTG	3	9	1192	1200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62739043
12	NC_006969	CTT	2	6	1223	1228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62739043
13	NC_006969	TTC	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62739043
14	NC_006969	GCT	3	9	1280	1288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62739043
15	NC_006969	CGG	3	9	1324	1332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62739043
16	NC_006969	CGT	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62739043
17	NC_006969	GCC	2	6	1462	1467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62739043
18	NC_006969	CGT	2	6	1664	1669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62739043
19	NC_006969	GCT	2	6	1699	1704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62739043
20	NC_006969	ACC	2	6	1728	1733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62739043
21	NC_006969	AGC	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62739043
22	NC_006969	CAC	2	6	1824	1829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62739043
23	NC_006969	TCA	2	6	1861	1866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62739043
24	NC_006969	GTC	3	9	1913	1921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62739043
25	NC_006969	GCG	2	6	1973	1978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62739043
26	NC_006969	CAG	2	6	2080	2085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62739043
27	NC_006969	GAC	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226315874
28	NC_006969	GTG	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226315874
29	NC_006969	GGA	2	6	3373	3378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226315874
30	NC_006969	CGC	2	6	3380	3385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226315874
31	NC_006969	TCG	2	6	3402	3407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226315874
32	NC_006969	GGT	2	6	3445	3450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226315874
33	NC_006969	ACG	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226315874
34	NC_006969	CGA	3	9	3493	3501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226315874
35	NC_006969	TGC	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226315874
36	NC_006969	CAC	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226315874
37	NC_006969	CGG	2	6	3769	3774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226315874
38	NC_006969	CGG	2	6	3824	3829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226315874
39	NC_006969	ATG	2	6	3936	3941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226315875
40	NC_006969	GCC	2	6	3991	3996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226315875
41	NC_006969	GCC	2	6	4017	4022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226315875
42	NC_006969	CGT	2	6	4043	4048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226315875
43	NC_006969	ACG	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226315875
44	NC_006969	CCG	2	6	4087	4092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226315875

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.