MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006958	GAAATT	2	12	2108	2119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006958	CAGCGC	2	12	20164	20175	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006958	GGTCTT	2	12	24772	24783	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_006958	TCGCTT	2	12	50809	50820	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006958	TTGTGG	2	12	81161	81172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006958	TTGAGT	2	12	144647	144658	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006958	AAATAC	2	12	153003	153014	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_006958	GGGGTG	2	12	192349	192360	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006958	CACTGG	2	12	223744	223755	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006958	TTTCTG	2	12	346573	346584	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_006958	TTCAAT	2	12	371784	371795	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_006958	ATCACC	2	12	392226	392237	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006958	TGGGTT	2	12	511050	511061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006958	ACTTCA	2	12	532763	532774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006958	GTAAAC	2	12	555156	555167	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_006958	CTGTTT	2	12	580895	580906	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_006958	TTTCAT	2	12	629062	629073	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_006958	CTGGTT	2	12	646581	646592	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_006958	GAAAAA	2	12	667869	667880	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006958	TGGTCG	2	12	729871	729882	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_006958	AGTCAA	2	12	786077	786088	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_006958	ATTTTC	2	12	790100	790111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_006958	CTTACG	2	12	806867	806878	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006958	CTAGAC	2	12	807500	807511	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006958	TCTGAA	2	12	849953	849964	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_006958	CTTTTT	2	12	856982	856993	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_006958	TTGTGG	2	12	862102	862113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006958	TTTAAG	2	12	882881	882892	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006958	TTCACA	2	12	882956	882967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006958	TAACAA	2	12	886910	886921	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_006958	TTGCTT	2	12	898822	898833	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_006958	GTGTGC	2	12	959037	959048	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_006958	CCGGGC	2	12	986252	986263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_006958	GAAAAC	2	12	1019664	1019675	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_006958	AGTTCA	2	12	1089093	1089104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_006958	GACAGG	2	12	1091398	1091409	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_006958	CAAGGA	2	12	1098675	1098686	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_006958	TTTGGG	2	12	1101256	1101267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006958	CACTGC	2	12	1105299	1105310	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006958	AAGGAT	2	12	1211147	1211158	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006958	CCGGAA	2	12	1315758	1315769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006958	TTTGAA	2	12	1345183	1345194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006958	CGGTTT	2	12	1361262	1361273	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_006958	TTATTG	2	12	1369008	1369019	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006958	GGTCTT	2	12	1384083	1384094	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_006958	CAAAAC	2	12	1396055	1396066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006958	GGGGAT	2	12	1424244	1424255	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006958	TTTTCA	2	12	1424323	1424334	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_006958	TTGGGG	2	12	1450563	1450574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006958	TTGTGG	2	12	1485349	1485360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006958	GCAACA	2	12	1486485	1486496	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006958	GTGCAG	2	12	1486740	1486751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_006958	TGGGTA	2	12	1626322	1626333	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006958	AACGAA	2	12	1665824	1665835	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_006958	GTGCTT	2	12	1681745	1681756	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_006958	AGTGTT	2	12	1723232	1723243	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006958	TTGACA	2	12	1811112	1811123	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_006958	CAGCTT	2	12	1828475	1828486	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006958	CCTTTA	2	12	1852532	1852543	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006958	ACCCTT	2	12	1858344	1858355	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_006958	ACTGAA	2	12	1888538	1888549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_006958	CCCTTC	2	12	1934670	1934681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_006958	TAAATT	2	12	1937583	1937594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006958	CATACA	2	12	1941684	1941695	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006958	TGCTCA	2	12	1944495	1944506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006958	TTTTAC	2	12	1956930	1956941	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_006958	GTTATA	2	12	1999210	1999221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006958	CTTTTG	2	12	2016157	2016168	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_006958	TTTTTA	2	12	2056896	2056907	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006958	AAACCA	2	12	2059041	2059052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006958	CGTTTC	2	12	2120097	2120108	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006958	CTTTTT	2	12	2208711	2208722	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_006958	GCCGAT	2	12	2231697	2231708	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006958	CCGGAT	2	12	2246368	2246379	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006958	TCAGCG	2	12	2265722	2265733	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006958	GGATAC	2	12	2281467	2281478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_006958	TTAGCT	2	12	2306299	2306310	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_006958	TTTCGC	2	12	2315939	2315950	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006958	CTAAAG	2	12	2362744	2362755	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_006958	AACTTG	2	12	2380780	2380791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_006958	CCGGGC	2	12	2386925	2386936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006958	GCCTAA	2	12	2388879	2388890	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006958	ACAGTG	2	12	2442341	2442352	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_006958	CAAAAA	2	12	2475581	2475592	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_006958	AAAACG	2	12	2516910	2516921	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_006958	GGGAAA	2	12	2529804	2529815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006958	CACAAA	2	12	2675259	2675270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006958	ACCACA	2	12	2676090	2676101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_006958	CCAACA	2	12	2679041	2679052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_006958	ACCACA	2	12	2684956	2684967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_006958	CCAACA	2	12	2687905	2687916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_006958	GACCCC	2	12	2752097	2752108	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_006958	TATTTT	2	12	2918474	2918485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006958	CCACCT	2	12	2955020	2955031	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_006958	AGTTGC	2	12	2982009	2982020	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_006958	CCCCGT	2	12	3019356	3019367	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_006958	GGTAAT	2	12	3027557	3027568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006958	AACTTA	2	12	3041117	3041128	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_006958	CCGATC	2	12	3100466	3100477	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_006958	CACAAA	2	12	3119151	3119162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006958	ACCACA	2	12	3119978	3119989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_006958	CCAACA	2	12	3122928	3122939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_006958	ACCCTC	2	12	3128527	3128538	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_006958	CGCCGT	2	12	3144448	3144459	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_006958	ATCTGA	2	12	3162585	3162596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.