MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella abortus bv. 1 str. 9-941 chromosome II

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006933	TGGCTA	2	12	114237	114248	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_006933	GATGCC	2	12	144584	144595	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006933	TGCCGG	2	12	144892	144903	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006933	GGGGGC	3	18	155723	155740	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_006933	GCGGTG	2	12	155743	155754	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_006933	GAAAAG	2	12	171461	171472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006933	CTGGAA	2	12	213221	213232	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_006933	TGCTGG	2	12	213417	213428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_006933	GGCAAG	2	12	233444	233455	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_006933	TCGATA	2	12	250808	250819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_006933	AAGGTG	2	12	251481	251492	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006933	TGTCGC	2	12	291085	291096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006933	ATGCCG	2	12	291766	291777	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006933	CCATAA	2	12	325219	325230	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006933	GATATC	2	12	376380	376391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_006933	GCATAT	2	12	414704	414715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_006933	CGACAA	2	12	415886	415897	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_006933	CGGTCA	2	12	416131	416142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006933	CGCTGG	2	12	452403	452414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006933	CAGCGC	2	12	452732	452743	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006933	ATCTTT	2	12	464555	464566	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_006933	TCCTTT	2	12	469514	469525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006933	AAAGGC	2	12	474540	474551	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_006933	GTTGAT	2	12	490091	490102	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006933	AGGAGA	2	12	494324	494335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006933	CCTTTT	2	12	509913	509924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006933	TTGTGA	2	12	531619	531630	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006933	TGCTTT	2	12	546530	546541	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_006933	GGCTGC	2	12	603259	603270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006933	ATATCG	2	12	611714	611725	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_006933	CATACG	2	12	659811	659822	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006933	TTTTGA	2	12	677822	677833	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006933	TAGCTC	2	12	678064	678075	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006933	ATCAAA	2	12	747611	747622	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_006933	AGCAAC	2	12	776991	777002	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006933	CTTGCC	2	12	782918	782929	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006933	AGCGGC	2	12	785024	785035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006933	CCCAAT	2	12	785036	785047	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006933	CAGGCG	2	12	785610	785621	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006933	TTTATT	2	12	791532	791543	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006933	TTGCCA	2	12	798605	798616	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006933	CAAGGC	2	12	848944	848955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006933	TCCTTC	2	12	849414	849425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_006933	CAGCCA	2	12	852701	852712	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006933	GATATC	2	12	852838	852849	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_006933	GCGCCA	2	12	853132	853143	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006933	CGCTGA	2	12	857663	857674	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006933	GCTTCA	2	12	858041	858052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006933	GGCTAT	2	12	858766	858777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_006933	CGGATG	2	12	874500	874511	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_006933	AAAGGC	2	12	875345	875356	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_006933	TGGTCT	2	12	880776	880787	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_006933	GCCCGC	2	12	881205	881216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_006933	CCCGCA	2	12	881559	881570	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_006933	TCGGGA	2	12	949483	949494	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_006933	CGCGTG	2	12	981852	981863	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006933	CCAGAT	2	12	981917	981928	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006933	GGGCAT	2	12	982628	982639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_006933	CGGAAA	2	12	982733	982744	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_006933	CTGGAA	2	12	1008973	1008984	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_006933	CCAATT	2	12	1033179	1033190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006933	CTGCCG	2	12	1065263	1065274	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_006933	AAATCG	2	12	1112764	1112775	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_006933	GCTGAT	2	12	1149600	1149611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_006933	TTCTCG	2	12	1152789	1152800	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006933	GAGGAA	2	12	1162188	1162199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.