MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Brucella abortus bv. 1 str. 9-941 chromosome II

Total Repeats: 830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006933	GCGAA	2	10	288	297	40 %	0 %	40 %	20 %	62316962
2	NC_006933	CATGG	2	10	431	440	20 %	20 %	40 %	20 %	62316962
3	NC_006933	CCGCG	2	10	782	791	0 %	0 %	40 %	60 %	62316962
4	NC_006933	ATTTC	2	10	1583	1592	20 %	60 %	0 %	20 %	62316964
5	NC_006933	GGGAG	2	10	1695	1704	20 %	0 %	80 %	0 %	62316964
6	NC_006933	CTGCC	2	10	2165	2174	0 %	20 %	20 %	60 %	62316966
7	NC_006933	CAAGG	2	10	2499	2508	40 %	0 %	40 %	20 %	62316966
8	NC_006933	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006933	GCCGC	2	10	4432	4441	0 %	0 %	40 %	60 %	62316968
10	NC_006933	ACCGA	2	10	8397	8406	40 %	0 %	20 %	40 %	62316971
11	NC_006933	CGGCG	2	10	11555	11564	0 %	0 %	60 %	40 %	62316974
12	NC_006933	CCCCG	2	10	13734	13743	0 %	0 %	20 %	80 %	62316976
13	NC_006933	GCCGA	2	10	14940	14949	20 %	0 %	40 %	40 %	62316977
14	NC_006933	CATCA	2	10	15386	15395	40 %	20 %	0 %	40 %	62316977
15	NC_006933	CATCG	2	10	18033	18042	20 %	20 %	20 %	40 %	62316980
16	NC_006933	AGGCG	2	10	18759	18768	20 %	0 %	60 %	20 %	62316981
17	NC_006933	GCCAT	2	10	19023	19032	20 %	20 %	20 %	40 %	62316982
18	NC_006933	TGAGG	2	10	19309	19318	20 %	20 %	60 %	0 %	62316982
19	NC_006933	GCTTC	2	10	19391	19400	0 %	40 %	20 %	40 %	62316982
20	NC_006933	AGCGG	2	10	21948	21957	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_006933	TCTCG	2	10	23022	23031	0 %	40 %	20 %	40 %	62316986
22	NC_006933	CGGCC	2	10	23736	23745	0 %	0 %	40 %	60 %	62316986
23	NC_006933	CGGCC	2	10	24224	24233	0 %	0 %	40 %	60 %	62316987
24	NC_006933	ATCCG	2	10	24671	24680	20 %	20 %	20 %	40 %	62316987
25	NC_006933	GGCGA	2	10	25025	25034	20 %	0 %	60 %	20 %	62316988
26	NC_006933	CCTTC	2	10	25786	25795	0 %	40 %	0 %	60 %	62316989
27	NC_006933	ACGGC	2	10	27056	27065	20 %	0 %	40 %	40 %	62316991
28	NC_006933	GCGCA	2	10	28163	28172	20 %	0 %	40 %	40 %	62316992
29	NC_006933	TCGGT	2	10	28380	28389	0 %	40 %	40 %	20 %	62316992
30	NC_006933	CCGCG	2	10	33525	33534	0 %	0 %	40 %	60 %	62316996
31	NC_006933	CTGCC	2	10	35556	35565	0 %	20 %	20 %	60 %	62316996
32	NC_006933	GGCCT	2	10	37295	37304	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_006933	CGGAA	2	10	38585	38594	40 %	0 %	40 %	20 %	62317001
34	NC_006933	ATGAA	2	10	39866	39875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006933	CATGC	2	10	40814	40823	20 %	20 %	20 %	40 %	62317003
36	NC_006933	TTTGT	2	10	41027	41036	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006933	GCGCC	2	10	41559	41568	0 %	0 %	40 %	60 %	62317004
38	NC_006933	CAGCG	2	10	42441	42450	20 %	0 %	40 %	40 %	62317005
39	NC_006933	CGCTC	2	10	43236	43245	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_006933	CGGCG	2	10	43340	43349	0 %	0 %	60 %	40 %	62317007
41	NC_006933	GCAAA	2	10	43927	43936	60 %	0 %	20 %	20 %	62317008
42	NC_006933	TGAAA	2	10	44092	44101	60 %	20 %	20 %	0 %	62317009
43	NC_006933	TGCGC	2	10	48069	48078	0 %	20 %	40 %	40 %	62317013
44	NC_006933	CCGCT	2	10	50084	50093	0 %	20 %	20 %	60 %	62317013
45	NC_006933	GGTAA	2	10	51415	51424	40 %	20 %	40 %	0 %	62317014
46	NC_006933	CCGGC	2	10	51869	51878	0 %	0 %	40 %	60 %	62317014
47	NC_006933	CGGAA	2	10	52569	52578	40 %	0 %	40 %	20 %	62317014
48	NC_006933	GCCGT	2	10	54864	54873	0 %	20 %	40 %	40 %	62317016
49	NC_006933	CATTC	2	10	55113	55122	20 %	40 %	0 %	40 %	62317016
50	NC_006933	CTTCG	2	10	56991	57000	0 %	40 %	20 %	40 %	62317018
51	NC_006933	TTTGC	2	10	58967	58976	0 %	60 %	20 %	20 %	62317020
52	NC_006933	TGCCC	2	10	60364	60373	0 %	20 %	20 %	60 %	62317021
53	NC_006933	TGCGG	2	10	60602	60611	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_006933	ATGCG	2	10	62305	62314	20 %	20 %	40 %	20 %	62317024
55	NC_006933	ATGTG	2	10	64143	64152	20 %	40 %	40 %	0 %	62317025
56	NC_006933	ATCGC	2	10	68313	68322	20 %	20 %	20 %	40 %	62317029
57	NC_006933	GACGG	2	10	68624	68633	20 %	0 %	60 %	20 %	62317029
58	NC_006933	TATCT	2	10	72855	72864	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_006933	AGGGC	2	10	78192	78201	20 %	0 %	60 %	20 %	62317038
60	NC_006933	AATTC	2	10	78312	78321	40 %	40 %	0 %	20 %	62317038
61	NC_006933	TCGGT	2	10	81516	81525	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_006933	TTCTC	2	10	81545	81554	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_006933	TCTGC	2	10	82900	82909	0 %	40 %	20 %	40 %	62317041
64	NC_006933	AGCCA	2	10	86637	86646	40 %	0 %	20 %	40 %	62317044
65	NC_006933	ACTTG	2	10	87074	87083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_006933	GCCGG	2	10	93241	93250	0 %	0 %	60 %	40 %	62317054
67	NC_006933	TGCGG	2	10	93265	93274	0 %	20 %	60 %	20 %	62317054
68	NC_006933	ATGAA	2	10	93494	93503	60 %	20 %	20 %	0 %	62317054
69	NC_006933	CTTTC	2	10	93863	93872	0 %	60 %	0 %	40 %	62317055
70	NC_006933	GCAAT	2	10	94489	94498	40 %	20 %	20 %	20 %	62317055
71	NC_006933	CTTGC	2	10	94733	94742	0 %	40 %	20 %	40 %	62317056
72	NC_006933	GGAAT	2	10	95003	95012	40 %	20 %	40 %	0 %	62317056
73	NC_006933	GTAAT	2	10	95623	95632	40 %	40 %	20 %	0 %	62317057
74	NC_006933	AAGCG	2	10	95854	95863	40 %	0 %	40 %	20 %	62317057
75	NC_006933	CGGTA	2	10	96940	96949	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_006933	CCAAG	2	10	97115	97124	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_006933	TCGCT	2	10	97460	97469	0 %	40 %	20 %	40 %	62317058
78	NC_006933	ATGGC	2	10	97976	97985	20 %	20 %	40 %	20 %	62317058
79	NC_006933	TTCGC	2	10	99362	99371	0 %	40 %	20 %	40 %	62317059
80	NC_006933	GCTCT	2	10	99475	99484	0 %	40 %	20 %	40 %	62317059
81	NC_006933	ATGAG	2	10	99569	99578	40 %	20 %	40 %	0 %	62317059
82	NC_006933	GTTCC	2	10	99681	99690	0 %	40 %	20 %	40 %	62317059
83	NC_006933	TGCTG	2	10	100289	100298	0 %	40 %	40 %	20 %	62317060
84	NC_006933	ATGAA	2	10	103201	103210	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006933	CCGCT	2	10	103496	103505	0 %	20 %	20 %	60 %	62317063
86	NC_006933	CCGAT	2	10	103649	103658	20 %	20 %	20 %	40 %	62317063
87	NC_006933	TCCTT	2	10	106545	106554	0 %	60 %	0 %	40 %	62317065
88	NC_006933	GGCGA	2	10	107526	107535	20 %	0 %	60 %	20 %	62317066
89	NC_006933	CTTGC	2	10	107773	107782	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_006933	CCTGC	2	10	112447	112456	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_006933	CCGCG	2	10	113082	113091	0 %	0 %	40 %	60 %	62317071
92	NC_006933	CGGTG	2	10	114616	114625	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_006933	GCCCG	2	10	115640	115649	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_006933	GCACA	2	10	116655	116664	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_006933	GTTCG	2	10	116676	116685	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_006933	GAAAA	2	10	118608	118617	80 %	0 %	20 %	0 %	62317074
97	NC_006933	CGATA	2	10	120761	120770	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_006933	GCCCG	2	10	121175	121184	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_006933	CATCG	2	10	124695	124704	20 %	20 %	20 %	40 %	62317079
100	NC_006933	CGCGG	2	10	127417	127426	0 %	0 %	60 %	40 %	62317082
101	NC_006933	AATCA	2	10	128538	128547	60 %	20 %	0 %	20 %	62317084
102	NC_006933	TGGGC	2	10	132230	132239	0 %	20 %	60 %	20 %	62317089
103	NC_006933	CAAGA	2	10	132342	132351	60 %	0 %	20 %	20 %	62317089
104	NC_006933	AGATA	2	10	133958	133967	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006933	TGGGA	2	10	135619	135628	20 %	20 %	60 %	0 %	62317093
106	NC_006933	GGGCA	3	15	140198	140212	20 %	0 %	60 %	20 %	62317098
107	NC_006933	GCCGC	2	10	141064	141073	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
108	NC_006933	CCGCA	2	10	142717	142726	20 %	0 %	20 %	60 %	62317102
109	NC_006933	ATGAA	2	10	143768	143777	60 %	20 %	20 %	0 %	62317103
110	NC_006933	TTGGC	2	10	144598	144607	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_006933	CGCAG	2	10	146229	146238	20 %	0 %	40 %	40 %	62317105
112	NC_006933	CCGGC	2	10	149611	149620	0 %	0 %	40 %	60 %	62317111
113	NC_006933	CGCAT	2	10	149689	149698	20 %	20 %	20 %	40 %	62317111
114	NC_006933	CTATA	2	10	151166	151175	40 %	40 %	0 %	20 %	62317113
115	NC_006933	CCGGG	2	10	151748	151757	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_006933	GCTTT	2	10	152150	152159	0 %	60 %	20 %	20 %	62317114
117	NC_006933	CGCGG	2	10	152229	152238	0 %	0 %	60 %	40 %	62317114
118	NC_006933	ATACG	2	10	161612	161621	40 %	20 %	20 %	20 %	62317120
119	NC_006933	CGGAT	2	10	162354	162363	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_006933	TGGGC	2	10	162485	162494	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_006933	TGTTT	2	10	162938	162947	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006933	CCCGT	2	10	163663	163672	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_006933	AGCGG	2	10	165616	165625	20 %	0 %	60 %	20 %	62317125
124	NC_006933	GCCGC	2	10	168104	168113	0 %	0 %	40 %	60 %	62317128
125	NC_006933	GTGGC	2	10	168420	168429	0 %	20 %	60 %	20 %	62317128
126	NC_006933	GCCTG	2	10	169217	169226	0 %	20 %	40 %	40 %	62317129
127	NC_006933	GGCCG	2	10	172170	172179	0 %	0 %	60 %	40 %	62317131
128	NC_006933	AGGGC	2	10	172603	172612	20 %	0 %	60 %	20 %	62317132
129	NC_006933	GCCCG	2	10	173413	173422	0 %	0 %	40 %	60 %	62317133
130	NC_006933	GTTCG	2	10	175065	175074	0 %	40 %	40 %	20 %	62317134
131	NC_006933	GTCTC	2	10	175100	175109	0 %	40 %	20 %	40 %	62317134
132	NC_006933	GCCGA	2	10	177852	177861	20 %	0 %	40 %	40 %	62317137
133	NC_006933	GCCCC	2	10	177879	177888	0 %	0 %	20 %	80 %	62317137
134	NC_006933	CTTCA	2	10	182544	182553	20 %	40 %	0 %	40 %	62317142
135	NC_006933	TGACC	2	10	182813	182822	20 %	20 %	20 %	40 %	62317142
136	NC_006933	GCCTC	2	10	185081	185090	0 %	20 %	20 %	60 %	62317146
137	NC_006933	GGATA	2	10	190773	190782	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006933	GTGAA	2	10	192979	192988	40 %	20 %	40 %	0 %	62317153
139	NC_006933	GAAGA	2	10	193311	193320	60 %	0 %	40 %	0 %	62317153
140	NC_006933	GCCGC	2	10	193814	193823	0 %	0 %	40 %	60 %	62317153
141	NC_006933	TGACG	2	10	194519	194528	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_006933	GATCA	2	10	195965	195974	40 %	20 %	20 %	20 %	62317155
143	NC_006933	GCGCC	2	10	199929	199938	0 %	0 %	40 %	60 %	62317157
144	NC_006933	GTTCA	2	10	200005	200014	20 %	40 %	20 %	20 %	62317157
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146	NC_006933	CGTGT	2	10	206599	206608	0 %	40 %	40 %	20 %	62317165
147	NC_006933	CGGCA	2	10	207016	207025	20 %	0 %	40 %	40 %	62317165
148	NC_006933	GGCGT	2	10	207803	207812	0 %	20 %	60 %	20 %	62317165
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150	NC_006933	TTTTG	2	10	211900	211909	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006933	ATCAA	2	10	212068	212077	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_006933	TGAAA	2	10	212078	212087	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_006933	TGAAG	2	10	212524	212533	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_006933	TTCGA	2	10	212834	212843	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
155	NC_006933	CGCCT	2	10	213050	213059	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
156	NC_006933	CGGGC	2	10	213492	213501	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
157	NC_006933	GGCCG	2	10	214700	214709	0 %	0 %	60 %	40 %	62317169
158	NC_006933	TAAGT	2	10	217195	217204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_006933	CGCCA	2	10	218701	218710	20 %	0 %	20 %	60 %	62317172
160	NC_006933	GCCCG	2	10	220279	220288	0 %	0 %	40 %	60 %	62317175
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162	NC_006933	CGCAA	2	10	222771	222780	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
163	NC_006933	TGTTT	2	10	224070	224079	0 %	80 %	20 %	0 %	62317177
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165	NC_006933	GCCGT	2	10	225779	225788	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
166	NC_006933	CCAGA	2	10	225808	225817	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
167	NC_006933	ATCGC	2	10	226408	226417	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
168	NC_006933	CGGGG	2	10	227831	227840	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
169	NC_006933	CTCCG	2	10	228515	228524	0 %	20 %	20 %	60 %	62317181
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172	NC_006933	TGCCG	2	10	233096	233105	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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176	NC_006933	CCGTT	2	10	238853	238862	0 %	40 %	20 %	40 %	62317189
177	NC_006933	GCCGA	2	10	239214	239223	20 %	0 %	40 %	40 %	62317189
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181	NC_006933	TTCCA	2	10	241588	241597	20 %	40 %	0 %	40 %	62317191
182	NC_006933	AAGGG	2	10	243507	243516	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_006933	GGCCT	2	10	248112	248121	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
187	NC_006933	TGGTT	2	10	249544	249553	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_006933	GGCAT	2	10	254698	254707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_006933	AGATG	2	10	261650	261659	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_006933	CCGGC	3	15	262835	262849	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
200	NC_006933	GGTCG	2	10	267181	267190	0 %	20 %	60 %	20 %	62317215
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220	NC_006933	TTTGT	2	10	295051	295060	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
221	NC_006933	CGGGC	2	10	295195	295204	0 %	0 %	60 %	40 %	62317240
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240	NC_006933	GAAGC	2	10	315210	315219	40 %	0 %	40 %	20 %	62317258
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243	NC_006933	CTGGA	2	10	318877	318886	20 %	20 %	40 %	20 %	62317259
244	NC_006933	CGCGG	2	10	320618	320627	0 %	0 %	60 %	40 %	62317260
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246	NC_006933	GATCG	2	10	321070	321079	20 %	20 %	40 %	20 %	62317260
247	NC_006933	CATCG	2	10	321617	321626	20 %	20 %	20 %	40 %	62317261
248	NC_006933	TCGGA	2	10	323022	323031	20 %	20 %	40 %	20 %	62317262
249	NC_006933	ATCGC	2	10	326239	326248	20 %	20 %	20 %	40 %	62317265
250	NC_006933	TATCA	2	10	328395	328404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
251	NC_006933	GAATG	2	10	328452	328461	40 %	20 %	40 %	0 %	62317267
252	NC_006933	GCGAC	2	10	329050	329059	20 %	0 %	40 %	40 %	62317267
253	NC_006933	TGTGG	2	10	329089	329098	0 %	40 %	60 %	0 %	62317267
254	NC_006933	AGGCG	2	10	332973	332982	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
255	NC_006933	AAACC	2	10	335361	335370	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
256	NC_006933	GGCGC	2	10	337527	337536	0 %	0 %	60 %	40 %	62317274
257	NC_006933	GGCCG	2	10	338815	338824	0 %	0 %	60 %	40 %	62317276
258	NC_006933	CTTTT	2	10	343309	343318	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
259	NC_006933	CAAGG	2	10	345069	345078	40 %	0 %	40 %	20 %	62317283
260	NC_006933	TGAAG	2	10	345903	345912	40 %	20 %	40 %	0 %	62317283
261	NC_006933	GCCGC	2	10	345955	345964	0 %	0 %	40 %	60 %	62317283
262	NC_006933	GCGCA	2	10	345999	346008	20 %	0 %	40 %	40 %	62317283
263	NC_006933	CTCGC	2	10	347010	347019	0 %	20 %	20 %	60 %	62317284
264	NC_006933	CCGAT	2	10	347446	347455	20 %	20 %	20 %	40 %	62317284
265	NC_006933	AGGTC	2	10	348338	348347	20 %	20 %	40 %	20 %	62317285
266	NC_006933	GCAAA	2	10	348406	348415	60 %	0 %	20 %	20 %	62317285
267	NC_006933	AATTG	2	10	348495	348504	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
268	NC_006933	ACGCG	2	10	349046	349055	20 %	0 %	40 %	40 %	62317286
269	NC_006933	TGCTG	2	10	351995	352004	0 %	40 %	40 %	20 %	62317292
270	NC_006933	TGATC	2	10	354464	354473	20 %	40 %	20 %	20 %	62317294
271	NC_006933	GTTGC	2	10	355604	355613	0 %	40 %	40 %	20 %	62317295
272	NC_006933	CGCCC	2	10	359073	359082	0 %	0 %	20 %	80 %	62317298
273	NC_006933	GGCAC	2	10	361972	361981	20 %	0 %	40 %	40 %	62317302
274	NC_006933	GCAGG	2	10	362722	362731	20 %	0 %	60 %	20 %	62317303
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